Skip to main content
crop-pal logo
Canola
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: nucleus

Predictor Summary:
  • nucleus 3
  • cytosol 1
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY57520 Canola nucleus 42.36 96.59
AT3G02260.1 Thale cress nucleus 89.07 88.68
CDY60464 Canola cytosol 8.31 88.28
KRH45127 Soybean cytosol 42.57 74.67
VIT_14s0083g00960.t01 Wine grape nucleus 67.44 67.61
KRH01413 Soybean endoplasmic reticulum 63.85 63.45
TraesCS5D01G171900.1 Wheat nucleus 55.99 57.33
CDY64902 Canola extracellular 1.73 57.14
HORVU5Hr1G051500.2 Barley nucleus 56.23 56.91
Zm00001d019881_P001 Maize nucleus 55.22 56.8
TraesCS5B01G164500.2 Wheat nucleus, unclear 56.32 56.38
TraesCS5A01G167500.2 Wheat nucleus 56.25 56.3
KXG24895 Sorghum nucleus 55.83 56.03
KRH45126 Soybean nucleus 20.9 49.67
Protein Annotations
MapMan:11.2.4.1.3Gene3D:3.30.60.90GO:A0A078I0Y5UniProt:A0A078I0Y5InterPro:ARM-type_foldEnsemblPlants:CDY43244
ProteinID:CDY43244ProteinID:CDY43244.1ncoils:CoilInterPro:E3_Ub_ligase_UBR4GO:GO:0003674GO:GO:0005488
GO:GO:0005515GO:GO:0008270GO:GO:0046872EnsemblPlantsGene:GSBRNA2T00076274001InterPro:IPR000433InterPro:IPR003126
PFAM:PF00569PFAM:PF13764ScanProsite:PS01357PFscan:PS50135PFscan:PS51157PANTHER:PTHR21725
SMART:SM00291SMART:SM00396SUPFAM:SSF48371SUPFAM:SSF50978SUPFAM:SSF57850UniParc:UPI0004EEA0CA
InterPro:WD40_repeat_dom_sfInterPro:Znf_UBRInterPro:Znf_ZZSEG:seg::
Description
BnaC05g48370DBnaC05g48370D protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A078I0Y5]
Coordinates
chrLK032550:+:57539..74963
Molecular Weight (calculated)
563861.0 Da
IEP (calculated)
5.801
GRAVY (calculated)
-0.132
Length
5076 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MADDLANLCR FLFDETGLTS STSSSDLFSQ RIRSDDSIKR GLRYFYLLLR SGIAPIGGDD DGSSVKLRFA TWSDSQLQAL VSISQAILLL SRSLLVDQVE
0101: PIVLGVIQEV MEFSLSFLEK SNFTQNDLKM EINMEMLLEI ASFDGSEKQY DILPPVSPGE AAELWSMFSP ENDNLELHSL VKCTFQGGRC SNEEKPVDRL
