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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plasma membrane, plastid, vacuole

Predictor Summary:
  • endoplasmic reticulum 3
  • golgi 3
  • extracellular 3
  • plastid 2
  • mitochondrion 1
  • plasma membrane 3
  • vacuole 3
  • cytosol 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX77617 Canola plasma membrane 81.38 81.75
CDY39452 Canola plasma membrane 81.08 81.2
Bra025053.1-P Field mustard plasma membrane 80.48 80.84
VIT_10s0003g01430.t01 Wine grape cytosol 53.45 53.21
KRH11039 Soybean plasma membrane 52.85 51.61
PGSC0003DMT400073289 Potato plasma membrane 52.55 51.32
Solyc02g072520.2.1 Tomato plasma membrane 51.95 50.73
KRH42879 Soybean endoplasmic reticulum, plasma membrane 50.9 50.6
KRH58983 Soybean plasma membrane 49.7 49.77
KRH21247 Soybean plastid 52.25 47.03
TraesCS7A01G352300.1 Wheat mitochondrion 26.88 37.92
HORVU7Hr1G089500.2 Barley cytosol, peroxisome 31.08 37.43
Zm00001d046178_P001 Maize plasma membrane 36.94 36.88
TraesCS7B01G275700.1 Wheat golgi, mitochondrion, plasma membrane 36.34 36.72
TraesCS7D01G370700.1 Wheat plasma membrane 33.48 36.03
Os06t0544100-01 Rice plasma membrane 36.94 36.02
EER88491 Sorghum plasma membrane 37.09 35.8
Zm00001d053518_P001 Maize plasma membrane 34.53 35.01
EES06570 Sorghum plasma membrane 33.93 34.14
Os02t0241100-01 Rice plasma membrane 34.08 34.03
GSMUA_Achr4P26930_001 Banana extracellular, plasma membrane 15.17 30.98
AT2G24230.1 Thale cress plasma membrane 33.78 26.38
AT5G58150.1 Thale cress plasma membrane 29.13 24.71
Protein Annotations
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Description
MEE62MEE62 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UKF2]
Coordinates
chr5:-:18575520..18579241
Molecular Weight (calculated)
73896.8 Da
IEP (calculated)
9.970
GRAVY (calculated)
-0.115
Length
666 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MFLKLFLLLS LVSFSHSDSS STVSCPNGTD FHQLTTVFRY VSGFNSSWFS SNCSAVITHV VLPSRKLNGT VSWNPIRNLT RLRVLDLSNN SLDGSLPTWL
101: WSMPGLVSVN LSRNRFGGSI RVIPVNGSVL SAVKELNLSF NRFKHAVNFT GFTNLTTLDL SHNSLGVLPL GLGSLSGLRH LDISRCKING SVKPISGLKS
201: LDYLDLSENS MNGSFPVDFP NLNHLQFLNL SANRFSGSVG FDKYRKFGKS AFLHGGDFVF NDSKIPYHHR IHRLPHRHPP PVRQRNVKTH RTNHTPLVIG
301: LSSSLGALII VIFAAAIILI RRRMKSARTK SRWAISNPTP LDFKMEKSGP FEFGTESGSS WVADIKEPTA APVVMASKPL MNLTFKDLIV ATSHFGTESV
401: ISDGTCGPLY RAVLPGDLHV AIKVLERIRD VDQNDAVTAF EALTRLKHPN LLTLSGYCIA GKEKLILYEF MANGDLHRWL HELPAGETNV EDWSADTWES
501: HVGDSSPEKT NWLIRHRIAI GVARGLAYLH HVGTTHGHLV ATNILLTETL EPRISDFGIN NIARTGDDTN KNNVEFDVYS FGVILFELLT GKQGSDENVK
601: SVRRLVKERR GEEALDSRLR LAAGESVNEM VESLRIGYFC TAETPVKRPT MQQVLGLLKD IRTVSR
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.