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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plasma membrane

Predictor Summary:
  • endoplasmic reticulum 5
  • golgi 5
  • extracellular 5
  • vacuole 4
  • plasma membrane 7
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY11488 Canola plasma membrane 93.65 92.6
Bra007759.1-P Field mustard plasma membrane 93.65 92.6
CDX76712 Canola plasma membrane 93.44 92.4
CDX76716 Canola plasma membrane 15.16 86.55
VIT_04s0008g01970.t01 Wine grape plasma membrane 83.61 82.76
KRH05414 Soybean plasma membrane 81.56 81.22
KRH15603 Soybean plasma membrane 81.35 81.02
PGSC0003DMT400048435 Potato plasma membrane 80.43 79.29
Solyc08g061560.2.1 Tomato plasma membrane 79.82 78.69
KRH52253 Soybean plasma membrane 79.3 78.66
KRH61582 Soybean plasma membrane 79.2 78.48
GSMUA_Achr7P02290_001 Banana plasma membrane 75.92 76.23
Os06t0203800-01 Rice plasma membrane 72.85 72.7
EER89390 Sorghum plasma membrane 73.05 72.61
TraesCS7B01G069800.2 Wheat plasma membrane 72.13 72.13
TraesCS7D01G166100.1 Wheat plasma membrane 72.03 72.1
TraesCS7A01G164000.1 Wheat plasma membrane 72.13 72.06
Zm00001d037114_P002 Maize plasma membrane 72.44 71.13
Os02t0777400-01 Rice plasma membrane 32.07 70.02
HORVU6Hr1G081290.10 Barley plastid 70.39 69.75
KXG31210 Sorghum plasma membrane 71.0 68.96
TraesCS6A01G336300.1 Wheat plasma membrane 69.88 68.47
Zm00001d018261_P002 Maize plasma membrane 70.29 68.39
TraesCS6B01G366900.1 Wheat plasma membrane 69.67 68.14
TraesCS6D01G316000.1 Wheat plastid 70.08 64.29
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AT5G07180.1 Thale cress plasma membrane 61.17 61.74
AT1G12460.1 Thale cress plasma membrane 27.36 30.27
AT3G56370.1 Thale cress plasma membrane 29.71 30.08
AT1G62950.1 Thale cress plasma membrane 27.25 29.89
AT5G01890.1 Thale cress plasma membrane 28.28 28.54
AT3G28040.1 Thale cress plasma membrane 29.2 28.05
Protein Annotations
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Description
ERECTALRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q42371]
Coordinates
chr2:-:11208080..11214662
Molecular Weight (calculated)
107340.0 Da
IEP (calculated)
6.188
GRAVY (calculated)
-0.052
Length
976 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MALFRDIVLL GFLFCLSLVA TVTSEEGATL LEIKKSFKDV NNVLYDWTTS PSSDYCVWRG VSCENVTFNV VALNLSDLNL DGEISPAIGD LKSLLSIDLR
101: GNRLSGQIPD EIGDCSSLQN LDLSFNELSG DIPFSISKLK QLEQLILKNN QLIGPIPSTL SQIPNLKILD LAQNKLSGEI PRLIYWNEVL QYLGLRGNNL
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401: KLESMTYLNL SSNNIKGPIP VELSRIGNLD TLDLSNNKIN GIIPSSLGDL EHLLKMNLSR NHITGVVPGD FGNLRSIMEI DLSNNDISGP IPEELNQLQN
501: IILLRLENNN LTGNVGSLAN CLSLTVLNVS HNNLVGDIPK NNNFSRFSPD SFIGNPGLCG SWLNSPCHDS RRTVRVSISR AAILGIAIGG LVILLMVLIA
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801: SKSHTSTYVM GTIGYIDPEY ARTSRLTEKS DVYSYGIVLL ELLTRRKAVD DESNLHHLIM SKTGNNEVME MADPDITSTC KDLGVVKKVF QLALLCTKRQ
901: PNDRPTMHQV TRVLGSFMLS EQPPAATDTS ATLAGSCYVD EYANLKTPHS VNCSSMSASD AQLFLRFGQV ISQNSE
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.