Skip to main content
crop-pal logo
Sorghum
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 2
  • mitochondrion 1
  • cytosol 2
PPI

Inferred distinct locusB in Crop

locusBlocations
EES13928
KXG35906
OQU81340

Inferred from Arabidopsis experimental PPI

Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Zm00001d037951_P001 Maize mitochondrion 25.99 97.71
Os05t0235300-01 Rice plasma membrane 93.8 93.83
TraesCS1B01G241900.3 Wheat nucleus 92.94 92.61
TraesCS1D01G229300.1 Wheat nucleus 92.94 92.61
TraesCS1A01G227600.1 Wheat nucleus 92.86 92.53
HORVU1Hr1G059220.10 Barley nucleus 92.74 92.4
CDY71256 Canola cytosol 14.92 83.07
GSMUA_Achr4P01370_001 Banana nucleus 80.05 79.79
Solyc01g106840.1.1 Tomato cytosol 2.88 78.89
PGSC0003DMT400066098 Potato nucleus 75.91 75.82
Solyc01g106770.2.1 Tomato nucleus 75.59 75.68
KRH77911 Soybean nucleus 75.43 75.36
KRH27589 Soybean nucleus 75.43 75.36
AT1G50030.1 Thale cress plastid 73.24 72.79
CDY29333 Canola plastid 71.65 71.71
CDY46271 Canola plastid 66.3 71.46
Bra039647.1-P Field mustard plastid 71.01 71.41
CDY28135 Canola plastid 71.41 71.07
Bra018828.1-P Field mustard plastid 70.07 70.97
CDY50976 Canola plastid 67.44 68.04
VIT_03s0088g00450.t01 Wine grape nucleus 76.07 63.87
PGSC0003DMT400010706 Potato cytosol 6.45 58.89
OQU77126 Sorghum cytosol 15.53 14.2
OQU86543 Sorghum cytosol 16.5 13.41
KXG37601 Sorghum nucleus 15.25 10.19
Protein Annotations
KEGG:04150+2.7.11.1KEGG:04151+2.7.11.1KEGG:04714+2.7.11.1KEGG:04926+2.7.11.1KEGG:05165+2.7.11.1Gene3D:1.10.1070.11
Gene3D:1.20.120.150Gene3D:1.25.10.10Gene3D:1.25.40.10MapMan:18.4.7.1MapMan:27.7.1.1Gene3D:3.30.1010.10
UniProt:A0A1Z5R261InterPro:ARM-likeInterPro:ARM-type_foldInterPro:DUF3385_TORInterPro:FATC_domInterPro:FRB_dom
InterPro:FRB_sfGO:GO:0000003GO:GO:0000166GO:GO:0003674GO:GO:0003676GO:GO:0003677
GO:GO:0003824GO:GO:0004672GO:GO:0004674GO:GO:0005488GO:GO:0005515GO:GO:0005524
GO:GO:0005575GO:GO:0005622GO:GO:0005623GO:GO:0005634GO:GO:0005737GO:GO:0005844
GO:GO:0006139GO:GO:0006464GO:GO:0006468GO:GO:0006629GO:GO:0006950GO:GO:0007154
GO:GO:0007165GO:GO:0007275GO:GO:0008150GO:GO:0008152GO:GO:0009056GO:GO:0009058
GO:GO:0009303GO:GO:0009605GO:GO:0009606GO:GO:0009607GO:GO:0009615GO:GO:0009628
GO:GO:0009630GO:GO:0009719GO:GO:0009733GO:GO:0009745GO:GO:0009790GO:GO:0009791
GO:GO:0009793GO:GO:0009987GO:GO:0010116GO:GO:0010507GO:GO:0010929GO:GO:0016043
