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Tomato
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: endoplasmic reticulum, nucleus, cytosol

Predictor Summary:
  • plastid 2
  • cytosol 2
  • endoplasmic reticulum 1
  • mitochondrion 1
  • nucleus 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
VIT_03s0063g01740.t01 Wine grape plastid 31.14 66.51
VIT_03s0063g01750.t01 Wine grape cytosol 35.31 66.05
KRH29549 Soybean cytosol, nucleus, plasma membrane 62.03 61.36
CDY54069 Canola cytosol, plastid 41.14 55.45
Bra015251.1-P Field mustard plastid 52.94 54.63
GSMUA_Achr3P30770_001 Banana cytosol, plasma membrane 53.8 53.92
TraesCS4B01G069200.1 Wheat cytosol, mitochondrion 49.37 49.72
HORVU4Hr1G011510.11 Barley cytosol, nucleus, plastid 49.37 49.16
KXG37601 Sorghum nucleus 48.53 48.92
Zm00001d033935_P002 Maize cytosol, mitochondrion, plasma membrane, plastid 47.59 47.92
Solyc01g106840.1.1 Tomato cytosol 0.94 38.89
Os03t0738200-00 Rice cytosol 1.91 31.28
Solyc01g106770.2.1 Tomato nucleus 10.54 15.92
Solyc03g112950.2.1 Tomato cytosol 6.02 14.92
Solyc01g111870.1.1 Tomato cytosol 8.79 11.99
Solyc03g112940.2.1 Tomato cytosol 2.37 5.91
Protein Annotations
KEGG:04150+2.7.11.1KEGG:04151+2.7.11.1KEGG:04714+2.7.11.1KEGG:04926+2.7.11.1KEGG:05165+2.7.11.1Gene3D:1.10.1070.11
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SEG:seg:::::
Description
No Description!
Coordinates
chr1:+:96117028..96138053
Molecular Weight (calculated)
415617.0 Da
IEP (calculated)
5.649
GRAVY (calculated)
-0.069
Length
3719 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MQGLHHQQQQ LAALLTVALP KDDPSKSTST SVTEDDDSSR VAAITSLQRA ILYPPNSLLI THSASFLAQG FSQLLSDKSY SVRQAAATAY GALCSVLCLI
0101: SIAPNGRQNH VILVSLVDRF IGWALPLLST VVDGTTDLAL EGLREFLNIG DVSAVERFAL PILKACQELL EDERTSLSLL RRLLAVLTLI SLKFFRCFQP
0201: HFVDVVDLLL GWAMVPDLAE SDRRVIMDSF LQFQKYWVNN MQFPLGLLSK FLGDMDVLLQ DASPGSSQQF QRLLALLSCF STVLQSTASG LLEMNMLEQI
0301: SEPLCKMVPI LLGCMSMIGK KFGWSKWIDD SWRCLTLLAE ILSARFATYY PIAVDILFQS LVMECKDQSM RMKRLDSFQV HGVLKTNLQL LSLQKLGLSP
0401: SSVHKILQFD APISQLRLHP NHLVPGSSAA TYIFLLQHGN FEVVEKSVIV LLEELDLLRC MLRQKSDLQN LGYDVKILKS YSRSELFALV QFDLAVLLSC
0501: VSLGSGATSM IGQAEIYTLY LNRSGKLISS IIGNFNPFEL PVLGHVELQV TVLKTLERLA AFEFLSKCSL SKQVSATISQ QATPEKLEKV ESGRIELPGL
