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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: golgi, plasma membrane, endoplasmic reticulum

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • mitochondrion 2
  • endoplasmic reticulum 1
  • plasma membrane 1
  • golgi 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX74635 Canola cytosol, golgi, plasma membrane 81.46 83.38
Bra035381.1-P Field mustard cytosol, golgi, plasma membrane 81.46 83.38
CDY47297 Canola plasma membrane 81.38 83.29
GSMUA_Achr4P17470_001 Banana cytosol 42.09 63.87
GSMUA_AchrUn_... Banana cytosol 49.23 60.82
Zm00001d014297_P006 Maize cytosol 47.36 59.19
VIT_12s0057g00690.t01 Wine grape endoplasmic reticulum, golgi 63.69 58.88
PGSC0003DMT400015729 Potato cytosol 18.28 58.42
KRH14106 Soybean mitochondrion 59.52 57.14
KRH74010 Soybean mitochondrion, plasma membrane 59.01 56.84
Solyc07g047770.2.1 Tomato golgi 58.84 56.03
GSMUA_Achr1P22740_001 Banana cytosol 36.31 52.46
AT1G27320.1 Thale cress endoplasmic reticulum, golgi, plasma membrane 45.92 52.12
Os10t0362300-03 Rice extracellular 50.94 50.46
AT2G01830.2 Thale cress cytosol 44.3 48.24
AT1G66340.1 Thale cress plasma membrane 13.86 22.09
AT2G40940.1 Thale cress cytosol, nucleus, plasma membrane 11.31 21.7
AT5G10720.1 Thale cress nucleus 15.9 20.28
AT3G04580.1 Thale cress plasma membrane 12.59 19.32
AT3G23150.1 Thale cress endoplasmic reticulum, plasma membrane 12.67 19.28
AT2G17820.1 Thale cress cytosol, nucleus, plasma membrane 18.37 17.9
AT2G47430.1 Thale cress plasma membrane 16.07 16.84
AT1G04310.1 Thale cress endoplasmic reticulum 8.08 14.73
Protein Annotations
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InterPro:Sig_transdc_resp-reg_receiverTMHMM:TMhelixUniParc:UPI000004FA3BSEG:seg::
Description
AHK2Histidine kinase 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C5U2]
Coordinates
chr5:-:13911283..13916805
Molecular Weight (calculated)
131868.0 Da
IEP (calculated)
6.214
GRAVY (calculated)
-0.213
Length
1176 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MSITCELLNL TSKKAKKSSS SDKKWLKKPL FFLILCGSLV IVLVMFLRLG RSQKEETDSC NGEEKVLYRH QNVTRSEIHD LVSLFSDSDQ VTSFECHKES
0101: SPGMWTNYGI TCSLSVRSDK QETRGLPWNL GLGHSISSTS CMCGNLEPIL QQPENLEEEN HEEGLEQGLS SYLRNAWWCL ILGVLVCHKI YVSHSKARGE
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0401: EDRENILRAR ASGKGVLTSP FKLLKSNHLG VVLTFAVYDT SLPPDATEEQ RVEATIGYLG ASYDMPSLVE KLLHQLASKQ TIAVDVYDTT NTSGLIKMYG
0501: SEIGDISEQH ISSLDFGDPS RNHEMHCRFK HKLPIPWTAI TPSILVLVIT FLVGYILYEA INRIATVEED CQKMRELKAR AEAADIAKSQ FLATVSHEIR
0601: TPMNGVLGML KMLMDTDLDA KQMDYAQTAH GSGKDLTSLI NEVLDQAKIE SGRLELENVP FDMRFILDNV SSLLSGKANE KGIELAVYVS SQVPDVVVGD
0701: PSRFRQIITN LVGNSIKFTQ ERGHIFISVH LADEVKEPLT IEDAVLKQRL ALGCSESGET VSGFPAVNAW GSWKNFKTCY STESQNSDQI KLLVTVEDTG
0801: VGIPVDAQGR IFTPFMQADS STSRTYGGTG IGLSISKRLV ELMQGEMGFV SEPGIGSTFS FTGVFGKAET NTSITKLERF DLAIQEFTGL RALVIDNRNI
0901: RAEVTRYELR RLGISADIVS SLRMACTCCI SKLENLAMIL IDKDAWNKEE FSVLDELFTR SKVTFTRVPK IFLLATSATL TERSEMKSTG LIDEVVIKPL
1001: RMSVLICCLQ ETLVNGKKRQ PNRQRRNLGH LLREKQILVV DDNLVNRRVA EGALKKYGAI VTCVESGKAA LAMLKPPHNF DACFMDLQMP EMDGFEATRR
1101: VRELEREINK KIASGEVSAE MFCKFSSWHV PILAMTADVI QATHEECMKC GMDGYVSKPF EEEVLYTAVA RFFEPC
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.