GO:GO:0016049GO:GO:0016301GO:GO:0016310GO:GO:0016740GO:GO:0019538GO:GO:0019725
GO:GO:0019748GO:GO:0030307GO:GO:0040007GO:GO:0040019GO:GO:0042802GO:GO:0043621
GO:GO:0044212GO:GO:0044877GO:GO:0045893GO:GO:0050687GO:GO:1900459GO:GO:1901355
GO:GO:1902661GO:GO:2000234InterPro:IPR000403InterPro:IPR003152InterPro:IPR011989InterPro:IPR011990
InterPro:IPR014009InterPro:IPR036738InterPro:IPR036940InterPro:Kinase-like_dom_sfEnsemblPlants:OQU77830ProteinID:OQU77830
ProteinID:OQU77830.1PFAM:PF00454PFAM:PF02259PFAM:PF02260PFAM:PF08771PFAM:PF11865
InterPro:PI3/4_kinase_CSInterPro:PI3/4_kinase_cat_domInterPro:PI3/4_kinase_cat_sfInterPro:PIK-rel_kinase_FATInterPro:PIK_FATScanProsite:PS00915
ScanProsite:PS00916PFscan:PS50290PFscan:PS51189PFscan:PS51190PANTHER:PTHR11139PANTHER:PTHR11139:SF9
SMART:SM00146SMART:SM01343SMART:SM01345SMART:SM01346EnsemblPlantsGene:SORBI_3009G109200SUPFAM:SSF47212
SUPFAM:SSF48371SUPFAM:SSF56112InterPro:TORInterPro:TPR-like_helical_dom_sfUniParc:UPI000B4269B9SEG:seg
Description
hypothetical protein
Coordinates
chr9:+:44029597..44061461
Molecular Weight (calculated)
276739.0 Da
IEP (calculated)
7.090
GRAVY (calculated)
-0.116
Length
2466 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MKPSPHFPEI GKKPKDLIAK DHAFNIAAYI SSGADVIAAA LRKHVEEEAR DLSGEAFLRF MDQLYEQISS LLQSNDVTEN LLALRAIDAL IDMPFGEGAS
0101: KVSKFASFLR NVFEVKRDPE ILVPASAVLG HLAKAGGAMT ADEVERQIKT ALGWLTGDRV EYRRFAAVLI LKEMAENGST VFNVHVPEFV DAIWVALRDP
0201: KQAVREKAVE ALRACLHVIE KRETRWRVQW YYRMCEAAQV GLGRNASVHS IHGSLLAVGE LLRNTGEFMM SRYREVADIV LDYLKHRDQL VRRSITSLLP
0301: RIAHFLRDRF VTNYLKICMD HILFVLRTPD ERASGFVALG EMAGALGVEL VPYLPAITSH LQDAIAPRRG RPSLEAISCV GSFAKAMGPA MEPHIRSGLL
0401: DAMFFAGLSD KLVDALESIS TSIPSLLPTI QERLLDCISQ ALPKSSIRPG ASVGRANRSN SLQQFVDSNS PLLVQLALWT LANFNFKGHE LLEFARESVI
0501: LYLEDEDSST RKAASLCCCK LVAHSLSASS TSQFGSNRTN RIGGAKRRRL VEEIVEKLLM AAVADADVGV RSSVFKALYR NPAFDDFLAQ ADILTSIFVA
0601: LNDEEYDVRE LAISVAGRLS EKNPAYVLPA LRRYLIQLLT YLDQSMDSKC REESARLLGC LIRSCARLIL PYIAPVHKAL VTRLCEGTGP NANNALAAGV
0701: LATVGELAKV GGFAMRRYLP ELMPVVVDAL LDGGAVSKRE VAVSTLGQII QSTGYVIAPY NEYPPLLGLL LKLLNGELEW STRLEVLKVL GIMGALDPHA
0801: HKRNQHNLPG QHREVLRPTI ETAQHIVSME ELPTDFWPSF SASEDYYSTV AISSLMRILR DPSLSSYHQM VVGSLIFIFK SMGLGCVPYL PKVLPELLRA
0901: VRMCEDGGLK EFITWKLGTL ISIVRQHIRK YLQDILSLIS ELWTSSFSLP APNRTIQGPQ GSPVLHLVEQ LCLALNDEFR IYLLHILPSC IQVLGDAERC
1001: NDYYYVPGIL HTLEVFGGNL DEHMHLVAPV LVRLFKVELV DIRRRAIVTL TNLIPKVQVG THVSALVHHL KLVLDGNNDD LRKDAAEALC CLAHALGEDF
