Factsheet for AT5G47880.1

Subcellular Localization

min:

: max

Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:

cytosol 4
mitochondrion 1

Predictors

GFP

MS/MS

Papers

Winner Takes All:	cytosol
Any Predictor:	cytosol
BaCelLo:	cytosol
MultiLoc:	cytosol
PProwler:	mitochondrion
WoLF PSORT:	cytosol
YLoc:	cytosol

PPI

No PPI Data

Homology

Paralog

locus	Identity	Homology Identity

Ortholog

locus	Homology Species	Location	Identity	Homology Identity
Bra037523.1-P	Field mustard	cytosol	92.66	93.09
CDX86338	Canola	cytosol	92.66	93.09
CDX85313	Canola	cytosol	92.2	92.63
AT3G26618.1	Thale cress	cytosol	85.78	85.98
AT1G12920.1	Thale cress	cytosol	85.55	85.94
CDY35766	Canola	cytosol	77.29	80.62

Protein Annotations

MapMan:17.3.2.1.1	Gene3D:3.30.1330.30	Gene3D:3.30.420.60	Gene3D:3.30.960.10	EntrezGene:834839	UniProt:A0A178UFY7
ProteinID:AED95583.1	ProteinID:AED95584.1	EMBL:AK316895	ArrayExpress:AT5G47880	EnsemblPlantsGene:AT5G47880	RefSeq:AT5G47880
TAIR:AT5G47880	RefSeq:AT5G47880-TAIR-G	EnsemblPlants:AT5G47880.1	TAIR:AT5G47880.1	EMBL:AY050462	EMBL:AY143968
Unigene:At.22135	ProteinID:BAB11335.1	Symbol:ERF1-1	GO:GO:0003674	GO:GO:0003676	GO:GO:0003723
GO:GO:0003747	GO:GO:0005488	GO:GO:0005575	GO:GO:0005622	GO:GO:0005623	GO:GO:0005737
GO:GO:0006412	GO:GO:0006415	GO:GO:0008135	GO:GO:0008150	GO:GO:0008152	GO:GO:0009058
GO:GO:0009987	GO:GO:0016043	GO:GO:0019538	GO:GO:0040007	GO:GO:0040008	InterPro:IPR024049
InterPro:IPR029064	InterPro:L30e-like	RefSeq:NP_001032029.1	RefSeq:NP_199599.1	ProteinID:OAO92539.1	PFAM:PF03463
PFAM:PF03464	PFAM:PF03465	PO:PO:0000013	PO:PO:0000037	PO:PO:0000084	PO:PO:0000230
PO:PO:0000293	PO:PO:0001016	PO:PO:0001017	PO:PO:0001054	PO:PO:0001078	PO:PO:0001081
PO:PO:0001185	PO:PO:0004507	PO:PO:0007064	PO:PO:0007095	PO:PO:0007098	PO:PO:0007103
PO:PO:0007115	PO:PO:0007123	PO:PO:0007611	PO:PO:0007616	PO:PO:0008019	PO:PO:0009005
PO:PO:0009006	PO:PO:0009009	PO:PO:0009010	PO:PO:0009015	PO:PO:0009025	PO:PO:0009029
PO:PO:0009030	PO:PO:0009031	PO:PO:0009032	PO:PO:0009046	PO:PO:0009047	PO:PO:0009052
PO:PO:0020030	PO:PO:0020038	PO:PO:0020100	PO:PO:0020137	PO:PO:0020144	PO:PO:0025022
PO:PO:0025195	PO:PO:0025281	PANTHER:PTHR10113	PANTHER:PTHR10113:SF19	InterPro:Peptide_chain-rel_eRF1/aRF1	UniProt:Q39097
InterPro:Release_factor_eRF1/aRF1_N	SMART:SM01194	SUPFAM:SSF53137	SUPFAM:SSF55315	SUPFAM:SSF55481	TIGRFAMs:TIGR03676
EMBL:U40217	UniParc:UPI000012A133	InterPro:eRF1_1_Pelota	InterPro:eRF1_2	InterPro:eRF1_3	:

Description

ERF1-1ERF1-1 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UFY7]

Coordinates

chr5:-:19386045..19388587

Molecular Weight (calculated)

48725.7 Da

IEP (calculated)

4.932

GRAVY (calculated)

-0.423

Length

436 amino acids

Sequence
(BLAST)

001: MGDKNDDDKN IEIWKIKKLI KSLEAARGNG TSMISLIMPP RDQVSRVTKM LGDEYGTASN IKSRVNRQSV LGAITSAQQR LKLYNRVPPN GLVLYTGTIV
101: NEDGKEKKVT IDFEPFRPIN ASLYLCDNKF HTEALNELLE SDDKFGFIVM DGNGTLFGTL SGNTREVLHK FSVDLPKKHG RGGQSALRFA RLRMEKRHNY
201: VRKTAELATQ YYINPATSQP NVSGLILAGS ADFKTELSQS DMFDPRLAAK ILNVVDVSYG GENGFNQAIE LSAEILANVK FIQEKRLIGK YFEEISQDTG
301: KYVFGVEDTL NALESGAIET LIVWENLDIN RYVMKNSATG ETVIKHLNKE QEANTENFKV ADSDLALDVE EKLSLLEWLA NEYRRFGCAL EFVTNKSQEG
401: SQFCRGFGGI GGILRYQLDM TAFDSEDGEA LDDDSE

Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.