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Rice
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plasma membrane

Predictor Summary:
  • nucleus 2
  • mitochondrion 1
  • cytosol 2
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:plasma membrane
Any Predictor:cytosol, mitochondrion, nucleus
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:nucleus
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
plasma membrane: 28056797
msms PMID: 28056797 doi
N Yang, T Wang
Key Laboratory of Plant Molecular Physiology, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, and National Center for Plant Gene Research, 20 Nanxincun, Xiangshan, Haidianqu, Beijing, 100093, China., Key Laboratory of Plant Molecular Physiology, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, and National Center for Plant Gene Research, 20 Nanxincun, Xiangshan, Haidianqu, Beijing, 100093, China. twang@ibcas.ac.cn.
PPI

Inferred distinct locusB in Crop

Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
OQU77830 Sorghum cytosol 93.83 93.8
HORVU1Hr1G059220.10 Barley nucleus 93.96 93.58
TraesCS1A01G227600.1 Wheat nucleus 93.83 93.45
TraesCS1B01G241900.3 Wheat nucleus 93.83 93.45
TraesCS1D01G229300.1 Wheat nucleus 93.83 93.45
Zm00001d037951_P001 Maize mitochondrion 24.75 92.99
Zm00001d037950_P004 Maize cytosol 64.71 87.54
CDY71256 Canola cytosol 15.01 83.52
GSMUA_Achr4P01370_001 Banana nucleus 81.05 80.76
Solyc01g106840.1.1 Tomato cytosol 2.92 80.0
PGSC0003DMT400066098 Potato nucleus 76.55 76.43
KRH27589 Soybean nucleus 76.43 76.34
KRH77911 Soybean nucleus 76.39 76.3
Solyc01g106770.2.1 Tomato nucleus 76.15 76.21
AT1G50030.1 Thale cress plastid 74.16 73.68
CDY29333 Canola plastid 72.62 72.65
CDY46271 Canola plastid 67.26 72.47
Bra039647.1-P Field mustard plastid 71.93 72.31
CDY28135 Canola plastid 72.54 72.16
Bra018828.1-P Field mustard plastid 71.2 72.07
CDY50976 Canola plastid 68.44 69.03
VIT_03s0088g00450.t01 Wine grape nucleus 76.59 64.28
PGSC0003DMT400010706 Potato cytosol 6.49 59.26
Os06t0724700-01 Rice mitochondrion 5.31 27.41
Os01t0106700-00 Rice cytosol 13.55 13.65
Os03t0738200-00 Rice cytosol 1.05 11.45
Protein Annotations
KEGG:04150+2.7.11.1KEGG:04151+2.7.11.1KEGG:04714+2.7.11.1KEGG:04926+2.7.11.1KEGG:05165+2.7.11.1Gene3D:1.10.1070.11
Gene3D:1.20.120.150Gene3D:1.25.10.10MapMan:18.4.7.1MapMan:27.7.1.1Gene3D:3.30.1010.10EntrezGene:4338174
