Factsheet for AT1G20630.1

Subcellular Localization

min:

: max

Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:

nucleus 1
plastid 1
cytosol 2
mitochondrion 1
peroxisome 1

Predictors

GFP

MS/MS

Papers

Winner Takes All:	cytosol
Any Predictor:	cytosol, nucleus, peroxisome, plastid
BaCelLo:	nucleus
iPSORT:	plastid
MultiLoc:	cytosol
PProwler:	mitochondrion
WoLF PSORT:	cytosol
YLoc:	peroxisome

PPI

No PPI Data

Homology

Paralog

locus	Identity	Homology Identity

Ortholog

locus	Homology Species	Location	Identity	Homology Identity
CDY31877	Canola	cytosol	94.31	94.31
Bra012239.1-P	Field mustard	cytosol	94.11	94.11
CDY01363	Canola	cytosol	93.9	93.9
CDY29518	Canola	cytoskeleton, cytosol, peroxisome	90.24	90.24
Bra025833.1-P	Field mustard	cytoskeleton, cytosol, peroxisome	90.04	90.04
CDY31490	Canola	cytoskeleton, cytosol, peroxisome	90.04	90.04
PGSC0003DMT400025653	Potato	peroxisome	88.21	88.21
Solyc04g082460.2.1	Tomato	plastid	87.6	87.6
AT4G35090.3	Thale cress	peroxisome	86.18	86.18
KRH51611	Soybean	peroxisome	86.18	86.18
KRH60933	Soybean	endoplasmic reticulum, extracellular, mitochondrion, nucleus	85.77	85.77
KRH17522	Soybean	mitochondrion	85.37	85.37
KRH06008	Soybean	endoplasmic reticulum, mitochondrion, nucleus	85.16	85.16
AT1G20620.6	Thale cress	mitochondrion	78.86	70.42

Protein Annotations

KEGG:00380+1.11.1.6	KEGG:00630+1.11.1.6	MapMan:10.2.1	Gene3D:2.40.180.10	EntrezGene:838652	UniProt:A0A178WIQ0
ProteinID:AAC17731.1	ProteinID:AAF79625.1	ProteinID:AAF80611.1	ProteinID:AEE29998.1	EMBL:AK227182	ArrayExpress:AT1G20630
EnsemblPlantsGene:AT1G20630	RefSeq:AT1G20630	TAIR:AT1G20630	RefSeq:AT1G20630-TAIR-G	EnsemblPlants:AT1G20630.1	TAIR:AT1G20630.1
EMBL:AY136424	Unigene:At.26213	EMBL:BT010373	Symbol:CAT1	InterPro:Catalase	InterPro:Catalase_AS
InterPro:Catalase_clade1/3	InterPro:Catalase_core	InterPro:Catalase_core_sf	InterPro:Catalase_haem_BS	InterPro:Catalase_immune_responsive	InterPro:Catalase_sf
GO:GO:0003674	GO:GO:0003824	GO:GO:0004096	GO:GO:0004601	GO:GO:0005488	GO:GO:0005515
GO:GO:0005575	GO:GO:0005618	GO:GO:0005622	GO:GO:0005623	GO:GO:0005737	GO:GO:0005739
GO:GO:0005777	GO:GO:0005829	GO:GO:0005840	GO:GO:0006950	GO:GO:0006979	GO:GO:0006995
GO:GO:0007154	GO:GO:0008150	GO:GO:0008152	GO:GO:0009056	GO:GO:0009416	GO:GO:0009536
GO:GO:0009605	GO:GO:0009628	GO:GO:0009719	GO:GO:0009737	GO:GO:0009941	GO:GO:0009970
GO:GO:0009987	GO:GO:0009991	GO:GO:0016036	GO:GO:0016491	GO:GO:0020037	GO:GO:0022626
GO:GO:0030312	GO:GO:0042542	GO:GO:0042744	GO:GO:0046686	GO:GO:0046872	GO:GO:0050897
GO:GO:0055114	GO:GO:0098869	InterPro:IPR018028	InterPro:IPR037060	RefSeq:NP_564121.1	ProteinID:OAP17984.1
PFAM:PF00199	PFAM:PF06628	PIRSF:PIRSF038928	PO:PO:0000005	PO:PO:0000013	PO:PO:0000037
PO:PO:0000084	PO:PO:0000230	PO:PO:0000293	PO:PO:0001016	PO:PO:0001017	PO:PO:0001054
PO:PO:0001078	PO:PO:0001081	PO:PO:0001170	PO:PO:0001185	PO:PO:0004507	PO:PO:0007064
PO:PO:0007095	PO:PO:0007098	PO:PO:0007103	PO:PO:0007115	PO:PO:0007123	PO:PO:0007611
PO:PO:0007616	PO:PO:0008019	PO:PO:0009005	PO:PO:0009006	PO:PO:0009009	PO:PO:0009010
PO:PO:0009025	PO:PO:0009029	PO:PO:0009030	PO:PO:0009031	PO:PO:0009032	PO:PO:0009046
PO:PO:0009047	PO:PO:0009049	PO:PO:0009052	PO:PO:0020030	PO:PO:0020038	PO:PO:0020100
PO:PO:0020137	PO:PO:0025022	PO:PO:0025195	PO:PO:0025281	PRINTS:PR00067	ScanProsite:PS00437
ScanProsite:PS00438	PFscan:PS51402	PANTHER:PTHR11465	PANTHER:PTHR11465:SF34	UniProt:Q0WUH6	UniProt:Q96528
SMART:SM01060	SUPFAM:SSF56634	EMBL:U43340	UniParc:UPI00000014F9	:	:

Description

CAT1Catalase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q0WUH6]

Coordinates

chr1:+:7146636..7150180

Molecular Weight (calculated)

56765.1 Da

IEP (calculated)

7.441

GRAVY (calculated)

-0.559

Length

492 amino acids

Sequence
(BLAST)

001: MDPYRVRPSS AHDSPFFTTN SGAPVWNNNS SLTVGTRGPI LLEDYHLLEK LANFDRERIP ERVVHARGAS AKGFFEVTHD ITQLTSADFL RGPGVQTPVI
101: VRFSTVIHER GSPETLRDPR GFAVKFYTRE GNFDLVGNNF PVFFVRDGMK FPDMVHALKP NPKSHIQENW RILDFFSHHP ESLHMFSFLF DDLGIPQDYR
201: HMEGAGVNTY MLINKAGKAH YVKFHWKPTC GIKCLSDEEA IRVGGANHSH ATKDLYDSIA AGNYPQWNLF VQVMDPAHED KFDFDPLDVT KIWPEDILPL
301: QPVGRLVLNK NIDNFFNENE QIAFCPALVV PGIHYSDDKL LQTRIFSYAD SQRHRLGPNY LQLPVNAPKC AHHNNHHDGF MNFMHRDEEV NYFPSRLDPV
401: RHAEKYPTTP IVCSGNREKC FIGKENNFKQ PGERYRSWDS DRQERFVKRF VEALSEPRVT HEIRSIWISY WSQADKSLGQ KLATRLNVRP NF

Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.