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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion, nucleus

Predictor Summary:
  • plastid 2
  • mitochondrion 4
  • nucleus 2
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra039199.1-P Field mustard mitochondrion, nucleus, plastid 62.3 70.0
CDY63966 Canola mitochondrion, nucleus, plastid 60.21 67.65
CDY46075 Canola nucleus 53.4 67.11
Protein Annotations
MapMan:13.1.1.3.1Gene3D:4.10.365.10EntrezGene:816875UniProt:A0A178VXT6ProteinID:AAC23758.1ProteinID:AAC34660.1
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UniParc:UPI000004C542SEG:seg::::
Description
KRP1Cyclin-dependent kinase inhibitor 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q67Y93]
Coordinates
chr2:-:9976590..9978090
Molecular Weight (calculated)
22284.1 Da
IEP (calculated)
4.954
GRAVY (calculated)
-1.080
Length
191 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MVRKYRKAKG IVEAGVSSTY MQLRSRRIVY VRSEKSSSVS VVGDNGVSSS CSGSNEYKKK ELIHLEEEDK DGDTETSTYR RGTKRKLFEN LREEEKEELS
101: KSMENYSSEF ESAVKESLDC CCSGRKTMEE TVTAEEEEKA KLMTEMPTES EIEDFFVEAE KQLKEKFKKK YNFDFEKEKP LEGRYEWVKL E
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.