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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 5
  • mitochondrion 1
  • cytosol 2
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX96508 Canola mitochondrion, plastid 93.71 93.51
Bra015942.1-P Field mustard plastid 93.5 93.31
CDX73040 Canola plastid 93.29 93.1
Zm00001d020309_P001 Maize cytosol 65.2 86.63
VIT_17s0000g04540.t01 Wine grape plastid 83.65 84.53
KRG94212 Soybean cytosol 28.51 82.93
GSMUA_Achr9P14590_001 Banana plastid 81.76 81.76
TraesCS5B01G195500.1 Wheat plastid 80.92 81.09
TraesCS5A01G188100.1 Wheat plastid 80.92 81.09
TraesCS5D01G202900.1 Wheat plastid 80.71 80.88
PGSC0003DMT400062986 Potato plastid 81.55 79.71
Solyc03g114500.2.1 Tomato plastid 81.55 79.71
HORVU5Hr1G058950.3 Barley plastid 79.66 79.66
EER98819 Sorghum plastid 79.45 79.29
Os09t0375000-01 Rice plastid 79.45 79.12
Zm00001d005674_P001 Maize extracellular, mitochondrion 78.41 78.57
GSMUA_Achr5P05330_001 Banana plastid 79.04 77.89
Solyc10g045050.1.1 Tomato cytosol 17.4 77.57
AT2G36530.1 Thale cress cytosol 59.33 63.74
AT2G29560.1 Thale cress cytosol 47.38 47.58
Protein Annotations
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PO:PO:0025281PRINTS:PR00148ScanProsite:PS00164PANTHER:PTHR11902PANTHER:PTHR11902:SF8UniProt:Q9C9C4
SMART:SM01192SMART:SM01193SUPFAM:SSF51604SUPFAM:SSF54826TIGRFAMs:TIGR01060UniParc:UPI00000AB7FC
Description
ENO1Enolase 1, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C9C4]
Coordinates
chr1:-:27839159..27842132
Molecular Weight (calculated)
51477.4 Da
IEP (calculated)
5.976
GRAVY (calculated)
-0.186
Length
477 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MALTTKPHHL QRSFLSPSRV SGERYLESAP SCLRFRRSGV QCSVVAKECR VKGVKARQII DSRGNPTVEV DLITDDLYRS AVPSGASTGI YEALELRDGD
101: KSVYGGKGVL QAIKNINELV APKLIGVDVR NQADVDALML ELDGTPNKSK LGANAILGVS LSVCRAGAGA KGVPLYKHIQ ETSGTKELVM PVPAFNVING
201: GSHAGNSLAM QEFMILPVGA TSFSEAFQMG SEVYHTLKGI IKTKYGQDAC NVGDEGGFAP NVQDNREGLV LLIDAIEKAG YTGKIKIGMD VAASEFFMKD
301: GRYDLNFKKQ PNDGAHVLSA ESLADLYREF IKDFPIVSIE DPFDQDDWSS WASLQSSVDI QLVGDDLLVT NPKRIAEAIK KQSCNALLLK VNQIGTVTES
401: IQAALDSKAA GWGVMVSHRS GETEDNFIAD LSVGLASGQI KTGAPCRSER LSKYNQLLRI EEELGNVRYA GEAFRSP
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.