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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra006205.1-P Field mustard cytosol 90.83 91.79
CDX70509 Canola cytosol 91.08 91.25
VIT_13s0084g00680.t01 Wine grape cytosol 76.0 75.72
KRH30086 Soybean nucleus 75.2 74.65
KRH20701 Soybean cytosol, plasma membrane 63.32 72.41
Solyc01g096490.2.1 Tomato cytosol, nucleus 72.31 71.95
KRH62822 Soybean mitochondrion 29.11 66.06
KXG21921 Sorghum cytosol 65.35 65.27
TraesCS1A01G245000.3 Wheat cytosol 65.23 64.95
TraesCS1B01G256200.2 Wheat cytosol 64.86 64.62
TraesCS1D01G244900.2 Wheat plastid 63.45 64.6
GSMUA_Achr9P16290_001 Banana endoplasmic reticulum, golgi 27.75 63.17
Zm00001d038106_P002 Maize cytosol 63.2 62.39
Zm00001d010470_P005 Maize cytosol, nucleus, plasma membrane 63.14 51.84
HORVU7Hr1G076430.1 Barley plastid 4.92 36.53
HORVU7Hr1G076440.1 Barley plastid 5.17 30.11
Os05t0392050-00 Rice nucleus, plasma membrane 6.95 28.75
AT4G32250.1 Thale cress cytosol 8.98 23.9
Protein Annotations
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SEG:seg:::::
Description
KEGE3 ubiquitin-protein ligase KEG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9FY48]
Coordinates
chr5:+:4345202..4354723
Molecular Weight (calculated)
178225.0 Da
IEP (calculated)
6.156
GRAVY (calculated)
-0.245
Length
1625 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MVGRVKVPCC SVCHTRYNED ERVPLLLQCG HGFCKDCLSK MFSTSSDTTL TCPRCRHVSV VGNSVQGLRK NYAMLALIHA ASGGANFDCD YTDDEDDDDE
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0701: EKEGRELVQI LLAAGADPTA QDAQHGRTAL HTAAMANNVE LVRVILDAGV NANIRNVHNT IPLHMALARG ANSCVSLLLE SGSDCNIQDD EGDNAFHIAA
0801: DAAKMIRENL DWLIVMLRSP DAAVDVRNHS GKTVRDFLEA LPREWISEDL MEALLKRGVH LSPTIYEVGD WVKFKRGITT PLHGWQGAKP KSVGFVQTIL
0901: EKEDMIIAFC SGEARVLANE VVKLIPLDRG QHVRLRADVK EPRFGWRGQS RDSVGTVLCV DEDGILRVGF PGASRGWKAD PAEMERVEEF KVGDWVRIRQ
1001: NLTSAKHGFG SVVPGSMGIV YCVRPDSSLL VELSYLPNPW HCEPEEVEPV APFRIGDRVC VKRSVAEPRY AWGGETHHSV GKISEIENDG LLIIEIPNRP
1101: IPWQADPSDM EKIDDFKVGD WVRVKASVSS PKYGWEDITR NSIGVMHSLD EDGDVGIAFC FRSKPFSCSV TDVEKVTPFH VGQEIHMTPS ITQPRLGWSN
1201: ETPATIGKVM RIDMDGTLSA QVTGRQTLWR VSPGDAELLS GFEVGDWVRS KPSLGNRPSY DWSNVGRESI AVVHSIQETG YLELACCFRK GRWSTHYTDL
1301: EKIPALKVGQ FVHFQKGITE PRWGWRAAKP DSRGIITTVH ADGEVRVAFF GLPGLWRGDP ADLEVEPMFE VGEWVRLREG VSCWKSVGPG SVGVVHGVGY
1401: EGDEWDGTTS VSFCGEQERW AGPTSHLEKA KKLVVGQKTR VKLAVKQPRF GWSGHSHGSV GTISAIDADG KLRIYTPAGS KTWMLDPSEV ETIEEEELKI
1501: GDWVRVKASI TTPTYQWGEV NPSSTGVVHR MEDGDLCVSF CFLDRLWLCK AGELERIRPF RIGDRVKIKD GLVTPRWGWG METHASKGHV VGVDANGKLR
1601: IKFLWREGRP WIGDPADIVL DETSG
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.