ProteinID:AAT93990.1EMBL:AK120473EMBL:AP014961InterPro:ARM-likeInterPro:ARM-type_foldProteinID:BAF16902.2
InterPro:DUF3385_TORInterPro:FATC_domInterPro:FRB_domInterPro:FRB_sfGO:GO:0000003GO:GO:0000166
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InterPro:IPR003152InterPro:IPR011989InterPro:IPR014009InterPro:IPR036738InterPro:IPR036940InterPro:Kinase-like_dom_sf
EnsemblPlantsGene:Os05g0235300EnsemblPlants:Os05t0235300-01PFAM:PF00454PFAM:PF02259PFAM:PF02260PFAM:PF08771
PFAM:PF11865InterPro:PI3/4_kinase_CSInterPro:PI3/4_kinase_cat_domInterPro:PI3/4_kinase_cat_sfInterPro:PIK-rel_kinase_FATInterPro:PIK_FAT
ScanProsite:PS00915ScanProsite:PS00916PFscan:PS50290PFscan:PS51189PFscan:PS51190PANTHER:PTHR11139
PANTHER:PTHR11139:SF9UniProt:Q0DJS1SMART:SM00146SMART:SM01343SMART:SM01345SMART:SM01346
SUPFAM:SSF47212SUPFAM:SSF48371SUPFAM:SSF56112InterPro:TORUniParc:UPI00020B9E8CRefSeq:XP_015639567.1
SEG:seg:::::
Description
target of rapamycinSerine/threonine (Ser/Thr) protein kinase, Modulation of thylakoid membrane lipid biosynthesis, homeostasis (Os05t0235300-01)
Coordinates
chr5:+:8264714..8290967
Molecular Weight (calculated)
276802.0 Da
IEP (calculated)
7.024
GRAVY (calculated)
-0.127
Length
2465 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MKPSPHFPEI GKKPKDLIAK EHGFNIAAYI SSGADVIAAA LRKHVEEEAR DLSGEAFLRF MEQLYEQICS LLQSNDVAEN LLALRAIDAL IDMPFGEGAS
0101: KVSKFANFLR TVFEVKRDPE VLVPASAVLG HLAKAGGAMT ADEVERQIKT ALGWLGGDRV EYRRFASVLI LKEMAENAST VFNVHVPEFV DAIWVALRDP
0201: KQAVRERAVE ALRACLHVIE KRETRWRVQW YYRMCEAAQV GLGKNASVHS IHGSLLAVGE LLRNTGEFMM SRYREVADIV LNYLRHRDQL VRRSITSLLP
0301: RIAHFLRDRF VTNYLKICMD HILFVLRTPD ERASGFVALG EMAGALGAEL VPYLPLITSH LHDAIAPRRG RPSLEAISCV GSFAKAMGPA MEPHIRGGLL
0401: DAMFSAGLSD KLVEALESIS TSIPSLLPTI QERLLDCISQ ALPKSSVRPG AAVGRGSRSS SLQQFVDSGG PVLVQLALGT LANFNFKGHE LLEFARESVI
0501: LYLEDEDCST RKAAATCCCK LVAHSLSASS SSQFSSNRPN RMGGAKRRRL VEEIVEKLLM AAVADADVGV RSSVFKALYR NPSFDDFLAQ ADIMTSIFVA
0601: LNDEEYHVRE LAISVAGRLS EKNPAYVLPA LRRYLIQLLT YLDQSMDSKC REESARLLGC LIRSCARLIL PYIAPIHKAL VARLREGTGP NANNALAAGV
0701: LATVGELAKV GGFAMRQYLP ELMPLVVDAL LDGGAVSKRE VAVATLGQVI QSTGYVISPY NEYPPLLGLL LKLLNGELEW STRLEVLKVL GIMGALDPHA
0801: HKRNQHKLPG QHREVLRPTM ETAQHIVSME ELPTDFWPSF SASEDYYSTV AISSLMRILH DPSLSSYHQM VVGSLIFIFK SMGLGCVPYL PKVLPELFRA
0901: VRMCEDGGLK EFITWKLGTL VSIVRQHIRK YLQEILSLVS ELWTSSFSLP APNRTVQGPQ ASPVLHLVEQ LCLALNDEFR MYILHILPSC IQVLGDAERC