1101: TIFVPSIRKI LVKHHLRYRK WDEIENRLLR RELLITENLS VQKYTQCPPD VISDPLDDFD GTPSEIADET QRQARSHQVN DVRLRSAGEA SQRSTREDWA
1201: EWMRHFSIAL LKESPSPALR TCARLAQLQP SVGRELFAAG FASCWAQMSE SAQEQLVRSL KTAFSSQNIP PEILATLLNL AEFMEHDEKP LPIDTRLLGA
1301: LAEKCRAFAK ALHYKEMEFE AVCTKKMGAN PVTVVESLIH INNQLHQHEA AIGILTYSQQ NLEVQLKESW YEKLHRWDEA LKAYTIKSSQ APGPLQNLDA
1401: TLGRMRCLAA LARWEDLSAL CREQWTGAEP SARLEMAPMA ANAAWHMGEW DHMAEYVSRL DDGDENKLRM LGNTTASGDG SSNGAFFRAV LSVRSKKYDE
1501: ARIFVERARR CLATELAALV LESYERAYNN MVRVQQLSEL EEVIDYCTLP AESPIADGRR ELIRNMWNER IKGTKRNVEV WQALLAVREL VLPPNEDRDT
1601: WIKFAKLCWK NGRISQARST LVKLLQFDPE SSPELTLYHA HPQVALAYLK YQYAVGDELK RRDAFSRLQE LSMQLATAMG NFPGTSANHG TMSNAGVPLI
1701: ARVYLTLGTW KKALSPALDD DSIQEILISY NHATLSAKDW GKAWHTWALF NTEVMSRYTF RGRPDIAGKY VVAAVTGYFY SIACQSTTKG VDDSLQDILR
1801: LLTLWFNHGA TSEVQTALQK GFSLVKIEMW LVVLPQIIAR IHSNTRVVRE LIQSLLVRIG KGHPQALMYP LLVACKSISI LRQRAAQEVV DKIRQHSGGL
1901: VDQAQLVSKE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RMYFGEHNIE GMLAVLEPLH AMLERGPETI KENAFIQAYG HELLEAHECC SKYRATGEDA ELTKAWDLYY
2001: HVFRRIDKQL PSLTTLDLHS VSPELLKCRK LELAVPGTYA ADSPLVTIEY FVPQLIVITS KQRPRKLTIH GSDGNDYAFL LKGHEDLRQD ERVMQLFGLV
2101: NTLLENSRKT SEKDLSIQRY AVIPLSPNSG LIGWVPNCDT LHALIREYRD ARKIFLNQEH KLMLAFAPDY DHLPLIAKVE VFQHALQNTE GNDLAKVLWL
2201: KSRTSEVWLE RRTNYARSLA VMSMVGYLLG LGDRHPSNLM LDRYSGKILH IDFGDCFEAS MNREKFPEKV PFRLTRMLVK AMEVSGIEGT FRTTCENVMQ
2301: VLRTNRDSVM AMMEAFVHDP LINWRLFNFN EVPQVSNYGN AHAHTVVSSE DAVANRELMQ PQRGAREREL LQAVNQLGDA NEVLNERAVA VMARMSDKLT
2401: GRDFSSGSAL AGAGSSTQHG SEHLASGDAR DAQPALSVKV QVQKLILQAT SHENLCQNYV GWCPFW
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT1G50030.1 )
(BLAST)
0001: MSTSSQSFVA GRPASMASPS QSHRFCGPSA TASGGGSFDT LNRVIADLCS RGNPKEGAPL AFRKHVEEAV RDLSGEASSR FMEQLYDRIA NLIESTDVAE
0101: NMGALRAIDE LTEIGFGENA TKVSRFAGYM RTVFELKRDP EILVLASRVL GHLARAGGAM TSDEVEFQMK TAFDWLRVDR VEYRRFAAVL ILKEMAENAS
0201: TVFNVHVPEF VDAIWVALRD PQLQVRERAV EALRACLRVI EKRETRWRVQ WYYRMFEATQ DGLGRNAPVH SIHGSLLAVG ELLRNTGEFM MSRYREVAEI
0301: VLRYLEHRDR LVRLSITSLL PRIAHFLRDR FVTNYLTICM NHILTVLRIP AERASGFIAL GEMAGALDGE LIHYLPTIMS HLRDAIAPRK GRPLLEAVAC
0401: VGNIAKAMGS TVETHVRDLL DVMFSSSLSS TLVDALDQIT ISIPSLLPTV QDRLLDCISL VLSKSHYSQA KPPVTIVRGS TVGMAPQSSD PSCSAQVQLA
0501: LQTLARFNFK GHDLLEFARE SVVVYLDDED AATRKDAALC CCRLIANSLS GITQFGSSRS TRAGGRRRRL VEEIVEKLLR TAVADADVTV RKSIFVALFG
