Factsheet for AT5G67480.2

Subcellular Localization

min:

: max

Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:

nucleus 2
mitochondrion 1
cytosol 2

Predictors

GFP

MS/MS

Papers

Winner Takes All:	cytosol
Any Predictor:	cytosol, nucleus
BaCelLo:	nucleus
MultiLoc:	nucleus
PProwler:	mitochondrion
WoLF PSORT:	cytosol
YLoc:	cytosol

PPI

No PPI Data

Homology

Paralog

locus	Identity	Homology Identity

Ortholog

locus	Homology Species	Location	Identity	Homology Identity
CDY36495	Canola	cytosol	84.07	84.74
CDY08721	Canola	cytosol	83.29	83.95
Bra024446.1-P	Field mustard	cytosol	83.03	83.68
Solyc02g092460.2.1	Tomato	mitochondrion, nucleus	46.74	62.37
VIT_07s0129g00210.t01	Wine grape	cytosol, nucleus, plastid	57.96	59.84
AT4G37610.1	Thale cress	nucleus	55.35	57.61
KRH77116	Soybean	plastid	56.92	57.52
PGSC0003DMT400055194	Potato	nucleus	56.4	57.14
GSMUA_Achr6P24750_001	Banana	nucleus	53.52	53.95
AT1G05690.1	Thale cress	plastid	43.86	46.15
AT3G48360.1	Thale cress	nucleus	35.51	37.36
AT5G63160.1	Thale cress	nucleus	33.68	35.34

Protein Annotations

Gene3D:1.20.1020.10	Gene3D:1.25.40.420	MapMan:15.5.31	MapMan:19.2.2.8.2.2.4	Gene3D:3.30.710.10	EntrezGene:836884
ProteinID:AED98349.1	ProteinID:AED98350.1	EMBL:AF446873	ProteinID:ANM68746.1	ArrayExpress:AT5G67480	EnsemblPlantsGene:AT5G67480
RefSeq:AT5G67480	TAIR:AT5G67480	RefSeq:AT5G67480-TAIR-G	EnsemblPlants:AT5G67480.2	TAIR:AT5G67480.2	EMBL:AY052213
EMBL:AY316677	ProteinID:BAB08456.1	Symbol:BT4	InterPro:BTB/POZ_dom	GO:GO:0003674	GO:GO:0003712
GO:GO:0003824	GO:GO:0004402	GO:GO:0005488	GO:GO:0005515	GO:GO:0005516	GO:GO:0005575
GO:GO:0005622	GO:GO:0005623	GO:GO:0005634	GO:GO:0005737	GO:GO:0005773	GO:GO:0005774
GO:GO:0006139	GO:GO:0006355	GO:GO:0006464	GO:GO:0006950	GO:GO:0008150	GO:GO:0008152
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GO:GO:0009719	GO:GO:0009733	GO:GO:0009739	GO:GO:0009751	GO:GO:0009753	GO:GO:0009987
GO:GO:0016020	GO:GO:0016043	GO:GO:0016567	GO:GO:0016573	GO:GO:0016740	GO:GO:0019005
GO:GO:0019538	GO:GO:0030162	GO:GO:0031625	GO:GO:0042542	GO:GO:0042787	GO:GO:0043161
GO:GO:0046872	InterPro:IPR000197	InterPro:IPR000210	InterPro:IPR035898	RefSeq:NP_001330470.1	RefSeq:NP_201549.1
RefSeq:NP_975007.1	PFAM:PF00651	PFAM:PF02135	PO:PO:0000005	PO:PO:0000013	PO:PO:0000014
PO:PO:0000037	PO:PO:0000084	PO:PO:0000230	PO:PO:0000293	PO:PO:0001016	PO:PO:0001017
PO:PO:0001054	PO:PO:0001078	PO:PO:0001081	PO:PO:0001185	PO:PO:0004507	PO:PO:0007064
PO:PO:0007095	PO:PO:0007098	PO:PO:0007103	PO:PO:0007115	PO:PO:0007123	PO:PO:0007611
PO:PO:0007616	PO:PO:0008019	PO:PO:0009001	PO:PO:0009005	PO:PO:0009006	PO:PO:0009009
PO:PO:0009010	PO:PO:0009025	PO:PO:0009029	PO:PO:0009030	PO:PO:0009031	PO:PO:0009032
PO:PO:0009046	PO:PO:0009047	PO:PO:0009052	PO:PO:0020030	PO:PO:0020038	PO:PO:0020100
PO:PO:0020137	PO:PO:0025022	PO:PO:0025195	PO:PO:0025281	PFscan:PS50097	PANTHER:PTHR24413
PANTHER:PTHR24413:SF145	InterPro:SKP1/BTB/POZ_sf	SMART:SM00225	SMART:SM00551	InterPro:SPOP_C	SUPFAM:SSF54695
SUPFAM:SSF57933	InterPro:TAZ_dom_sf	UniParc:UPI000034F359	InterPro:Znf_TAZ	SEG:seg	:

Description

BT4BTB and TAZ domain protein 4 [Source:TAIR;Acc:AT5G67480]

Coordinates

chr5:-:26930940..26932825

Molecular Weight (calculated)

43820.5 Da

IEP (calculated)

9.594

GRAVY (calculated)

-0.383

Length

383 amino acids

Sequence
(BLAST)

001: MQGREDKLNK RMVTGCVDLH QSFKSADSSS VPIPPPLPSK SDGLKKKLGH SSVSTATRDM WDRLFNDGYK ADVVIYTDNG SIIYAHANIL GTASTVIKGM
101: LKQAKRHGKW HTISIRGVPH DAVRVFIRFL YSSCYEKEEM NEFIMHLLLL SHAYVVPQLK RVCEWHLEHG LLTTENVVDV FQLALLCDFP RLSLISHRMI
201: MKHFNELSAT EAWTAMKKSH PFLEKEVRDS VIIEANTRKE RMRKRNDQRI YSQLYEAMEA LVHICRDGCK TIGPHDKDFK PNHATCNYEA CKGLESLIRH
301: FAGCKLRVPG GCVHCKRMWQ LLELHSRVCA GSDQCRVPLC RNLKEKMEKQ SKKDESRWKL LVKNVLGSKK IGGSPFFLPV TNC

Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.