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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 3
  • mitochondrion 3
  • cytosol 1
  • plasma membrane 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY24494 Canola plastid 95.38 95.23
Bra035422.1-P Field mustard plasma membrane, plastid 94.89 95.2
CDY65725 Canola plasma membrane 37.76 94.05
CDY27294 Canola plastid 80.21 84.32
KRG99203 Soybean extracellular, plasma membrane, vacuole 13.27 82.14
KRG99204 Soybean plasma membrane 61.75 79.43
KRH45809 Soybean plastid 79.06 78.16
Solyc01g011100.2.1 Tomato plasma membrane 63.81 77.01
Os10t0412000-01 Rice plasma membrane 40.15 75.86
Solyc05g006640.2.1 Tomato plasma membrane, plastid 75.35 74.86
KXG38553 Sorghum plasma membrane 75.1 73.29
Zm00001d032980_P001 Maize mitochondrion, plasma membrane 74.86 73.23
Zm00001d014188_P005 Maize mitochondrion 74.86 73.05
TraesCS1D01G135500.2 Wheat cytosol, mitochondrion, plasma membrane, plastid 74.61 72.69
TraesCS1B01G154200.5 Wheat cytosol, mitochondrion, plasma membrane, plastid 74.53 72.61
TraesCS1A01G132600.3 Wheat cytosol, mitochondrion, plasma membrane, plastid 74.53 72.55
HORVU1Hr1G032310.10 Barley mitochondrion 74.44 72.53
GSMUA_Achr8P31870_001 Banana plasma membrane 74.36 71.02
Os10t0412050-00 Rice cytosol, mitochondrion, peroxisome 17.07 68.77
Solyc01g011090.2.1 Tomato plastid 13.52 65.86
CDY33607 Canola plastid 95.38 64.42
Bra017897.1-P Field mustard cytosol, nucleus, plasma membrane, plastid 94.56 62.85
GSMUA_Achr7P17570_001 Banana mitochondrion 76.42 56.87
AT1G17500.1 Thale cress mitochondrion, plasma membrane 43.69 43.59
AT1G13210.1 Thale cress mitochondrion 42.95 43.31
AT3G25610.1 Thale cress mitochondrion 42.29 42.68
AT1G68710.3 Thale cress mitochondrion 43.12 42.66
AT1G26130.3 Thale cress mitochondrion 41.63 42.62
AT3G27870.1 Thale cress mitochondrion, plasma membrane 41.55 42.39
AT1G72700.2 Thale cress mitochondrion, plasma membrane 42.87 42.35
AT3G13900.1 Thale cress mitochondrion, plasma membrane 42.37 41.35
AT1G54280.3 Thale cress mitochondrion 42.21 41.29
AT5G04930.1 Thale cress peroxisome 32.32 33.85
AT5G44240.1 Thale cress plasma membrane 28.94 30.82
VIT_00s0189g00030.t01 Wine grape extracellular, mitochondrion, plasma membrane 74.94 29.55
Protein Annotations
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Description
ALA3Phospholipid-transporting ATPase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WFR7]
Coordinates
chr1:+:22011305..22020386
Molecular Weight (calculated)
137760.0 Da
IEP (calculated)
7.725
GRAVY (calculated)
-0.045
Length
1213 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MVRSGSFSVD SSATHQRTPS RTVTLGHIQP QAPTYRTVYC NDRESNQPVR FKGNSISTTK YNVFTFLPKG LFEQFRRIAN IYFLGISCLS MTPISPVSPI
0101: TNVAPLSMVL LVSLIKEAFE DWKRFQNDMS INNSTVEILQ DQQWVSIPWR KLQVGDIVKI KKDGFFPADI LFMSSTNSDG ICYVETANLD GETNLKIRKA
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0601: FERLANGMDD VRKVTREHLE HFGSSGLRTL CLAYKDLNPE TYDSWNEKFI QAKSALRDRE KKLDEVAELI EKDLILIGST AIEDKLQEGV PTCIETLSRA
0701: GIKIWVLTGD KMETAINIAY ACNLINNEMK QFVISSETDA IREAEERGDQ VEIARVIKEE VKRELKKSLE EAQHSLHTVA GPKLSLVIDG KCLMYALDPS
0801: LRVMLLSLSL NCTSVVCCRV SPLQKAQVTS LVRKGAQKIT LSIGDGANDV SMIQAAHVGI GISGMEGMQA VMASDFAIAQ FRFLTDLLLV HGRWSYLRIC
0901: KVVMYFFYKN LTFTLTQFWF TFRTGFSGQR FYDDWFQSLF NVVFTALPVI VLGLFEKDVS ASLSKRYPEL YREGIRNSFF KWRVVAVWAT SAVYQSLVCY
1001: LFVTTSSFGA VNSSGKVFGL WDVSTMVFTC LVIAVNVRIL LMSNSITRWH YITVGGSILA WLVFAFVYCG IMTPHDRNEN VYFVIYVLMS TFYFYFTLLL
1101: VPIVSLLGDF IFQGVERWFF PYDYQIVQEI HRHESDASKA DQLEVENELT PQEARSYAIS QLPRELSKHT GFAFDSPGYE SFFASQLGIY APQKAWDVAR
1201: RASMRSRPKV PKK
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.