0601: VLQHLKMYAI LLIRALHVAS PLAVKTVALQ WIHEFCRKVV DIYENEEALY FPYEVLGYAD VVQDLLFSVL DVASDREPKL RSLVALVLQK LLQAKLIHPT
0701: HFIITTQAVL EKLGDPDEGI RNAFVRLLSN VLPITVYACG LRDNGLATAC WPGVLRFNNR SNLHWKQLFA LKQLPQQLHS QQLVTILSYI AQRWKVPLSS
0801: WIQRLICGCG RTKNVALIQP EETSNSSSNG LLWDIKVDED ILERICSVNT LAGAWWAIHE AARYCITTRL RTNLGGPTQT FAALERMLLD VAHVLQLDAD
0901: QSDGNLNIIG SSYAHLLPMR LLLDFVEALK KNVYNAYEGS TVLPGASRQS SLFFRANRKV CEEWFSRISE PMMNAGLALQ CHDATIYYCA LRLQELRSLV
1001: ASAIKDKPRV QLTENIHNVR ARYAADILRV LRHMCLAFCK AHEPEALIGI QNWATVVFSP LFTDENQSLD DSGIIGHFSW ITGLVYQTKG QHEKAAAHFI
1101: HLLQTEDSLT FMGSDGVQFS IARIIESYSA VSDWKSLESW LLELQTLRAK HAGKSYSGAL TIAGNEVNSV QALARFDEGE FQAAWACLDL TPKSSSELTL
1201: DPKLALQRSE QMLLQAMLHQ VEGRPEKVSE ELQKAKGMLM EPLSVLPLDG LVEAASHVNQ LYCISAFEEC YNLNVSLDKH FPSLLSSHMQ VMKSPIIKDC
1301: QDCNIWLKVL RIYQRAYPSS SMTLKLCRNL MSLARKQKNF RLANHLDNYL KDHLSSFPDG GIRDHVTLGL EYERVLLMHA EDKFEDALTS LWSFIRPSMI
1401: SSSFIASDTT DKVLKAKACL KLSNWLQEDY SNSWMKDIIL KIRCDFNTSS GREESSFILD NLTSKENVNA IIEELVGTAT KLSSQLCPTL GKSWISYASW
1501: CYNQARLSLC APCEATLFSC SFSAVLDSEI QPARYKLTEE EVVKVKDIIS KLLASGEVLN EDGESDVFCS GNSESIQSDG TASSLLQEVV DTIEAEAGAP
1601: GVEDYNGEFF PNTLTSKLQQ CLVKANVVLE ETSVKSLVTD LVNIWWSLRR RRVSLFGHAA QAFVNFLSCA SSRSLDGQLT SCSEESKYKS LNYTLRSTLY
1701: VLHILLNYGI ELKDTLEPAL SAVPLLPWQE IIPQLFARLS SHPEQAVRKQ LETLIVKLAK LSPRSVVYPT LVDANSYERE PSEELQKILA CLNELYPKLV
1801: QDVQLMITEL ENVTVLWEEL WLSTLQDLHA DVMRRIILLK EEAARIAENP TLSHGEKNKI NAAKYSAMMA PIVVVLERRF ASTSRKPETP HEIWFHEVYK
1901: EQIKSAIITF KNPPASAVAL GDVWRPFDNV AASLASYQRK SAVSLREVAP QLALLSSSDA PMPGLEKQIM VSESEGGLNT SSSGIVTIAS FCEQVAILST
2001: KTKPKKIIIV GSDGVKYTYL LKGREDLRLD ARIMQLLQAV NNFLHSSSAV QSQSVCVRFY SVTPISGRAG LIQWVDNVVS IYSVFKAWQS RVQLAQLSAL
2101: GANAKQTVPP PVPRPMDMFY GKIIPALKEK GIRRVISRRD WPHEVKRKVL LDLMKEAPKK LLYQELWCAS EGFKAFSSKL KRYSGSVAAM SIIGHVLGLG
2201: DRHLDNILMD FCSGDIVHID YNVCFDKGQR LKIPEIVPFR LTQTIEAALG LTGVEGTFRA NCEAVLGVLK KNKDIILMLL EVFVWDPLVE WTRGDFHDDA
2301: AIFGEERKGM DLAVSLSLFA SRMQEIRIPL QEHHDLLLST LPAVESGLER FINILNQYEV VSGLYRRADQ ERSSLVLRET SAKSLVADAT STSESIRASL
2401: EMQARELAQA QAVVMEKAQE ATTWIEQHGR TLDALRSSSI PDIRACMQLT GKEESLSLVS AVLVAGVPLT VVPEPTQAQC NDIDREVSHL VAELDHGLSS
