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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
  • peroxisome 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra002245.1-P Field mustard cytosol 92.84 92.84
Bra020047.1-P Field mustard cytosol 92.84 92.84
CDY42276 Canola cytosol 92.84 92.84
CDX92520 Canola cytosol 92.59 92.59
CDY65959 Canola cytosol 92.59 92.59
CDY44925 Canola cytosol 92.1 92.1
AT1G62800.2 Thale cress cytosol, peroxisome, plastid 75.31 75.31
AT5G11520.1 Thale cress plastid 80.99 73.05
AT2G30970.1 Thale cress mitochondrion 49.63 46.74
AT4G31990.3 Thale cress plastid 51.36 45.02
Protein Annotations
KEGG:00220+2.6.1.1KEGG:00250+2.6.1.1KEGG:00270+2.6.1.1KEGG:00330+2.6.1.1KEGG:00350+2.6.1.1KEGG:00360+2.6.1.1
KEGG:00400+2.6.1.1KEGG:00401+2.6.1.1KEGG:00710+2.6.1.1KEGG:00950+2.6.1.1KEGG:00960+2.6.1.1MapMan:25.1.7
Gene3D:3.40.640.10Gene3D:3.90.1150.10EntrezGene:832075UniProt:A0A178UCN1ProteinID:AED92724.1EMBL:AF296830
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InterPro:IPR015421InterPro:IPR015422InterPro:NHTrfase_class1_PyrdxlP-BSRefSeq:NP_197456.1ProteinID:OAO90984.1UniProt:P46645
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ScanProsite:PS00105PANTHER:PTHR11879PANTHER:PTHR11879:SF33InterPro:PyrdxlP-dep_TrfaseInterPro:PyrdxlP-dep_Trfase_dom1InterPro:PyrdxlP-dep_Trfase_major
UniProt:Q1EBW2SUPFAM:SSF53383EMBL:U15033UniParc:UPI00001250CFEMBL:Z26740:
Description
ASP2Aspartate aminotransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1EBW2]
Coordinates
chr5:+:6597971..6601971
Molecular Weight (calculated)
44269.1 Da
IEP (calculated)
7.322
GRAVY (calculated)
-0.104
Length
405 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MDSVFSNVAR APEDPILGVT VAYNNDPSPV KINLGVGAYR TEEGKPLVLD VVRKAEQQLV NDPSRVKEYI PIVGISDFNK LSAKLILGAD SPAITESRVT
101: TVQCLSGTGS LRVGAEFLKT HYHQSVIYIP KPTWGNHPKV FNLAGLSVEY FRYYDPATRG LDFKGLLEDL GAAPSGAIVL LHACAHNPTG VDPTSEQWEQ
201: IRQLMRSKSL LPFFDSAYQG FASGSLDTDA QSVRTFVADG GECLIAQSYA KNMGLYGERV GALSIVCKSA DVASKVESQV KLVVRPMYSS PPIHGASIVA
301: TILKSSDMYN NWTIELKEMA DRIKSMRQQL FEAIQARGTP GDWSHIIKQI GMFTFTGLNK EQVEFMTKEF HIYMTSDGRI SMAGLSSKTV PHLADAMHAA
401: VTRLG
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.