Skip to main content
crop-pal logo
Wine grape
Search for another protein from :
Wine grape
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: extracellular, cytosol

Predictor Summary:
  • cytosol 4
  • plastid 2
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol, extracellular
Any Predictor:cytosol, mitochondrion, plastid
BaCelLo:cytosol
EpiLoc:plastid
MultiLoc:cytosol
Plant-mPloc:plastid
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
 extracellular: 27664331
msms PMID: 27664331 doi
P Pérez-Bermúdez, J Blesa, JM Soriano, A Marcilla
Departament de Biologia Vegetal, Facultat de Farmàcia, Universitat de València, Burjassot, Valencia, Spain., Grupo de Ciencias de la Alimentación Basada en la Evidencia y Experimentación (CiAlBEx), Instituto de Ciencias de los Materiales, Parque Científico, Universitat de València, Paterna, Spain; Unidad Mixta de Investigación en Endocrinología, Nutrición y Dietética Clínica, Instituto de Investigación Sanitaria La Fe-Universitat de València, Valencia, Spain., Unidad Mixta de Investigación en Endocrinología, Nutrición y Dietética Clínica, Instituto de Investigación Sanitaria La Fe-Universitat de València, Valencia, Spain; Àrea de Parasitologia, Departament de Farmàcia i Tecnologia Farmacèutica i Parasitologia, Universitat de València, Burjassot, Valencia, Spain. Electronic address: antonio.marcilla@uv.es.
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
PGSC0003DMT400022467 Potato cytosol 88.24 88.24
VIT_06s0009g01080.t01 Wine grape plastid 89.67 85.32
Solyc01g009180.2.1 Tomato plastid 88.63 82.99
VIT_10s0042g00970.t01 Wine grape cytosol 15.42 43.07
VIT_19s0015g01260.t01 Wine grape cytosol 3.92 12.24
Protein Annotations
KEGG:00270+2.1.1.14KEGG:00450+2.1.1.14EntrezGene:100248500wikigene:100248500Gene3D:3.20.20.210MapMan:4.1.2.2.6.2.1
ProteinID:CCB56020ProteinID:CCB56020.1InterPro:Cbl-indep_Met_Synth_NInterPro:Cobalamin-indep_Met_synthasencoils:CoilUniProt:F6HMN8
EMBL:FN595995GO:GO:0003674GO:GO:0003824GO:GO:0003871GO:GO:0005488GO:GO:0005575
GO:GO:0005576GO:GO:0005622GO:GO:0005623GO:GO:0005737GO:GO:0005829GO:GO:0008150
GO:GO:0008152GO:GO:0008270GO:GO:0008652GO:GO:0008705GO:GO:0009058GO:GO:0009086
GO:GO:0009987GO:GO:0016740GO:GO:0032259GO:GO:0050667InterPro:IPR038071EntrezGene:LOC100248500
wikigene:LOC100248500HAMAP:MF_00172InterPro:Met_Synth_C/arcPFAM:PF01717PFAM:PF08267PIRSF:PIRSF000382
PANTHER:PTHR30519PANTHER:PTHR30519:SF11SUPFAM:SSF51726TIGR:TC51791TIGR:TC51815TIGR:TC52137
TIGR:TC57702TIGRFAMs:TIGR01371UniParc:UPI00015CD060InterPro:UROD/MetE-like_sfArrayExpress:VIT_08s0056g01570EnsemblPlantsGene:VIT_08s0056g01570
EnsemblPlants:VIT_08s0056g01570.t01unigene:Vvi.7956RefSeq:XP_002276438RefSeq:XP_002276438.1::
Description
No Description!
Coordinates
chr8:-:2479515..2484793
Molecular Weight (calculated)
84996.0 Da
IEP (calculated)
6.472
GRAVY (calculated)
-0.167
Length
765 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MASHIVGYPR MGPKRELKFA LESFWDKKSS AEDLQKVAAD LRASIWKQMA DAGTKYIPSN TFSYYDQVLD TTAMLGAVPP RYGWNGGEIE FDVYFSMARG
101: NASVPAMEMT KWFDTNYHYI VPELGPEVKF SYASHKAVKE YQEAKALGVD TVPVFVGPVS YLLLSKPAKG VEKSFSLLSL LDKILPIYKE VVAELKAAGA
201: SSIQFDEPTL VMDLDSHKLQ AFTHAYSELE ASCSGLNVIV ETYFADVPSE AFKTLTSLKG VTGFGFDLVR GTKTLDLIKV GFPTGKYLFA GVVDGRNIWA
301: NDLAASLSVL QELESIVGKD KLVVSTSCSL LHTAVDLINE PKLDQEIKSW LAFAAQKIVE VNALAKALAG HKEEAFFSDN ASAQASRKSS PRVTNEAVQK
401: AASALKGSDH RRATDVSARL DAQQRKLKLP VLPTTTIGSF PQTMDLRRVR REYKAKKISE EDYVKAIKEE INKVVKLQEE LDIDVLVHGE PERNDMVEYF
501: GEQLSGFAFT ANGWVQSYGS RCVKPPIIYG DVSRPKPMTV FWSTMAQSMT ARPMKGMLTG PVTILNWSFV RNDQPRFETC YQIALAIKDE VEDLEKAGIT
601: VIQIDEAALR EGLPLRKSEH AFYLDWAVHS FRITNCGVQD TTQIHTHMCY SNFNDIIHSI IDMDADVITI ENSRSDEKLL SVFREGVKYG AGIGPGVYDI
701: HSPRIPSTEE IADRINKMLA VLETNILWVN PDCGLKTRKY TEVMPALKNM VAAAKLLRTE LASAK
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT5G17920.2 )
(BLAST)
001: MASHIVGYPR MGPKRELKFA LESFWDGKST AEDLQKVSAD LRSSIWKQMS AAGTKFIPSN TFAHYDQVLD TTAMLGAVPP RYGYTGGEIG LDVYFSMARG
101: NASVPAMEMT KWFDTNYHYI VPELGPEVNF SYASHKAVNE YKEAKALGVD TVPVLVGPVS YLLLSKAAKG VDKSFELLSL LPKILPIYKE VITELKAAGA
201: TWIQLDEPVL VMDLEGQKLQ AFTGAYAELE STLSGLNVLV ETYFADIPAE AYKTLTSLKG VTAFGFDLVR GTKTLDLVKA GFPEGKYLFA GVVDGRNIWA
301: NDFAASLSTL QALEGIVGKD KLVVSTSCSL LHTAVDLINE TKLDDEIKSW LAFAAQKVVE VNALAKALAG QKDEALFSAN AAALASRRSS PRVTNEGVQK
401: AAAALKGSDH RRATNVSARL DAQQKKLNLP ILPTTTIGSF PQTVELRRVR REYKAKKVSE EDYVKAIKEE IKKVVDLQEE LDIDVLVHGE PERNDMVEYF
501: GEQLSGFAFT ANGWVQSYGS RCVKPPVIYG DVSRPKAMTV FWSAMAQSMT SRPMKGMLTG PVTILNWSFV RNDQPRHETC YQIALAIKDE VEDLEKGGIG
601: VIQIDEAALR EGLPLRKSEH AFYLDWAVHS FRITNCGVQD STQIHTHMCY SHFNDIIHSI IDMDADVITI ENSRSDEKLL SVFREGVKYG AGIGPGVYDI
701: HSPRIPSSEE IADRVNKMLA VLEQNILWVN PDCGLKTRKY TEVKPALKNM VDAAKLIRSQ LASAK
Arabidopsis Description
MS15-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O50008]
SUBAcon: [cytosol]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.