1001: NDYYYVPDIL HTLEVFGGNL DEHMHLVAPV LVRLFKVELV DIRRRAIVTL TKLIPTVQVG THVSVLVHHL KLVLDGNNDD LRKDAAEALC CLAHALGEDF
1101: TIFVSSIHKL LVKHHMRYRK WDEIENRLLR REPLISENLS VQKYTQCPPE VISDPLDDFG GVPSEEADET QRQPRSHQVN DVRLRSAGEA SQRSTREDWA
1201: EWMRHFSIAL LKESPSPALR TCARLAQLQP SVGRELFAAG FASCWAQMNE TSQEQLVRSL KTAFSSQNIP PEILATLLNL AEFMEHDEKP LPIDTRLLGA
1301: LAEKCRAFAK ALHYKEMEFE AVCSKKMGAN PVTVVESLIH INNQLHQHEA AIGILTYSQQ HLEVQLKESW YEKLHRWDEA LKAYKAKSSQ ASGPLQNLDA
1401: TLGRMRCLAA LARWEDLSAL CREQWTGSEP SARLEMAPMA ANAAWHMGEW DHMAEYVSRL DDGDENKLRI LGNTTASGDG SSNGAFFRAV LSVRCKKYEE
1501: ARVYVERARR CLATELAALV LESYERAYNN MVRVQQLSEL EEVIDYCTLP MESPIADSRR ELIRNMWNER IKGTKRNVEV WQALLAVREL VLPPNEDRDT
1601: WIKFAKLCWK SGRISQAKST LVKLLQFDPE SSPELTLYHG HPQVVLAYLK YQYAVGDELK RRDAFCRLQD LSVQLATATN SYSGTLASQV ATSNAGVPLI
1701: ARVYLTLASW KRALSPGLDD DSIQEILVSY KNATLNAKDW GKAWHLWALF NTEVMSRYTL RGRPDIAGKY VVAAVTGYFY SIACASTTKG VDDSLQDILR
1801: LLTLWFNHGA TSEVQMALQK GFSLVNIEMW LVVLPQIIAR IHSNNKIVRE LIQSLLVRIG KDHPQALMYP LLVACKSISI LRQRAAQEVV DKIRQHSGGL
1901: VDQAQLVSKE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RMYFGEHNIE GMLAVLEPLH AMLERGPETI KENTFIQAYG HELLEAHECC LKYRATGEDA ELTKAWDLYY
2001: HVFRRIDKQL PSLTTLDLHS VSPELLECRK LELAVPGTYS ADAPLVTIEY FVPQLIVITS KQRPRKLTIH GSDGNDYAFL LKGHEDLRQD ERVMQLFGLV
2101: NTLLENSRKT SEKDLSIQRY AVIPLSPNSG LIGWVPNCDT LHALIREYRD ARKIFLNQEH RCMLSFAPDY DHLPLIAKVE VFQHALENSE GNDLAKVLWL
2201: KSRTSEVWLE RRTNYTRSLA VMSMVGYLLG LGDRHPSNLM LDRYSGKILH IDFGDCFEAS MNREKFPEKV PFRLTRMLVK AMEVSGIEGT FRTTCENVMQ
2301: VLRTNKDSVM AMMEAFVHDP LINWRLFNFN EVPQVTNYGN AHSHTVVNSE EAANRELMQP PRGARERELL QAVNQLGDAN EVLNERAVAV MARMSHKLTG
2401: RDFSSGSSLS GAGSSTQHGN EHLASGDTRE VEPGLSVKVQ VQRLILQATS HENLCQNYVG WCPFW
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT1G50030.1 )
(BLAST)
0001: MSTSSQSFVA GRPASMASPS QSHRFCGPSA TASGGGSFDT LNRVIADLCS RGNPKEGAPL AFRKHVEEAV RDLSGEASSR FMEQLYDRIA NLIESTDVAE
0101: NMGALRAIDE LTEIGFGENA TKVSRFAGYM RTVFELKRDP EILVLASRVL GHLARAGGAM TSDEVEFQMK TAFDWLRVDR VEYRRFAAVL ILKEMAENAS
0201: TVFNVHVPEF VDAIWVALRD PQLQVRERAV EALRACLRVI EKRETRWRVQ WYYRMFEATQ DGLGRNAPVH SIHGSLLAVG ELLRNTGEFM MSRYREVAEI
0301: VLRYLEHRDR LVRLSITSLL PRIAHFLRDR FVTNYLTICM NHILTVLRIP AERASGFIAL GEMAGALDGE LIHYLPTIMS HLRDAIAPRK GRPLLEAVAC
0401: VGNIAKAMGS TVETHVRDLL DVMFSSSLSS TLVDALDQIT ISIPSLLPTV QDRLLDCISL VLSKSHYSQA KPPVTIVRGS TVGMAPQSSD PSCSAQVQLA
