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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: nucleus

Predictor Summary:
  • nucleus 4
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:nucleus
Any Predictor:nucleus
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:nucleus
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:nucleus
YLoc:nucleus
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra011776.1-P Field mustard nucleus, plastid 86.14 84.76
CDY50978 Canola nucleus, plastid 86.14 84.76
CDX75666 Canola nucleus 85.87 84.49
Bra017839.1-P Field mustard nucleus 84.78 82.32
CDY29568 Canola nucleus 84.78 82.32
CDX72641 Canola nucleus, plastid 84.78 82.11
AT5G67480.2 Thale cress cytosol 57.61 55.35
VIT_07s0129g00210.t01 Wine grape cytosol, nucleus, plastid 54.89 54.45
Solyc02g092460.2.1 Tomato mitochondrion, nucleus 41.3 52.96
KRH77116 Soybean plastid 52.45 50.92
PGSC0003DMT400055194 Potato nucleus 48.37 47.09
GSMUA_Achr6P24750_001 Banana nucleus 47.83 46.32
AT1G05690.1 Thale cress plastid 42.39 42.86
AT3G48360.1 Thale cress nucleus 36.14 36.54
AT5G63160.1 Thale cress nucleus 34.51 34.79
Protein Annotations
Gene3D:1.20.1020.10Gene3D:1.25.40.420MapMan:15.5.31MapMan:19.2.2.8.2.2.4Gene3D:3.30.710.10EntrezGene:829915
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RefSeq:AT4G37610-TAIR-GEnsemblPlants:AT4G37610.1TAIR:AT4G37610.1EMBL:AY084954EMBL:AY316678Unigene:At.28153
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PO:PO:0025022PO:PO:0025281PFscan:PS50097PFscan:PS50134PANTHER:PTHR24413PANTHER:PTHR24413:SF145
UniProt:Q6EJ98InterPro:SKP1/BTB/POZ_sfSMART:SM00225SMART:SM00551InterPro:SPOP_CSUPFAM:SSF54695
SUPFAM:SSF57933InterPro:TAZ_dom_sfUniParc:UPI0000162BB1InterPro:Znf_TAZSEG:seg:
Description
BT5BTB/POZ and TAZ domain-containing protein 5 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q6EJ98]
Coordinates
chr4:-:17670481..17672353
Molecular Weight (calculated)
42316.5 Da
IEP (calculated)
8.646
GRAVY (calculated)
-0.391
Length
368 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MENMDDFSPE NVLAPPPPPP PMKKSTDLFM QRSNSFVSKA TRDSWDRMFD EAHGADVLIH TDDNGLIYAH SNVIGMASDV IRGMMKQHKR KSHRKSISIL
101: GVPHHALRVF IRFLYSSCYE KQDMEDFAIH LLVLSHVYVV PHLKRVCESE FESSLLNKEN VIDVFQLALL CDAPRLGLLC HRMILNNFEE VSTSEGWQAM
201: KESHPRLQKE LLRSVAYELN SLKQRNRKQK EIQTYTQLYE AMEAFVHICR DGCREIGPTK TETPHMSCGF QACNGLEQLL KHLAGCKLRS IPGGCSRCKR
301: MWQLLELHSR ICVDSEQCKV PLCSSLKERM KTQSRKDEKR WKLLVRNVLS TKRIGGSPFF LQAIDVTL
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.