0201: LISLMSECIE SDVQTHSVSK PSFQQDYGNL NPLTRHLAVV HLGCVCRLIM VCKELVQLPS VLDEKTIDHA FLDKLSFCLR ILKLLGRLSK DVQSIENDGT
0301: LLQAVATFTD ALPKLFRVFS DFTTHTSTEG SIESLSLALV EGFLNLVQLI FGKSSLFQNV QACVSASIVN NLDASVWRYD VSSCNLMPPI AYFPRSVMYT
0401: LRLVQDLNRQ TYHIQDLRVL ESEVGCENAN SPADSVYFHL RQEKIPLLRG FTVEDIMRVI FPSSSQWVDN LFHLVYFLHL EGVKLRPKVE RTYSSLRSNS
0501: FAEVESQISH DDEALFGNLF SEDRRSLCSI EPNDHPPVAV SSNLPLQAVK ELLNFLRVCI FCKEWVPSIY EDGCKKLDTC HIDILLNILG SSFEDKASDG
0601: GGCMLQDEGK PGHVAFELLL NFLRGRALSD SLESYLFQKI LAVENGEFEY NDKTLALLAH TLLCRPGLAG AQLRAKAYGG FVSFIADRAR LICAEGSSVK
0701: ELNSCLPSAF HIEILLMAFH LSDEAEKANF SNLIASCLHK VDTPSGICDG PQLSSWAMLI SRLLVLLHHM LLHPNTCPTS LMLDLRSKLR EVRSSGSNLH
0801: VTVDHLSSWA SLVARGITDS WAEEESVNHL MSQMIDFSPH PPTFQIDVSA AKTLNLDYRD LSASLSRILG LWKGKKAGKV EDLIVERYIF ILSWDIARVN
0901: CSLDSQPSLH INYQNVDICS TVDMIYTSHL LVGDSNIVGK NMKFRDILIG VLNQLHAAPE KAVEDLGWDF IREGSWLSLL LYFINGGVWG YCKKNSCSEI
1001: DPFWRECTSI DAKYIATAEG VLSCLMETGD FTELLKMLSS LASKYLQVYR KAFLATFSTW NHHGHSSPSL RLLKHTLFGK SLQAEYAKIG DNSLHLQCIS
1101: YLSKLDALGD GRGSGVLWKV FWEFMVHGFP TSLQTSSAIL LSSILSIRCI VLTIDGLLKL RKSKENFGAD SHVLQQIFNS IMAIKFDQVF QSFHDKCEDI
1201: NQNICAMLEI PDFTELFLMK DMEGFVRDIN AEKIDKSNVL EGVITQIVDV MDSLSKDSSK SDIFKFYLGV DSVSEHTMEF YRLQRGDLSV FIDSLDYCSS
1301: ELVNVKVLNF LVDLLSVAIS PDIRRRIQQK FIDMDLTTLS GWLERTLLGS VVEENDGKKT AKGNSLPLRE AAMNFVNCLV SSANDLQTTE LQNHLFEAIL
1401: ISLETAFISF DSHMAMSYFH FVLQLAKEDS LMKMVLKRTI MLMEKLSADE KLLPGLKFLF GVIGSLLSNR SPSPGTSSCG KSLASNKNTA TGPLIPKLAG
1501: TAKKSETLAL PLDQEGSSIS LECDVTSVDE DEDDGTSDGE VASLDKEDEE DANSERYLAS KVCTFTSSGS NFMEQHWYFC YTCDLTVSKG CCSVCAKVCH
1601: RGHRVVYSRS SRFFCDCGAG GVRGSSCQCL KPRKFSGIGS APALGTNNLQ SFLPLSEDVE QLAESDSDVD EDTFEEENNV VLSIPKETQY KMSLLLEELG
1701: IEDRVLELFS SLLPSITSKR DSGLPRDKQV SLGKDKVLSF DTDLLQLKKA YKSGSLDLKI KADYANSKDL KSLLASGSLA KSLLSVSMRG RLAVGEGDKV
1801: AIFDVGQLIG QATPATINAD KANVKPLSRN IVRFEIVHLS FNSVVENYLA VAGLEDCQIL TLNHRGEVID RLAVELALHG AYIKRIDWVP GSQVQLMVVT
