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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • mitochondrion 2
  • cytosol 2
  • plastid 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra024544.1-P Field mustard cytosol 86.2 86.48
CDY04777 Canola cytosol 84.56 86.45
CDY21396 Canola cytosol 70.54 84.74
AT1G71410.1 Thale cress cytosol 78.86 79.21
VIT_18s0089g00030.t01 Wine grape cytosol 66.92 65.63
KRH27546 Soybean extracellular 65.61 64.55
KRH36424 Soybean cytosol 63.42 62.26
Solyc11g042990.1.1 Tomato plastid 62.98 61.56
GSMUA_Achr3P25170_001 Banana cytosol 59.8 59.09
EES01072 Sorghum cytosol 60.57 57.66
TraesCS3D01G231400.1 Wheat cytosol 61.01 57.6
TraesCS3A01G221700.2 Wheat cytosol 61.01 57.6
Zm00001d044478_P022 Maize cytosol 60.46 57.38
TraesCS3B01G251500.3 Wheat cytosol 60.46 57.08
HORVU3Hr1G054200.1 Barley plastid 61.12 52.25
Os01t0616100-01 Rice cytosol, plasma membrane 42.06 52.24
Zm00001d011351_P002 Maize cytosol 57.72 51.16
HORVU3Hr1G048750.1 Barley mitochondrion 13.25 35.38
AT2G40730.1 Thale cress cytosol 15.33 17.54
Protein Annotations
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SUPFAM:SSF56112UniParc:UPI000034F3C7SEG:seg:::
Description
Kinase family with ARM repeat domain-containing protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F4I313]
Coordinates
chr1:+:8089267..8094505
Molecular Weight (calculated)
100061.0 Da
IEP (calculated)
7.591
GRAVY (calculated)
-0.266
Length
913 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MSINMRTLTQ ALAKTAAVIE KTVQTTVQEV TGPKPLQDYE LLDQIGSGGP GLAWKLYSAK ARDSTRPQQY PTVCVWVLDK RALSEARARA GLSKAAEDAF
101: LDLIRADSGK LVRLRHPGVV HVVQALDENK NAMAMVTEPL FASVANALGN VENVDNVPKD LKSMEMSLLE VKHGLLQIAE TLNFLHNNAH LIHRAVSPEN
201: VFITSAGSWK LAGFGFAISQ AQDGNLDNLQ SFHYSEYDVE DSILPLQPSL NYTAPELVRS KTSSAGVSSD IFSFGCLTYH LVARKPLFDC HNNVKMYMNT
301: LNYLTNETFS SIPSDLVSDL QRMLSMNESY RPTALDFTGS SFFRSDTRLR ALRFLDHMLE RDNMQKSEFL KALSDMWKDF DSRVLRYKVL PPLCAELRNL
401: VMQPVILPMV LTIAESQDKN DFELTTLPAL VPVLSTATGD TLLLLIKRAE LIINKTNAEH LVSHVLPLLL RAYNDNDVRI QEEVLKRSTS VAKQLDGQVV
501: RQAILPRVHG LALKTTVAAV RVNALLCLAE LVQTLDKLAV TEILQTIQRC TAVDRSAPTL MCTLAIANAI LKQYGVEFTS EHVLPLIIPL LTAQQLNVQQ
601: FAKYILFVKD ILRKIEEKRG VTVNDSGVPE VKPGCVADGL QFQTPTKKTE KVASAAKNSP AWDEDWALPT KISAPRDPGP ANSPQFNNST VQSQSSNRTS
701: VPTTCPAVDL EWPPRQSFNA TAQPANDETR INAAGTPTTP SFDELDPFAN WPPRPNSAST ASGGFHNSTT TQPPINNSGS GLRNNLTDGR QFQTTNNDFW
801: AFGNASLSSM KSQQETSGIR ASNADPLTSF GIQNQNQGMP SFGSSSYGNQ KPQADISSIF SSSRTEQSAM KLAPPPSIAV GRGRGRGRSG TSISKPNGSK
901: QQQTEQPSLL DLL
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.