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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 7
  • cytosol 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY46271 Canola plastid 87.99 95.41
CDY29333 Canola plastid 94.28 94.93
Bra039647.1-P Field mustard plastid 93.63 94.74
Bra018828.1-P Field mustard plastid 92.34 94.09
CDY28135 Canola plastid 93.83 93.95
CDY71256 Canola cytosol 16.77 93.91
CDY50976 Canola plastid 88.55 89.89
Solyc01g106840.1.1 Tomato cytosol 3.02 83.33
KRH77911 Soybean nucleus 81.66 82.09
KRH27589 Soybean nucleus 81.54 81.97
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GSMUA_Achr4P01370_001 Banana nucleus 75.9 76.11
Os05t0235300-01 Rice plasma membrane 73.68 74.16
OQU77830 Sorghum cytosol 72.79 73.24
TraesCS1A01G227600.1 Wheat nucleus 72.55 72.73
HORVU1Hr1G059220.10 Barley nucleus 72.51 72.69
TraesCS1B01G241900.3 Wheat nucleus 72.47 72.65
TraesCS1D01G229300.1 Wheat nucleus 72.47 72.65
Zm00001d037950_P004 Maize cytosol 51.23 69.76
Zm00001d037951_P001 Maize mitochondrion 18.22 68.9
VIT_03s0088g00450.t01 Wine grape nucleus 81.06 68.47
PGSC0003DMT400010706 Potato cytosol 6.57 60.37
AT5G40820.2 Thale cress cytosol, nucleus, plasma membrane 15.44 14.17
AT3G48190.2 Thale cress cytosol, nucleus, plastid 15.56 12.81
Protein Annotations
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Description
TORTOR [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WN52]
Coordinates
chr1:-:18522248..18539995
Molecular Weight (calculated)
279206.0 Da
IEP (calculated)
6.818
GRAVY (calculated)
-0.144
Length
2481 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MSTSSQSFVA GRPASMASPS QSHRFCGPSA TASGGGSFDT LNRVIADLCS RGNPKEGAPL AFRKHVEEAV RDLSGEASSR FMEQLYDRIA NLIESTDVAE
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1001: ILPCFIQVLG DAERFNDYTY VPDILHTLEV FGGTLDEHMH LLLPALIRLF KVDAPVAIRR DAIKTLTRVI PCVQVTGHIS ALVHHLKLVL DGKNDELRKD
1101: AVDALCCLAH ALGEDFTIFI ESIHKLLLKH RLRHKEFEEI HARWRRREPL IVATTATQQL SRRLPVEVIR DPVIENEIDP FEEGTDRNHQ VNDGRLRTAG
1201: EASQRSTKED WEEWMRHFSI ELLKESPSPA LRTCAKLAQL QPFVGRELFA AGFVSCWAQL NESSQKQLVR SLEMAFSSPN IPPEILATLL NLAEFMEHDE
1301: KPLPIDIRLL GALAEKCRVF AKALHYKEME FEGPRSKRMD ANPVAVVEAL IHINNQLHQH EAAVGILTYA QQHLDVQLKE SWYEKLQRWD DALKAYTLKA
1401: SQTTNPHLVL EATLGQMRCL AALARWEELN NLCKEYWSPA EPSARLEMAP MAAQAAWNMG EWDQMAEYVS RLDDGDETKL RGLASPVSSG DGSSNGTFFR
1501: AVLLVRRAKY DEAREYVERA RKCLATELAA LVLESYERAY SNMVRVQQLS ELEEVIEYYT LPVGNTIAEE RRALIRNMWT QRIQGSKRNV EVWQALLAVR
1601: ALVLPPTEDV ETWLKFASLC RKSGRISQAK STLLKLLPFD PEVSPENMQY HGPPQVMLGY LKYQWSLGEE RKRKEAFTKL QILTRELSSV PHSQSDILAS
1701: MVSSKGANVP LLARVNLKLG TWQWALSSGL NDGSIQEIRD AFDKSTCYAP KWAKAWHTWA LFNTAVMSHY ISRGQIASQY VVSAVTGYFY SIACAANAKG
1801: VDDSLQDILR LLTLWFNHGA TADVQTALKT GFSHVNINTW LVVLPQIIAR IHSNNRAVRE LIQSLLIRIG ENHPQALMYP LLVACKSISN LRRAAAQEVV
1901: DKVRQHSGAL VDQAQLVSHE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RLYFGEHNIE GMLKVLEPLH DMLDEGVKKD STTIQERAFI EAYRHELKEA HECCCNYKIT
2001: GKDAELTQAW DLYYHVFKRI DKQLASLTTL DLESVSPELL LCRDLELAVP GTYRADAPVV TISSFSRQLV VITSKQRPRK LTIHGNDGED YAFLLKGHED
2101: LRQDERVMQL FGLVNTLLEN SRKTAEKDLS IQRYSVIPLS PNSGLIGWVP NCDTLHHLIR EHRDARKIIL NQENKHMLSF APDYDNLPLI AKVEVFEYAL
2201: ENTEGNDLSR VLWLKSRSSE VWLERRTNYT RSLAVMSMVG YILGLGDRHP SNLMLHRYSG KILHIDFGDC FEASMNREKF PEKVPFRLTR MLVKAMEVSG
2301: IEGNFRSTCE NVMQVLRTNK DSVMAMMEAF VHDPLINWRL FNFNEVPQLA LLGNNNPNAP ADVEPDEEDE DPADIDLPQP QRSTREKEIL QAVNMLGDAN
2401: EVLNERAVVV MARMSHKLTG RDFSSSAIPS NPIADHNNLL GGDSHEVEHG LSVKVQVQKL INQATSHENL CQNYVGWCPF W
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.