1901: NKFVKIYDLS QDIISPTQYF TLPDDMIVDA TLFVAHRGRV FLLVLSEQGN LYRFELSLGG NAGATPLKEI VQILGKDVAG KGSSVYFSPT YRLLFISYHD
2001: GSSFVGRLSS NATSVTETSA MFEEDSDGKQ SVAGLHRWKE LLGGSGLFIC FSTVKSNAAL AVSLRGDGVC AQNLRHPTGS SSPMVGITAY KPLSKDNVHC
2101: LVLHDDGSLQ IYSLVRNGVD PDSNFSAEKV KRLGSKILNN KTFAGEKPEF PLDFFEKAFC ITADVRLGSD AIRNGDSEGA KQSLGSDDGF IESPSPMGFK
2201: ISVSNPNPDI VMVGIRVHVG TTSASSIPSE VTIFQRSIKM DEGMRCWYDI PFTVAESLLA DEDIVISVGP TTSGTALPRI DSLEVYGRAK DEFGWKEKMD
2301: AVIDMEARVL GHGLLLPGSS KKKALTRSAS IEEQVIADGL KLLSIYYSVC RPRQEVELSE LKCKQLLETI FESDREILLQ TAACRVLQSI FPKKEIYYQV
2401: KDTMRLLGVV KVTSILSSRL GISGTGGSIV EEFSAQMRAV SKIALTRKSN FSVFLEMNGS EVVDNLMQVL WGILDTEPLD TPTMNNIVMS SVELIYSYAE
2501: CLASQGKDTG VHSVAPAVQL LKALILSPNE SVQTSSSLAI SSRLLQVPFP KQTMLTTDEL VDNVTTPPVP SRTAGGNTHV VIEEDSITSS VQYCCDGCST
2601: VPILRRRWHC TVCPDFDLCE ACHEELDADR RPPPHTRDHP MTAIPIDVES LGADTNEIQF SADEGITDLL PAITSSVPQA SAPSIHVLEP GESAEFSAPV
2701: TDPVSISASM RAVNSLILSE FLQELSGWMD TASGVQAIPI MQLFYRLSSA IGGAFMDSSK PEEISLEKLV KWLLAEINLS KPFDASTRSS FGEIVILVFM
2801: FFTLMLRSWH QPGSDGSTSR AGGSTDVHDR RSVQSSTVVT SQSSLDVQVR DDFTSQLLRA CSCLRSQEFV NYLMNILQQL VHVFKSRTAN VEARGSSSGC
2901: GAMLTVRRDL PAGNYSPFFS DSYAKAHRAD LFVDYHRLLL ENVFRLVYTL VRPEKQEKMG EKEKVYRNAS SKDLKLDGFQ DALCSYINNP HTAFVRRYAR
3001: RLFLHLCGSK TQYYSVRDSW QFSNEVKNLY KHVEKSGGFE NNVSYERSVK IVKSLSTIAE VALARPRNWQ KYCLRHGDFL SFLLNGVFHF AEESVIQTLK
3101: LLNLAFYQGK DVSGSVQKAE ASDVLTGSNR SGPQSVDSKK KKKGEDAHDS GLDKSYVDME GVVDIFSAKG GDLLKQFIDF FLLEWNSSSV RTEAKSVIYG
3201: LWHHGRQSFK EILLAALLQK VRDLPVYGQN IVEYTELVCL LLGKAPESNS KQAINELVDR CLNPEVIRCI FETLHSQNEL IANHPNSRIY NTLSNLVEFD
3301: GYYLESEPCV ACSSPDVPYS KMKLESLKSE TKFTDNRIIV KCTGSYTIQS VTMNVNDARK SKSVKVLNLY YNNRPVSDLS ELKNNWSLWK RAKSCHLSFN
3401: QTELKVEFPI PITACNFMIE LDSFYENLQA LSLEPLQCPR CSRPVTDKHG ICSNCHENAY QCRQCRNINY ENLDSFLCNE CGYSKYGRFE FNFMAKPSFI
3501: FDNMENDEDM KRGLAAIESE SENAHRRYQQ LLGFKKPLLK IVSSIGETEM DSQHKDTVQQ MMASLPGPSC NKINRKVALL GVLYGEKCKA AFDSVSKSVQ
