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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion

Predictor Summary:
  • plastid 2
  • mitochondrion 6
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:mitochondrion
Any Predictor:mitochondrion, plastid
BaCelLo:plastid
iPSORT:mitochondrion
MultiLoc:mitochondrion
Predotar:mitochondrion
PProwler:mitochondrion
TargetP:mitochondrion
WoLF PSORT:plastid
YLoc:mitochondrion
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY47592 Canola mitochondrion 88.13 88.77
CDY67628 Canola mitochondrion 88.13 88.77
CDY17034 Canola mitochondrion 87.41 88.04
Bra032216.1-P Field mustard mitochondrion 87.05 87.68
CDY23649 Canola mitochondrion 87.05 87.36
Bra014069.1-P Field mustard mitochondrion 67.63 78.99
AT1G19580.1 Thale cress mitochondrion 74.1 74.91
AT5G66510.2 Thale cress mitochondrion 63.31 65.43
AT3G48680.1 Thale cress mitochondrion 19.06 20.7
AT5G63510.2 Thale cress mitochondrion 19.06 19.0
Protein Annotations
Gene3D:2.160.10.10MapMan:2.4.1.4.6EntrezGene:841129UniProt:A0A178WI45ProteinID:AAG52641.1ProteinID:AEE32144.1
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GO:GO:0046872GO:GO:0070207GO:GO:2000377InterPro:HexapepRefSeq:NP_175159.1ProteinID:OAP17926.1
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PO:PO:0020100PO:PO:0020137PO:PO:0025022PO:PO:0025195PO:PO:0025281PANTHER:PTHR13061
PANTHER:PTHR13061:SF23UniProt:Q9C6B3SUPFAM:SSF51161InterPro:Trimer_LpxA-like_sfUniParc:UPI000009D4A2:
Description
GAMMACA2GAMMA CA2 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WI45]
Coordinates
chr1:-:17319551..17323484
Molecular Weight (calculated)
30067.0 Da
IEP (calculated)
7.273
GRAVY (calculated)
-0.157
Length
278 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MGTLGRAIYT VGNWIRGTGQ ALDRVGSLLQ GSHRIEEHLS RHRTLMNVFD KSPLVDKDVF VAPSASVIGD VQIGKGSSIW YGCVLRGDVN NISVGSGTNI
101: QDNTLVHVAK TNISGKVLPT LIGDNVTVGH SAVIHGCTVE DDAFVGMGAT LLDGVVVEKH AMVAAGSLVK QNTRIPSGEV WGGNPAKFMR KLTDEEIVYI
201: SQSAKNYINL AQIHASENSK SFEQIEVERA LRKKYARKDE DYDSMLGITR ETPPELILPD NVLPGGKPVA KVPSTQYF
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.