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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • cytosol 4
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX86109 Canola cytosol 95.24 95.24
Bra018180.1-P Field mustard cytosol 95.12 95.12
CDX99080 Canola cytosol 95.01 95.01
VIT_06s0004g06020.t01 Wine grape cytosol 83.35 83.16
GSMUA_Achr6P33840_001 Banana cytosol 80.38 80.67
KRH46442 Soybean nucleus 81.09 80.61
TraesCS3B01G398000.1 Wheat cytosol, golgi 79.43 80.29
KRG98345 Soybean cytosol, nucleus 80.74 80.26
TraesCS3B01G397900.1 Wheat cytosol 79.07 79.93
TraesCS3D01G359200.1 Wheat cytosol 79.07 79.93
TraesCS3D01G359300.1 Wheat cytosol 79.07 79.93
TraesCS3A01G366400.1 Wheat cytosol, plastid 78.95 79.81
TraesCS3A01G366300.1 Wheat cytosol 78.83 79.69
Solyc09g031970.2.1 Tomato cytosol, nucleus, plastid 78.83 79.21
Os01t0851700-01 Rice cytosol, nucleus, plasma membrane, plastid 78.83 78.83
HORVU3Hr1G085420.12 Barley cytosol 51.72 78.66
EES03893 Sorghum cytosol 78.12 78.4
HORVU2Hr1G012630.6 Barley mitochondrion, plastid 46.61 77.32
HORVU3Hr1G085390.1 Barley cytosol 11.53 76.38
HORVU3Hr1G085380.5 Barley cytosol, plastid 44.47 74.8
Zm00001d042842_P003 Maize cytosol 78.36 70.18
HORVU6Hr1G085990.1 Barley cytosol 4.16 66.04
HORVU3Hr1G085410.1 Barley plastid 15.7 65.02
AT3G29320.1 Thale cress plastid 62.07 54.26
Protein Annotations
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InterPro:Pyridoxal_P_attach_siteUniProt:Q9SD76SUPFAM:SSF53756TIGRFAMs:TIGR02093UniParc:UPI0000001156UniProt:W8PUR4
SEG:seg:::::
Description
PHS2Alpha-glucan phosphorylase 2, cytosolic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9SD76]
Coordinates
chr3:-:17301394..17306633
Molecular Weight (calculated)
95164.3 Da
IEP (calculated)
5.975
GRAVY (calculated)
-0.381
Length
841 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MANANGKAAT SLPEKISAKA NPEADDATEI AGNIVYHAKY SPHFSPLKFG PEQALYATAE SLRDRLIQLW NETYVHFNKV DPKQTYYLSM EYLQGRALTN
101: AIGNLNLQGP YADALRTLGY ELEEIAEQEK DAALGNGGLG RLASCFLDSM ATLNLPAWGY GLRYRHGLFK QIITKKGQEE IPEDWLEKFS PWEIVRHDVV
201: FPVRFFGKVQ VNPDGSRKWV DGDVVQALAY DVPIPGYGTK NTISLRLWEA KARAEDLDLF QFNEGEYELA AQLHSRAQQI CTVLYPGDAT ENGKLLRLKQ
301: QFFLCSASLQ DIISRFHERS TTEGSRKWSE FPSKVAVQMN DTHPTLAIPE LMRLLMDDNG LGWDEAWDVT SKTVAYTNHT VLPEALEKWS QSLMWKLLPR
401: HMEIIEEIDK RFVQTIRDTR VDLEDKISSL SILDNNPQKP VVRMANLCVV SSHTVNGVAQ LHSDILKAEL FADYVSIWPN KFQNKTNGIT PRRWLRFCSP
501: ELSDIITKWL KTDKWITDLD LLTGLRQFAD NEELQSEWAS AKTANKKRLA QYIERVTGVS IDPTSLFDIQ VKRIHEYKRQ LMNILGVVYR FKKLKEMKPE
601: ERKKTVPRTV MIGGKAFATY TNAKRIVKLV NDVGDVVNSD PEVNEYLKVV FVPNYNVTVA EMLIPGSELS QHISTAGMEA SGTSNMKFAL NGCLIIGTLD
701: GANVEIREEV GEENFFLFGA TADQVPRLRK EREDGLFKPD PRFEEAKQFV KSGVFGSYDY GPLLDSLEGN TGFGRGDYFL VGYDFPSYMD AQAKVDEAYK
801: DRKGWLKMSI LSTAGSGKFS SDRTIAQYAK EIWNIEACPV P
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.