3601: TLQGLRRVLM NYLHQKNSNF SSGASRCVVS KTPNNCYGCA TTFVTQCLEI LQMLSKHPRS RKQLVAAGIL SELFENNIHQ GPKTARAQAR AALGTFSEGD
3701: LNAVSELNNL VQKKIMYCLE HHRSMDIALA TREEMLLLSE VCSLTDEFWE SRLRLVFQLL FSSIKLGAKH PAISEHIILP CLKIISVACT PPKPDTTEKE
3801: TMIGKTAPTV QEKDEKAPGI SKSSSETEDN NSDVSQKTLD IQLVSYLEWE KGASYLDFVR RQYKASQSIR GASQKSRTHR SDFLALKYAL RWKRRTSRAS
3901: KGGLQAFELG SWVTELILSA CSQSIRSEMC TLVSLLSAQS SPRRYRLINL LIGLLPATLA AGESSAEYFD LLFKMIETQD SLLFLTVRGC LTTICKLISQ
4001: EVGNIESLER SLQIDISQGF TLHKLLELLG KFLEVPNIRS RFMRDNLLSH VLEALIVIRG LIVQKTKLIN DCNGLLKDLL DGLLLESSEN KRQFIRACVS
4101: GLQTHAVEKK GRTCLFILEQ LCNLICPSKP EAVYMLILNK SHTQEEFIRG SMTKSPYSSA DIGPLMRDVK NKICQQLDLL GLLEDDYGME LLVAGNIISL
4201: DLSVAQVYEL VWKKSNQSST SLTNSALLAS NAAPSRDCPP MTVTYRLQGL DGEATEPMIK ELEEDREESQ DPEIEFAIAG AVREYGGLEI LLDMIKSLRD
4301: DFKSNEEEMV AVLDLLNHCC KIRENRRALL RLGALSLLLE TARRAFSVDA MEPAEGILLI VESLTLEANE SDSISAAQSS LTASNEETGT WEQAKKIVLM
4401: FLERLSHPSG LKKSNKQQRN TEMVARILPY LTYGEPAAME ALIEHFNPYL QNWAEFDQLE QRHEENPKDE SVTQEAVKQR FTVENFVRVS ESLKTSSCGE
4501: RLKDIVLEKG IIAAAVKHIK EIFSVTKQAG YKSSPEWLAA LKLPSVPLIL SMLRGLSMGH LPTQTCIDEG GILPLLHALE GVAGENEIGA RAENLLDTLA
4601: DKEGKGDGFL GEKVCALRDA TKNEMRRRAL KKRQELLKGL GMHQEVSSDG GERIVVSQPI LEGFEDVEEE GDGLACMVCR EGYKLRPTDL LGVYSYSKRV
4701: NLGVGTSGSA RGECVYTTVS YFNIIHFQCH QEAKRADAAL KNPKKEWEGA MLRNNESLCN SLFPVKGPLV PLAQYLRYVD QYWDNLNALG RADGSRLRLL
4801: TYDIVLMLAR FATGASFSAD CRGGGRDSNS RFLPFMFQMA RHLLDQGGPS QRTNMAKSVS SYISSSTSTA TAPSSDSRPI TPGSQLSSTG TEETVQFMMV
4901: NSLLSESYES WLQHRRVFLQ RGIYHTFMQH AHGRAASRAA ESSSAGGKSQ DAETLTGDEL LSIVKPMLVY TGMIEQLQQF FKPKKPAQVE PNKKEGTSSG
5001: VELEPWEIVM KEKLLNVKDM VGFSKELISW LDDINSATDL QEAFDIVGVL ADVLSGGVTQ CDEFVRSAIV AGNGKG
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT3G02260.2 )
(BLAST)
0001: MADDLANLCR FLFDDTAFPS LSSSASSDLF SRRLRSDDSI KRGLRSFYLL LRWGVAPIGG DDADSSGKLR FETWSDSQLQ ALVSISQAIL LLSRSLLVDQ
0101: LEPIVLGVIQ EVMEFSLSFL EKSSFRQNDL KMEINMEILL EIASFDGSEK QYDILPDFSP AEVAELWPAF SGEHDNMDAQ SLVKCTFQGG RCSNEEKPVD