0501: LQTLARFNFK GHDLLEFARE SVVVYLDDED AATRKDAALC CCRLIANSLS GITQFGSSRS TRAGGRRRRL VEEIVEKLLR TAVADADVTV RKSIFVALFG
0601: NQCFDDYLAQ ADSLTAIFAS LNDEDLDVRE YAISVAGRLS EKNPAYVLPA LRRHLIQLLT YLELSADNKC REESAKLLGC LVRNCERLIL PYVAPVQKAL
0701: VARLSEGTGV NANNNIVTGV LVTVGDLARV GGLAMRQYIP ELMPLIVEAL MDGAAVAKRE VAVSTLGQVV QSTGYVVTPY KEYPLLLGLL LKLLKGDLVW
0801: STRREVLKVL GIMGALDPHV HKRNQQSLSG SHGEVPRGTG DSGQPIPSID ELPVELRPSF ATSEDYYSTV AINSLMRILR DASLLSYHKR VVRSLMIIFK
0901: SMGLGCVPYL PKVLPELFHT VRTSDENLKD FITWGLGTLV SIVRQHIRKY LPELLSLVSE LWSSFTLPGP IRPSRGLPVL HLLEHLCLAL NDEFRTYLPV
1001: ILPCFIQVLG DAERFNDYTY VPDILHTLEV FGGTLDEHMH LLLPALIRLF KVDAPVAIRR DAIKTLTRVI PCVQVTGHIS ALVHHLKLVL DGKNDELRKD
1101: AVDALCCLAH ALGEDFTIFI ESIHKLLLKH RLRHKEFEEI HARWRRREPL IVATTATQQL SRRLPVEVIR DPVIENEIDP FEEGTDRNHQ VNDGRLRTAG
1201: EASQRSTKED WEEWMRHFSI ELLKESPSPA LRTCAKLAQL QPFVGRELFA AGFVSCWAQL NESSQKQLVR SLEMAFSSPN IPPEILATLL NLAEFMEHDE
1301: KPLPIDIRLL GALAEKCRVF AKALHYKEME FEGPRSKRMD ANPVAVVEAL IHINNQLHQH EAAVGILTYA QQHLDVQLKE SWYEKLQRWD DALKAYTLKA
1401: SQTTNPHLVL EATLGQMRCL AALARWEELN NLCKEYWSPA EPSARLEMAP MAAQAAWNMG EWDQMAEYVS RLDDGDETKL RGLASPVSSG DGSSNGTFFR
1501: AVLLVRRAKY DEAREYVERA RKCLATELAA LVLESYERAY SNMVRVQQLS ELEEVIEYYT LPVGNTIAEE RRALIRNMWT QRIQGSKRNV EVWQALLAVR
1601: ALVLPPTEDV ETWLKFASLC RKSGRISQAK STLLKLLPFD PEVSPENMQY HGPPQVMLGY LKYQWSLGEE RKRKEAFTKL QILTRELSSV PHSQSDILAS
1701: MVSSKGANVP LLARVNLKLG TWQWALSSGL NDGSIQEIRD AFDKSTCYAP KWAKAWHTWA LFNTAVMSHY ISRGQIASQY VVSAVTGYFY SIACAANAKG
1801: VDDSLQDILR LLTLWFNHGA TADVQTALKT GFSHVNINTW LVVLPQIIAR IHSNNRAVRE LIQSLLIRIG ENHPQALMYP LLVACKSISN LRRAAAQEVV
1901: DKVRQHSGAL VDQAQLVSHE LIRVAILWHE MWHEALEEAS RLYFGEHNIE GMLKVLEPLH DMLDEGVKKD STTIQERAFI EAYRHELKEA HECCCNYKIT
2001: GKDAELTQAW DLYYHVFKRI DKQLASLTTL DLESVSPELL LCRDLELAVP GTYRADAPVV TISSFSRQLV VITSKQRPRK LTIHGNDGED YAFLLKGHED
2101: LRQDERVMQL FGLVNTLLEN SRKTAEKDLS IQRYSVIPLS PNSGLIGWVP NCDTLHHLIR EHRDARKIIL NQENKHMLSF APDYDNLPLI AKVEVFEYAL
2201: ENTEGNDLSR VLWLKSRSSE VWLERRTNYT RSLAVMSMVG YILGLGDRHP SNLMLHRYSG KILHIDFGDC FEASMNREKF PEKVPFRLTR MLVKAMEVSG
2301: IEGNFRSTCE NVMQVLRTNK DSVMAMMEAF VHDPLINWRL FNFNEVPQLA LLGNNNPNAP ADVEPDEEDE DPADIDLPQP QRSTREKEIL QAVNMLGDAN
2401: EVLNERAVVV MARMSHKLTG RDFSSSAIPS NPIADHNNLL GGDSHEVEHG LSVKVQVQKL INQATSHENL CQNYVGWCPF W
Arabidopsis Description
TORTOR [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WN52]
SUBAcon: [plastid]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.