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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • plastid 2
  • mitochondrion 2
  • cytosol 2
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
AT4G37670.2 Thale cress plastid 40.72 40.46
KRH28345 Soybean plastid 36.62 36.74
KRH77140 Soybean plastid 35.96 36.2
GSMUA_Achr6P33530_001 Banana plastid 7.55 7.68
Solyc03g043950.2.1 Tomato plastid 7.06 7.13
PGSC0003DMT400023399 Potato plastid 6.9 6.97
HORVU3Hr1G070270.2 Barley cytosol 3.45 4.78
Zm00001d048574_P001 Maize plastid 5.25 4.42
TraesCS7D01G240100.2 Wheat mitochondrion, plastid 3.78 3.83
TraesCS7B01G136600.1 Wheat plastid 3.78 3.76
EER94644 Sorghum plastid 3.61 3.64
Protein Annotations
KEGG:00220+2.3.1.1Gene3D:3.40.630.30MapMan:4.1.1.1.1.1EntrezGene:816822ProteinID:AAC32438.1ProteinID:AEC07372.1
ArrayExpress:AT2G22910EnsemblPlantsGene:AT2G22910RefSeq:AT2G22910TAIR:AT2G22910RefSeq:AT2G22910-TAIR-GEnsemblPlants:AT2G22910.1
TAIR:AT2G22910.1InterPro:AceGlu_kinase-like_sfInterPro:Acyl_CoA_acyltransferaseInterPro:Asp/Glu/Uridylate_kinaseEMBL:BT004254EMBL:BT006149
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GO:GO:0016746GO:GO:0103045InterPro:IPR000182InterPro:IPR036393HAMAP:MF_01105Symbol:NAGS1
InterPro:NAGS_kinInterPro:NH2A_AcTrfaseRefSeq:NP_179875.2PFAM:PF00583PFAM:PF00696PO:PO:0000013
PO:PO:0000037PO:PO:0000230PO:PO:0000293PO:PO:0001054PO:PO:0001078PO:PO:0001081
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PFscan:PS51186PANTHER:PTHR30602PANTHER:PTHR30602:SF4UniProt:Q84JF4SUPFAM:SSF53633SUPFAM:SSF55729
TIGRFAMs:TIGR01890UniParc:UPI000000C303::::
Description
NAGS1Probable amino-acid acetyltransferase NAGS1, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q84JF4]
Coordinates
chr2:+:9749857..9753103
Molecular Weight (calculated)
67182.8 Da
IEP (calculated)
7.419
GRAVY (calculated)
-0.117
Length
609 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MTERGAMVVS SSTCYVPFRC PQARKDFAFV EPSKKLNPNR VLIKPPVYTY SPALTAAKCN IFDYAETGEN LVGDKQFVRW FREAWPYLWA HRSCTFVVTI
101: SGDVLDGPYC DLVLKDIAFL HHLGIKFVLV PGTQVQIDQL LAERGREPTY VGRYRVTDSA SLQAAKEAAG AISVMIEAKL SPGPSIYNIR RHGDSSRLHE
201: TGVRVDTGNF FAAKRRGVVD GVDFGATGLV KKIDVDRIRE RLDSGSVVLL RNLGHSSTGE VLNCNTYEVA TACALAIGAD KLICIMDGPV LDENGHLVRF
301: LTLQEADTLV RKRAQQSEIA ANYVKAVGDG GISSFPEPLG YNGMVTTPNN HIGRPIWEKL SPTFQNGVGF DNGNGLWSGE QGFAIGGEER ISRLNGYLSE
401: LAAAAFVCRG GVKRVHLLDG TISGVLLLEL FKRDGMGTMV ASDVYEGNRE AKVEDLAGIR QIIKPLEESG ALVRRTDEEL LRALDSFVVV EREGHIIACA
501: ALFPFFEEKC GEVAAIAVAS DCRGQGQGDK LLDYIEKKAS ALGLEMLFLL TTRTADWFVR RGFQECPIEM IPEARRERIN LSRRSKYYMK KLLPDRSGIS
601: VVRTFQYDS
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.