0601: NQCFDDYLAQ ADSLTAIFAS LNDEDLDVRE YAISVAGRLS EKNPAYVLPA LRRHLIQLLT YLELSADNKC REESAKLLGC LVRNCERLIL PYVAPVQKAL
0701: VARLSEGTGV NANNNIVTGV LVTVGDLARV GGLAMRQYIP ELMPLIVEAL MDGAAVAKRE VAVSTLGQVV QSTGYVVTPY KEYPLLLGLL LKLLKGDLVW
0801: STRREVLKVL GIMGALDPHV HKRNQQSLSG SHGEVPRGTG DSGQPIPSID ELPVELRPSF ATSEDYYSTV AINSLMRILR DASLLSYHKR VVRSLMIIFK
0901: SMGLGCVPYL PKVLPELFHT VRTSDENLKD FITWGLGTLV SIVRQHIRKY LPELLSLVSE LWSSFTLPGP IRPSRGLPVL HLLEHLCLAL NDEFRTYLPV
1001: ILPCFIQVLG DAERFNDYTY VPDILHTLEV FGGTLDEHMH LLLPALIRLF KVDAPVAIRR DAIKTLTRVI PCVQVTGHIS ALVHHLKLVL DGKNDELRKD
1101: AVDALCCLAH ALGEDFTIFI ESIHKLLLKH RLRHKEFEEI HARWRRREPL IVATTATQQL SRRLPVEVIR DPVIENEIDP FEEGTDRNHQ VNDGRLRTAG
1201: EASQRSTKED WEEWMRHFSI ELLKESPSPA LRTCAKLAQL QPFVGRELFA AGFVSCWAQL NESSQKQLVR SLEMAFSSPN IPPEILATLL NLAEFMEHDE
1301: KPLPIDIRLL GALAEKCRVF AKALHYKEME FEGPRSKRMD ANPVAVVEAL IHINNQLHQH EAAVGILTYA QQHLDVQLKE SWYEKLQRWD DALKAYTLKA
1401: SQTTNPHLVL EATLGQMRCL AALARWEELN NLCKEYWSPA EPSARLEMAP MAAQAAWNMG EWDQMAEYVS RLDDGDETKL RGLASPVSSG DGSSNGTFFR
1501: AVLLVRRAKY DEAREYVERA RKCLATELAA LVLESYERAY SNMVRVQQLS ELEEVIEYYT LPVGNTIAEE RRALIRNMWT QRIQGSKRNV EVWQALLAVR
1601: ALVLPPTEDV ETWLKFASLC RKSGRISQAK STLLKLLPFD PEVSPENMQY HGPPQVMLGY LKYQWSLGEE RKRKEAFTKL QILTRELSSV PHSQSDILAS
1701: MVSSKGANVP LLARVNLKLG TWQWALSSGL NDGSIQEIRD AFDKSTCYAP KWAKAWHTWA LFNTAVMSHY ISRGQIASQY VVSAVTGYFY SIACAANAKG
1801: VDDSLQDILR LLTLWFNHGA TADVQTALKT GFSHVNINTW LVVLPQIIAR IHSNNRAVRE LIQSLLIRIG ENHPQALMYP LLVACKSISN LRRAAAQEVV
1901: DKVRQHSGAL VDQAQLVSHE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RLYFGEHNIE GMLKVLEPLH DMLDEGVKKD STTIQERAFI EAYRHELKEA HECCCNYKIT
2001: GKDAELTQAW DLYYHVFKRI DKQLASLTTL DLESVSPELL LCRDLELAVP GTYRADAPVV TISSFSRQLV VITSKQRPRK LTIHGNDGED YAFLLKGHED
2101: LRQDERVMQL FGLVNTLLEN SRKTAEKDLS IQRYSVIPLS PNSGLIGWVP NCDTLHHLIR EHRDARKIIL NQENKHMLSF APDYDNLPLI AKVEVFEYAL
2201: ENTEGNDLSR VLWLKSRSSE VWLERRTNYT RSLAVMSMVG YILGLGDRHP SNLMLHRYSG KILHIDFGDC FEASMNREKF PEKVPFRLTR MLVKAMEVSG
2301: IEGNFRSTCE NVMQVLRTNK DSVMAMMEAF VHDPLINWRL FNFNEVPQLA LLGNNNPNAP ADVEPDEEDE DPADIDLPQP QRSTREKEIL QAVNMLGDAN
2401: EVLNERAVVV MARMSHKLTG RDFSSSAIPS NPIADHNNLL GGDSHEVEHG LSVKVQVQKL INQATSHENL CQNYVGWCPF W
Arabidopsis Description
TORTOR [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WN52]
SUBAcon: [plastid]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.