2501: AISTIQTYSL SLQRILPINY HTSSPVHGWA QVLQLAINTL SSDILSLSRR QAAELIGKAH ADGIDSVKSR YDDLCLKVGQ YAAEIERIEE ECAELVNSIG
2601: PETELRARNS LFSSFKNYME SAGIERKEDA GLHGNFQETK EKVLSVLKAA FSALYNDIKH KILNNLSRFT TRRHTDMILC SDLGTSFSEF EEQVEKCMLV
2701: AKFLNELQQY VRMDYRSIDT VVDTSESLFD SNWTSIFKTC LLSCKNLVSQ MVEVVLPEVI RSVILFNTEI MDVFASLSQI RRSIDTALEQ LIEVELERVS
2801: LAELEQSYFV KVGHITEQQL ALEEAAVKGR DHLSWEEAEE LASQEEACRA QLDKLHQSWN QKDFRFSSLI QKETAIRSSL VSLEQDLQSM ISHEHDEELH
2901: LFRSRALMAA LMQPFSELEA VDQELSLLGA PVESGSTRIS HLKNLFNSGC PLSEYIWKFP GIWSNHAFFV WKVYIVDSFL DSCTQNIALQ ADQSLGFDQL
3001: VNIVKKKLES QLQENVEQYL KEKVVPVLIT RLEKESEYLK QVTESTEDLT CDQGNNNFAA VRNVQIMLEE YCNAHETVRA AKSAASLMKR QVSELKEALF
3101: KTTLEIVQIE WMHDINANIL QKRRLISHKY LPSDARLLPV LLNISRPQLL ENFQSSIAKI DRALDGLQAC EKTSVTAEGQ LERAMNWACG GASSTSAGSA
3201: LARNPGIPQE FHDHLRRRQQ LICEVREKAS DVMKLCISIL KFELSRDGFF QTSEEFYPSR SMADGRTWQQ AYLNALTNLD VTYHSFNHTE QEWKLAQTNM
3301: EAASSALFSA TNELCVASVK AKSASGDMQS TLLAMRDCSY ELSVALSAFG SITRGRTALT SECGSMLEEV LAVTEGVHDV HSIAKEATAL HLSLMEDLSK
3401: ANGILLPLES LLCKDVATMT EAMAKEREAT MEISPVHGQA IFQSYHVKVE KTYEVFKPLV QSLTISVEGL YSMLTRLAQS ASLHAGNLHK ALEGLGESQE
3501: ARSEDLNSYR PDLADQYDSK NEIFSQSDRE SSMDILDVNG LSLQDKGWMS APDSMTSGSS ESAATSSQVS LANSSDGPDL IDPITPYCSD DTERREYSNN
3601: FSSVGNALPG LPQLESEKTQ ETFEMKLSLG NEEPLASKDR VEEAAHETSL INVEAANRTT RGKNSYALSI LRRVEMKLDG RDVADNRAIS VAEQVDYLLK
3701: QATSVDNLCN MYEGWTPWI
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT1G50030.1 )
(BLAST)
0001: MSTSSQSFVA GRPASMASPS QSHRFCGPSA TASGGGSFDT LNRVIADLCS RGNPKEGAPL AFRKHVEEAV RDLSGEASSR FMEQLYDRIA NLIESTDVAE
0101: NMGALRAIDE LTEIGFGENA TKVSRFAGYM RTVFELKRDP EILVLASRVL GHLARAGGAM TSDEVEFQMK TAFDWLRVDR VEYRRFAAVL ILKEMAENAS
0201: TVFNVHVPEF VDAIWVALRD PQLQVRERAV EALRACLRVI EKRETRWRVQ WYYRMFEATQ DGLGRNAPVH SIHGSLLAVG ELLRNTGEFM MSRYREVAEI
0301: VLRYLEHRDR LVRLSITSLL PRIAHFLRDR FVTNYLTICM NHILTVLRIP AERASGFIAL GEMAGALDGE LIHYLPTIMS HLRDAIAPRK GRPLLEAVAC
0401: VGNIAKAMGS TVETHVRDLL DVMFSSSLSS TLVDALDQIT ISIPSLLPTV QDRLLDCISL VLSKSHYSQA KPPVTIVRGS TVGMAPQSSD PSCSAQVQLA
0501: LQTLARFNFK GHDLLEFARE SVVVYLDDED AATRKDAALC CCRLIANSLS GITQFGSSRS TRAGGRRRRL VEEIVEKLLR TAVADADVTV RKSIFVALFG
0601: NQCFDDYLAQ ADSLTAIFAS LNDEDLDVRE YAISVAGRLS EKNPAYVLPA LRRHLIQLLT YLELSADNKC REESAKLLGC LVRNCERLIL PYVAPVQKAL
