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Wheat
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: nucleus

Predictor Summary:
  • nucleus 2
  • mitochondrion 1
  • plasma membrane 1
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
TraesCS1D01G229300.1 Wheat nucleus 99.6 99.6
TraesCS1B01G241900.3 Wheat nucleus 99.52 99.52
HORVU1Hr1G059220.10 Barley nucleus 98.87 98.87
Os05t0235300-01 Rice plasma membrane 93.45 93.83
OQU77830 Sorghum cytosol 92.53 92.86
Zm00001d037951_P001 Maize mitochondrion 24.2 91.31
Zm00001d037950_P004 Maize cytosol 64.48 87.6
CDY71256 Canola cytosol 14.83 82.84
GSMUA_Achr4P01370_001 Banana nucleus 79.92 79.95
Solyc01g106840.1.1 Tomato cytosol 2.83 77.78
PGSC0003DMT400066098 Potato nucleus 74.95 75.13
KRH27589 Soybean nucleus 74.91 75.12
KRH77911 Soybean nucleus 74.87 75.08
Solyc01g106770.2.1 Tomato nucleus 74.59 74.95
AT1G50030.1 Thale cress plastid 72.73 72.55
CDY29333 Canola plastid 71.47 71.79
CDY46271 Canola plastid 65.98 71.37
Bra039647.1-P Field mustard plastid 70.67 71.33
CDY28135 Canola plastid 71.19 71.11
Bra018828.1-P Field mustard plastid 69.86 71.01
CDY50976 Canola plastid 67.07 67.92
VIT_03s0088g00450.t01 Wine grape nucleus 75.11 63.3
PGSC0003DMT400010706 Potato cytosol 6.42 58.89
TraesCS7A01G543400.2 Wheat plastid 15.84 14.51
TraesCS1A01G329400.1 Wheat cytosol 16.16 13.27
Protein Annotations
KEGG:04150+2.7.11.1KEGG:04151+2.7.11.1KEGG:04714+2.7.11.1KEGG:04926+2.7.11.1KEGG:05165+2.7.11.1Gene3D:1.10.1070.11
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TIGR:cd05169SEG:seg::::
Description
No Description!
Coordinates
chr1A:+:398447907..398478394
Molecular Weight (calculated)
277805.0 Da
IEP (calculated)
7.077
GRAVY (calculated)
-0.127
Length
2475 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MKPSPHFPEI GKKSKDLIPK DHSFNIAAYI SSGADVIAAA LRKHVEEEAR DLSGEAFLRF MDQLYEQISS LLQSNDVSEN LLALRAIDAL IDMPFGEGAS
0101: KVSKFASFLR NVFEVKRDPE ILVPASTVLG HLAKAGGAMT ADEVERQIKT ALGWLEGDRV EYRRFAAVLI LKEMAENAST TFNVHVPEFV DAIWVALRDP
0201: KQAVRERAVE ALRACLHVIE KRETRWRVQW YYRMCEAAQV GLGKNASVHS IHGSLLAVGE LLRNTGEFMM SRYREVADIV LTYLKHRDQL VRRSITSLLP
0301: RIAHFLRDRF VTNYLKICME HILFVLRTPD ERASGFVALG EMAGALGAEL VPSLPSITPL LHEAIAPRRG RPSLEAITCV GSFSKAMGLA MERHIRGGLL
0401: DAMFSAGLSD KLVDALESIS TSIPSLLPTI QERLLDCIAQ ALPKSSTRSG STVNRATRSN SLQHFVDSSG PVLVQLALRT LANFNFKGHE LLELARESVI
0501: LYLEDEDSST RKAAAICCCR LVAHSLSASS TSQFSSNRSN RMGGAKRRRL VEEIVEKLLI AAVADADVGV RSSVFRALCR NPTFDDFLAQ ADILTSIFVA
0601: LNDEEYGVRE LAILVAGRLS EKNPAYVLPA LRRYLIQLLT YLDQSMDSKC REESARLLGC LIRSCPRLIL PYVAPIHKAL VARLCEGTGP MANIVLAAGV