0201: RLLITLMSEC IESDVQAQSV VKSPFQQDCG DLNPFTRHLA VVHLRCVCRL IMVCKELVQL PNMLDEKTVD QAVLDKLSFC LRILKLLGSL SKDVQSIEND
0301: GSLLQAVASF TDAFPKLFRV FFEFTNHTAT EGNIESLSLA LVEGFLNLVQ LIFGKSSVFQ NVQACVAASI VSNLDSSVWR YDGSSCNLTP PLAYFPRSVI
0401: YTLKLIQDLK RQPYHIHDLR VLESEVTYED VSSTVDSVYF HLRQEKIPLL KCFTVEDIMR VIFPSSSQWM DNFFHLVYFL HREGVKLRPK VERTYSSLRS
0501: NSFAEVESQI SHDDEALFGN LFSEGSRSLC SIEPNDQPPV SVSSNLLLQA AKELLNFLRA CILCQEWVPS IYEDGCKKLD TGHIDILLNI VGCSIEDKAS
0601: DGGCMLQDEG RPGHVAFELL LNLLRSRALS DFLESYLFQQ ILVVENSDFN YNDKTLALLA HTLLCRPGLA GAQLRAKIYD GFVSFVTERA RGICAEALSL
0701: KELTACLPSA FHIEILLMAF HLSNEAEKAK FSNLIASCLH KVDTPAGICD GPQLSSWAML ISRLLVLLHH MLLHPNTCPT SLMLDLRSKL REVRSCGSNL
0801: HVTVGDHLSS WASLVARGIT DSWAEDESVS HLMSQMIDFS PHPPTFQNDV STAKTLNLDY GDLSASLCRV LGLWKGKKAG KVEDLLVERY IFMLSSDIAR
0901: INCALDSQPS LHVNYQNVDI SNSVDLISTS HLLVGDINVV GRNIELRNIL IGVLNQLQAA PEQVVEDLGW DYIREGAWLS LLLYFLDGGV WDYCNKNSCS
1001: EIDPFWKECT SVDAKYVAAA EGVVSYLMKT GDIAELLRML SSLVGKYLRV YKKAFLATFS DWNHHGHSSP SLLLLKHTQF GKSLQGEYAK IGDNSLHLQC
1101: IFYLSKLDSL GDGRGSGVLW KVFWEFMVHG FPTSLQTSSA ILLSCILSIR CIVLTINGLL KLGNSKEKFG VDTSVLHQLL DSIMIIKFDQ VFESFHGKCE
1201: EIHQNICAVL QLPDLTELFL MKDMEGFVRD ISAEQIDRSQ VLEGVITKIV DVMDSLSKDS SKSDIFKFYL GVDAVSEHTR EFYELQRGDL SVFIDSLDYC
1301: SLEPVNIKVL NFLVDLLSVA QSPDLRRRVQ QKFIDMDLIS LSGWLERRLL GSFVEEIDGK KTAKGNSLPF REAAMNFINC LVSSTNDLQT RELQNHLFEA
1401: LLISLDTAFL SFDIHMSMSY FHFVLQLARE DNLMKMVLKR TIMLMEKLAA EEKLLPGLKF IFGVIGTLLS NRSPSHGESL CGKSLASYKN TATGPLVPKL
1501: SGTTKKSDTL ALPVDQEGSS ISLECDVTSV DEDEDDGTSD GEVASLDKED EEDANSERYL ASKVCTFTSS GSNFMEQHWY FCYTCDLTVS KGCCSVCAKV
1601: CHRGHRVVYS RSSRFFCDCG AGGVRGSSCQ CLKPRKYNGN GSAPARGTNN FQSFLPLSED ADQLGESDSD VEEDGFGEEN HVVLYIPKET QYKMSLLLEE
1701: LGIEDRVLEL FSSLLPSITS KRDSGLSKEK QVNLGKDKVL SFDTDLLQLK KAYKSGSLDL KIKADYTNSK DLKSLLANGS LVKSLLSVSV RGRLAVGEGD
1801: KVAIFDVGQL IGQATIAPIN ADKANVKPLS RNIVRFEIVH LSFNPVVENY LAVAGLEDCQ ILTLNHRGEV IDRLAVELAL QGAFIRRIDW VPGSQVQLMV