0701: VARLSEGTGV NANNNIVTGV LVTVGDLARV GGLAMRQYIP ELMPLIVEAL MDGAAVAKRE VAVSTLGQVV QSTGYVVTPY KEYPLLLGLL LKLLKGDLVW
0801: STRREVLKVL GIMGALDPHV HKRNQQSLSG SHGEVPRGTG DSGQPIPSID ELPVELRPSF ATSEDYYSTV AINSLMRILR DASLLSYHKR VVRSLMIIFK
0901: SMGLGCVPYL PKVLPELFHT VRTSDENLKD FITWGLGTLV SIVRQHIRKY LPELLSLVSE LWSSFTLPGP IRPSRGLPVL HLLEHLCLAL NDEFRTYLPV
1001: ILPCFIQVLG DAERFNDYTY VPDILHTLEV FGGTLDEHMH LLLPALIRLF KVDAPVAIRR DAIKTLTRVI PCVQVTGHIS ALVHHLKLVL DGKNDELRKD
1101: AVDALCCLAH ALGEDFTIFI ESIHKLLLKH RLRHKEFEEI HARWRRREPL IVATTATQQL SRRLPVEVIR DPVIENEIDP FEEGTDRNHQ VNDGRLRTAG
1201: EASQRSTKED WEEWMRHFSI ELLKESPSPA LRTCAKLAQL QPFVGRELFA AGFVSCWAQL NESSQKQLVR SLEMAFSSPN IPPEILATLL NLAEFMEHDE
1301: KPLPIDIRLL GALAEKCRVF AKALHYKEME FEGPRSKRMD ANPVAVVEAL IHINNQLHQH EAAVGILTYA QQHLDVQLKE SWYEKLQRWD DALKAYTLKA
1401: SQTTNPHLVL EATLGQMRCL AALARWEELN NLCKEYWSPA EPSARLEMAP MAAQAAWNMG EWDQMAEYVS RLDDGDETKL RGLASPVSSG DGSSNGTFFR
1501: AVLLVRRAKY DEAREYVERA RKCLATELAA LVLESYERAY SNMVRVQQLS ELEEVIEYYT LPVGNTIAEE RRALIRNMWT QRIQGSKRNV EVWQALLAVR
1601: ALVLPPTEDV ETWLKFASLC RKSGRISQAK STLLKLLPFD PEVSPENMQY HGPPQVMLGY LKYQWSLGEE RKRKEAFTKL QILTRELSSV PHSQSDILAS
1701: MVSSKGANVP LLARVNLKLG TWQWALSSGL NDGSIQEIRD AFDKSTCYAP KWAKAWHTWA LFNTAVMSHY ISRGQIASQY VVSAVTGYFY SIACAANAKG
1801: VDDSLQDILR LLTLWFNHGA TADVQTALKT GFSHVNINTW LVVLPQIIAR IHSNNRAVRE LIQSLLIRIG ENHPQALMYP LLVACKSISN LRRAAAQEVV
1901: DKVRQHSGAL VDQAQLVSHE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RLYFGEHNIE GMLKVLEPLH DMLDEGVKKD STTIQERAFI EAYRHELKEA HECCCNYKIT
2001: GKDAELTQAW DLYYHVFKRI DKQLASLTTL DLESVSPELL LCRDLELAVP GTYRADAPVV TISSFSRQLV VITSKQRPRK LTIHGNDGED YAFLLKGHED
2101: LRQDERVMQL FGLVNTLLEN SRKTAEKDLS IQRYSVIPLS PNSGLIGWVP NCDTLHHLIR EHRDARKIIL NQENKHMLSF APDYDNLPLI AKVEVFEYAL
2201: ENTEGNDLSR VLWLKSRSSE VWLERRTNYT RSLAVMSMVG YILGLGDRHP SNLMLHRYSG KILHIDFGDC FEASMNREKF PEKVPFRLTR MLVKAMEVSG
2301: IEGNFRSTCE NVMQVLRTNK DSVMAMMEAF VHDPLINWRL FNFNEVPQLA LLGNNNPNAP ADVEPDEEDE DPADIDLPQP QRSTREKEIL QAVNMLGDAN
2401: EVLNERAVVV MARMSHKLTG RDFSSSAIPS NPIADHNNLL GGDSHEVEHG LSVKVQVQKL INQATSHENL CQNYVGWCPF W
Arabidopsis Description
TORTOR [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WN52]
SUBAcon: [plastid]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.