0701: LATVGELAKV GGFAMRQYLP ELMPLVVDAL LDGGSVSKRE VAVATLGQVI QSTGYVIAPY NEYPPLLGLL LKLLNGELEW STRLEVLKVL GIMGALDPHA
0801: HKRNQHNLPG QHNLPGQHRE VLRPTVETAQ HIVSMEETPT DFWPSFSASE DYYSTVAISS LMRILRDPSL ASYHQMVVGS LIFVFKSMGL GCVPYLPKVL
0901: PELFRAVRMC EDGGLKEFIT WKLGTLISIV RQHIRKYLQD ILSLVSELWT SSFSLPAPKR TIQGPQGSPV LHLVEQLCLA LNDEFRVYLL HILPSCIQVL
1001: GDAERCNDYC YVPDILHTLE VFGGNLDEHM HLVAPVLVRL FKVELVDIRR RAIITLTKLI PKVQVGTHVS ALVHHLKLVL DGNNDDLRKE AAEALCSLAH
1101: ALGEEFTIFI PSIRKLLVKH HLRYKKWDET ENRLLRRELF ISDNLSVQKY TQCPPDVISD PLDDFEGVPS EEADETQRQP RSHQVNDVRL RSAGEASQRS
1201: TREDWAEWMR HFSIALLKES PSPALRTCAR LAQLQPSVGR ELFAAGFASC WAQMTESSQE QLVRSLKTAF SSQNIPPEIL ATLLNLAEFM EHDEKPLPID
1301: TRLLGALAEK CRAYAKALHY KEMEFEAVCS KKMGANPVTV VESLIHINNQ LHQHEAAIGI LTYSQQHLEV QLKESWYEKL HRWDEALRAY TMKSSQASGP
1401: LQHSQNLDAT LGRMRCLASL ARWEDLSTLC REQWTGAEPP ARLEMAPMAA NAAWHMGEWD QMSEYVSRLD DGDENKLRSL GNTTASGDGS SNGAFFRAVL
1501: SVRCKKYEEA RVYVERARRC LATELAPLVL ESYERAYNNM VRVQQLSELE EVIDYCTLPM ESPIADGRRE LIRNMWNERI KGTKRNVEVW QALLAVRELV
1601: LPPNEDRDTW IKFAKLCWKS GRISQAKSTL VKLLQFDPES SPELTLYHGH PQVVLAYLKY QYAVGDELKR KDAFSRLQDL SVQIATATNS YSGMLVSHGA
1701: ISSAGVPLTA RVYLTLASWK RALSPGLDDD AIQEILVSYK NATLSAKDWG KAWHSWALFN TEVMSRYTLR GRPDIAGKYV VAAVTGYFYS IACASTTKGV
1801: DDSLQDILRL LTLWFNHGAT SEVQMALEKG FTLVKIEMWL VVLPQIIARI HSNNRIVREL IQELLVRIGK GHPQALMYPL LVACKSISIL RQRAAQEVVD
1901: KIRKHSGGLV DQAQLVSKEL IRVAILWHEM WHEALEEASR MYFGEHNIDG MLAVLEPLHA MLERGAETIK ENTFIQAYGH ELLEAHECCL KYRATGEDAE
2001: LTKAWDLYYH VFRRIDKQLP SLTTLDLHSV SPELLKCRKL ELAVPGTYSA DSPLVTIEYF VPQLIVITSK QRPRKLTIHG SDGEDYAFLL KGHEDLRQDE
2101: RVMQLFGLVN TLLENSRKTS EKDLSIQRYA VIPLSPNSGL IGWVPNCDTL HALIREYRDA RKIFLNQEHR LMLAFAPDYD HLPLIAKVEV FQHALQNTEG
2201: NDLAKVLWLK SRTSEVWLER RTNYTRSLAV MSMAGYLLGL GDRHPSNLML DRFSGKILHI DFGDCFEASM NREKFPEKVP FRLTRMLVKA MEVSGIEGTF
2301: RTTCENVMQV LRTNKDSVMA MMEAFVHDPL INWRLFNFNE VPQVSNYGNA HTHTVVSSEE AAPSEELMQP PRGAREKELL QAVNQLGDAN EVLNERAVAV
2401: MARMSHKLTG RDFSSGSALS GAGGSSQHGS EHLASVDARE VEPGLSVKVQ VQKLVLQATS HENLCQNYVG WCPFW
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT1G50030.1 )
(BLAST)
0001: MSTSSQSFVA GRPASMASPS QSHRFCGPSA TASGGGSFDT LNRVIADLCS RGNPKEGAPL AFRKHVEEAV RDLSGEASSR FMEQLYDRIA NLIESTDVAE
0101: NMGALRAIDE LTEIGFGENA TKVSRFAGYM RTVFELKRDP EILVLASRVL GHLARAGGAM TSDEVEFQMK TAFDWLRVDR VEYRRFAAVL ILKEMAENAS
0201: TVFNVHVPEF VDAIWVALRD PQLQVRERAV EALRACLRVI EKRETRWRVQ WYYRMFEATQ DGLGRNAPVH SIHGSLLAVG ELLRNTGEFM MSRYREVAEI
0301: VLRYLEHRDR LVRLSITSLL PRIAHFLRDR FVTNYLTICM NHILTVLRIP AERASGFIAL GEMAGALDGE LIHYLPTIMS HLRDAIAPRK GRPLLEAVAC