1901: VTNKFVKIYD LSQDSISPTQ YFTLPNDMIV DATLFVASRG RVFLLVLSEQ GNLYRFELSW GGNAGATPLK EIVQIMGKDV TGKGSSVYFS PTYRLLFISY
2001: HDGSSFMGRL SSDATSLTDT SGMFEEESDC KQRVAGLHRW KELLAGSGLF ICFSSVKSNA VLAVSLRGDG VCAQNLRHPT GSSSPMVGIT AYKPLSKDNV
2101: HCLVLHDDGS LQIYSHVRSG VDTDSNFTAE KVKKLGSKIL NNKTYAGAKP EFPLDFFERA FCITADVRLG SDAIRNGDSE GAKQSLASED GFIESPSPVG
2201: FKISVSNPNP DIVMVGIRMH VGTTSASSIP SEVTIFQRSI KMDEGMRCWY DIPFTVAESL LADEDVVISV GPTTSGTALP RIDSLEVYGR AKDEFGWKEK
2301: MDAVLDMEAR VLGHGLLLPG SSKKRALAQS ASMEEQVIAD GLKLLSIYYS VCRPRQEVVL SELKCKQLLE TIFESDRETL LQTTACRVLQ SVFPRKEIYY
2401: QVKDTMRLLG VVKVTSILSS RLGILGTGGS IVEEFNAQMR AVSKVALTRK SNFSVFLEMN GSEVVDNLMQ VLWGILESEP LDTPTMNNVV MSSVELIYSY
2501: AECLASQGKD TGVHSVAPAV QLLKALMLFP NESVQTSSSL AISSRLLQVP FPKQTMLTTD DLVDNVTTPS VPIRTAGGNT HVMIEEDSIT SSVQYCCDGC
2601: STVPILRRRW HCTVCPDFDL CEACYEVLDA DRLPPPHTRD HPMTAIPIEV ESLGADTNEI QFSADEVGIS NMLPVVTSSI PQASTPSIHV LEPGESAEFS
2701: ASLTDPISIS ASKRAVNSLI LSEFLQELSG WMETVSGVQA IPVMQLFYRL SSAIGGAFMD SSKPEEISLD KLIKWLLGEI NLSKPFAAST RSSLGEIVIL
2801: VFMFFTLMLR SWHQPGSDGS SSKLGGSTDV HDRRIVQSST VVATQSSLHV QERDDFASQL VRACSCLRNQ EFVNYLMNIL QQLVHVFKSR AANVEARGSS
2901: SGSGCGAMLT VRRDLPAGNY SPFFSDSYAK AHRADIFVDY HRLLLENVFR LVYTLVRPEK QEKMGEKEKV YRNASSKDLK LDGFQDVLCS YINNPHTAFV
3001: RRYARRLFLH LCGSKTQYYS VRDSWQFSNE VKNLYKHVEK SGGFENNVSY ERSVKIVKSL STIAEVAVAR PRNWQKYCLR HGDFLSFLLN GVFHFAEESV
3101: IQTLKLLNLA FYQGKDVSSS VQKAEATEVV TGSNRSGSQS VDSKKKKKGE DGHDSGLEKL YVDMEGVVDI FSANCGDLLR QFIDFFLLEW NSSSVRTEAK
3201: SVIYGLWHHG RHSFKESLLA ALLQKVRYLP AYGQNIVEYT ELVSLLLDKA PENNSKQAIN ELVDRCLNPD VIRCFFETLH SQNELIANHP NSRIYSTLGN
3301: LVEFDGYYLE SEPCVACSSP DVPYSKMKLE SLKSETKFTD NRIIVKCTGS YTIQSVTMNV HDARKSKSVK VLNLYYNNRP VSDLSELKNN WSLWKRAKSC
3401: HLSFNQTELK VEFPIPITAC NFMIELDSFY ENLQALSLEP LQCPRCSRPV TDKHGICSNC HENAYQCRQC RNINYENLDS FLCNECGYSK YGRFEFNFMA
