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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
  • cytoskeleton 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra004784.1-P Field mustard cytosol 95.44 96.17
CDY17911 Canola cytosol 95.19 95.92
CDX79801 Canola cytosol 94.94 95.66
CDX83459 Canola cytosol 94.94 94.94
Bra000326.1-P Field mustard cytosol 94.68 94.68
CDY44256 Canola cytosol 94.68 94.68
KRH71277 Soybean nucleus 87.85 88.75
VIT_05s0094g00900.t01 Wine grape cytosol 88.35 87.69
Solyc08g014420.2.1 Tomato cytosol 87.34 87.56
HORVU7Hr1G023760.2 Barley cytosol 81.01 87.19
GSMUA_Achr2P19320_001 Banana cytosol 83.29 86.81
GSMUA_Achr10P... Banana cytosol 83.54 86.39
Solyc12g019460.1.1 Tomato cytosol 86.58 86.36
GSMUA_Achr5P06640_001 Banana cytosol 83.29 86.13
Zm00001d036215_P003 Maize cytosol, extracellular 85.06 84.42
Zm00001d045310_P003 Maize cytosol 84.3 83.67
Os06t0154500-01 Rice plasma membrane 84.3 83.67
EER89222 Sorghum cytosol 85.06 83.58
TraesCS7B01G009200.1 Wheat nucleus 82.78 83.21
TraesCS7D01G106400.1 Wheat cytosol 82.28 82.7
TraesCS7A01G111300.1 Wheat golgi 82.53 82.32
KRH50176 Soybean cytosol, nucleus 87.59 79.91
AT3G45640.1 Thale cress cytosol 68.86 73.51
AT3G59790.1 Thale cress cytosol 69.11 69.47
AT4G01370.1 Thale cress cytosol 64.56 67.82
AT1G01560.2 Thale cress cytosol 62.03 66.4
AT1G07880.2 Thale cress cytosol 60.76 66.12
AT4G11330.1 Thale cress cytosol 62.28 65.43
AT2G46070.3 Thale cress cytosol 58.73 57.14
AT1G10210.2 Thale cress cytosol 51.39 54.86
AT1G59580.1 Thale cress cytosol 50.89 53.46
AT2G18170.1 Thale cress cytosol 49.11 52.72
AT4G36450.1 Thale cress cytosol 47.85 52.35
AT2G01450.1 Thale cress cytosol 41.27 33.54
AT5G19010.1 Thale cress cytosol 44.81 31.22
AT1G18150.2 Thale cress nucleus, plastid 45.06 30.22
AT1G73670.1 Thale cress cytosol 43.54 29.86
AT2G42880.1 Thale cress cytosol 44.3 28.88
AT3G14720.1 Thale cress cytosol 43.29 28.6
AT1G53510.1 Thale cress cytosol 42.78 27.48
AT3G18040.3 Thale cress plastid 43.54 26.54
Protein Annotations
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UniProt:Q39026SMART:SM00220SUPFAM:SSF56112InterPro:Ser/Thr_kinase_ASUniParc:UPI00000014BFSEG:seg
Description
MPK6Mitogen-activated protein kinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178VTX8]
Coordinates
chr2:+:18138246..18140988
Molecular Weight (calculated)
45060.1 Da
IEP (calculated)
5.172
GRAVY (calculated)
-0.282
Length
395 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MDGGSGQPAA DTEMTEAPGG FPAAAPSPQM PGIENIPATL SHGGRFIQYN IFGNIFEVTA KYKPPIMPIG KGAYGIVCSA MNSETNESVA IKKIANAFDN
101: KIDAKRTLRE IKLLRHMDHE NIVAIRDIIP PPLRNAFNDV YIAYELMDTD LHQIIRSNQA LSEEHCQYFL YQILRGLKYI HSANVLHRDL KPSNLLLNAN
201: CDLKICDFGL ARVTSESDFM TEYVVTRWYR APELLLNSSD YTAAIDVWSV GCIFMELMDR KPLFPGRDHV HQLRLLMELI GTPSEEELEF LNENAKRYIR
301: QLPPYPRQSI TDKFPTVHPL AIDLIEKMLT FDPRRRITVL DALAHPYLNS LHDISDEPEC TIPFNFDFEN HALSEEQMKE LIYREALAFN PEYQQ
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.