0401: VGNIAKAMGS TVETHVRDLL DVMFSSSLSS TLVDALDQIT ISIPSLLPTV QDRLLDCISL VLSKSHYSQA KPPVTIVRGS TVGMAPQSSD PSCSAQVQLA
0501: LQTLARFNFK GHDLLEFARE SVVVYLDDED AATRKDAALC CCRLIANSLS GITQFGSSRS TRAGGRRRRL VEEIVEKLLR TAVADADVTV RKSIFVALFG
0601: NQCFDDYLAQ ADSLTAIFAS LNDEDLDVRE YAISVAGRLS EKNPAYVLPA LRRHLIQLLT YLELSADNKC REESAKLLGC LVRNCERLIL PYVAPVQKAL
0701: VARLSEGTGV NANNNIVTGV LVTVGDLARV GGLAMRQYIP ELMPLIVEAL MDGAAVAKRE VAVSTLGQVV QSTGYVVTPY KEYPLLLGLL LKLLKGDLVW
0801: STRREVLKVL GIMGALDPHV HKRNQQSLSG SHGEVPRGTG DSGQPIPSID ELPVELRPSF ATSEDYYSTV AINSLMRILR DASLLSYHKR VVRSLMIIFK
0901: SMGLGCVPYL PKVLPELFHT VRTSDENLKD FITWGLGTLV SIVRQHIRKY LPELLSLVSE LWSSFTLPGP IRPSRGLPVL HLLEHLCLAL NDEFRTYLPV
1001: ILPCFIQVLG DAERFNDYTY VPDILHTLEV FGGTLDEHMH LLLPALIRLF KVDAPVAIRR DAIKTLTRVI PCVQVTGHIS ALVHHLKLVL DGKNDELRKD
1101: AVDALCCLAH ALGEDFTIFI ESIHKLLLKH RLRHKEFEEI HARWRRREPL IVATTATQQL SRRLPVEVIR DPVIENEIDP FEEGTDRNHQ VNDGRLRTAG
1201: EASQRSTKED WEEWMRHFSI ELLKESPSPA LRTCAKLAQL QPFVGRELFA AGFVSCWAQL NESSQKQLVR SLEMAFSSPN IPPEILATLL NLAEFMEHDE
1301: KPLPIDIRLL GALAEKCRVF AKALHYKEME FEGPRSKRMD ANPVAVVEAL IHINNQLHQH EAAVGILTYA QQHLDVQLKE SWYEKLQRWD DALKAYTLKA
1401: SQTTNPHLVL EATLGQMRCL AALARWEELN NLCKEYWSPA EPSARLEMAP MAAQAAWNMG EWDQMAEYVS RLDDGDETKL RGLASPVSSG DGSSNGTFFR
1501: AVLLVRRAKY DEAREYVERA RKCLATELAA LVLESYERAY SNMVRVQQLS ELEEVIEYYT LPVGNTIAEE RRALIRNMWT QRIQGSKRNV EVWQALLAVR
1601: ALVLPPTEDV ETWLKFASLC RKSGRISQAK STLLKLLPFD PEVSPENMQY HGPPQVMLGY LKYQWSLGEE RKRKEAFTKL QILTRELSSV PHSQSDILAS
1701: MVSSKGANVP LLARVNLKLG TWQWALSSGL NDGSIQEIRD AFDKSTCYAP KWAKAWHTWA LFNTAVMSHY ISRGQIASQY VVSAVTGYFY SIACAANAKG
1801: VDDSLQDILR LLTLWFNHGA TADVQTALKT GFSHVNINTW LVVLPQIIAR IHSNNRAVRE LIQSLLIRIG ENHPQALMYP LLVACKSISN LRRAAAQEVV
1901: DKVRQHSGAL VDQAQLVSHE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RLYFGEHNIE GMLKVLEPLH DMLDEGVKKD STTIQERAFI EAYRHELKEA HECCCNYKIT
2001: GKDAELTQAW DLYYHVFKRI DKQLASLTTL DLESVSPELL LCRDLELAVP GTYRADAPVV TISSFSRQLV VITSKQRPRK LTIHGNDGED YAFLLKGHED
2101: LRQDERVMQL FGLVNTLLEN SRKTAEKDLS IQRYSVIPLS PNSGLIGWVP NCDTLHHLIR EHRDARKIIL NQENKHMLSF APDYDNLPLI AKVEVFEYAL
2201: ENTEGNDLSR VLWLKSRSSE VWLERRTNYT RSLAVMSMVG YILGLGDRHP SNLMLHRYSG KILHIDFGDC FEASMNREKF PEKVPFRLTR MLVKAMEVSG
2301: IEGNFRSTCE NVMQVLRTNK DSVMAMMEAF VHDPLINWRL FNFNEVPQLA LLGNNNPNAP ADVEPDEEDE DPADIDLPQP QRSTREKEIL QAVNMLGDAN
2401: EVLNERAVVV MARMSHKLTG RDFSSSAIPS NPIADHNNLL GGDSHEVEHG LSVKVQVQKL INQATSHENL CQNYVGWCPF W
Arabidopsis Description
TORTOR [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WN52]
SUBAcon: [plastid]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.