3501: KPSFIFDNME NDEDMKKGLA AIESESENAH KRYQQLLGFK KPLLKIVSSI GETEMDSQHK DTVQQMMASL PGPSCKINRK IALLGVLYGE KCKAAFDSVS
3601: KSVQTLQGLR RVLMSYLHQK NSNFSSGASR CVVSKTPNNC YGCATTFVTQ CLEILQVLSK HPRSRKQLVA AGILSELFEN NIHQGPKTAR AQARAALSTF
3701: SEGDLSAVNE LNNLVQKKIM YCLEHHRSMD IALATREEML LLSEVCSLTD EFWESRLRLV FQLLFSSIKL GAKHPAISEH IILPCLKIIS VACTPPKPDT
3801: AEKEQTMGKS APAVQEKDEN AAGVIKYSSE SEENNLNVSQ KTRDIQLVSY LEWEKGASYL DFVRRQYKAS QSIRGASQKS RTHRSDFLAL KYTLRWKRRS
3901: SRTSKGGLQA FELGSWVTEL ILSACSQSIR SEMCTLISLL AAQSSPRRYR LINLLIGLLP ATLAAGESSA EYFELLFKMI ETQDALLFLT VRGCLTTICK
4001: LISQEVGNIE SLERSLQIDI SQGFTLHKLL ELLGKFLEVP NIRSRFMRDN LLSHVLEALI VIRGLIVQKT KLINDCNRRL KDLLDGLLLE SSENKRQFIR
4101: ACVSGLQTHA EENKGRTCLF ILEQLCNLIC PSKPEAVYML ILNKSHTQEE FIRGSMTKNP YSSAEIGPLM RDVKNKICQQ LDLLGLLEDD YGMELLVAGN
4201: IISLDLSIAQ VYELVWKKSN QSSTSLTNSA LLASNAAPSR DCPPMTVTYR LQGLDGEATE PMIKELEEDR EESQDPEIEF AIAGAVREYG GLEILLDMIK
4301: SLQDDFKSNQ EEMVAVLDLL NHCCKIRENR RALLRLGALS LLLETARRAF SVDAMEPAEG ILLIVESLTL EANESDSISA AQSALTVSNE ETGTWEQAKK
4401: IVLMFLERLS HPSGLKKSNK QQRNTEMVAR ILPYLTYGEP AAMEALIEHF SPYLQNWSEF DQLQQRHEED PKDDSIAQQA AKQRFTVENF VRVSESLKTS
4501: SCGERLKDIV LENGIIAVAV KHIKEIFAIT GQTGFKSSKE WLLALKLPSV PLILSMLRGL SMGHLPTQTC IDEGGILTLL HALEGVSGEN DIGARAENLL
4601: DTLADKEGKG DGFLGEKVRA LRDATKDEMR RRALRKREEL LQGLGMRQEL SSDGGERIVV SQPILEGFED VEEEEDGLAC MVCREGYKLR PSDLLGVYSY
4701: SKRVNLGVGN SGSARGECVY TTVSYFNIIH FQCHQEAKRA DAALKNPKKE WEGAMLRNNE SLCNSLFPVK GPSVPLAQYL RYVDQYWDNL NALGRADGSR
4801: LRLLTYDIVL MLARFATGAS FSADCRGGGR DSNSRFLPFM FQMARHLLDQ GGPVQRTNMA RSVSSYISSS STSTATAPSS DSRPLTPGSQ LSSTGTEETV
4901: QFMMVNSLLS ESYESWLQHR RVFLQRGIYH TFMQHAHGRV ASRAAEPTSS GGKTQDAETL TGDELLSIVK PMLVYTGMIE QLQQLFKPKK PVHIEPIKKE
5001: GTSSGVELEP WEIVMKEKLL NVKEMIGFSK ELISWLDEIN SATDLQEAFD IVGVLADVLS EGVTQCDQFV RSAIDKD
Arabidopsis Description
BIGAuxin transport protein BIG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9SRU2]
SUBAcon: [nucleus]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.