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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 2
  • cytosol 2
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra035280.1-P Field mustard mitochondrion 68.32 87.97
CDY53519 Canola mitochondrion 68.03 87.92
CDX86845 Canola nucleus 70.22 74.34
Solyc08g066730.2.1 Tomato nucleus 64.09 59.4
PGSC0003DMT400011022 Potato cytosol, nucleus, plastid 64.09 59.4
GSMUA_Achr11P... Banana nucleus 52.7 58.89
VIT_02s0025g02400.t01 Wine grape nucleus 64.53 57.85
KRH06595 Soybean cytosol, nucleus, plastid 62.63 56.37
TraesCS6B01G270600.1 Wheat nucleus 57.08 56.18
KRH48077 Soybean nucleus 62.19 55.91
TraesCS6A01G254900.1 Wheat nucleus 56.93 55.56
EES07469 Sorghum cytosol 57.23 55.52
TraesCS6D01G236200.1 Wheat nucleus 56.79 55.41
Zm00001d017566_P001 Maize extracellular 56.79 55.26
GSMUA_Achr8P11830_001 Banana nucleus 56.93 54.93
Os02t0672600-01 Rice nucleus 56.5 54.82
HORVU6Hr1G064940.1 Barley mitochondrion 57.08 53.12
AT4G09980.1 Thale cress nucleus 16.93 12.05
Protein Annotations
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InterPro:SAM-dependent_MTasesSUPFAM:SSF53335UniParc:UPI00000A4C32SEG:seg::
Description
MTAN6-adenosine-methyltransferase MT-A70-like [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O82486]
Coordinates
chr4:-:6619817..6623381
Molecular Weight (calculated)
76649.3 Da
IEP (calculated)
6.595
GRAVY (calculated)
-0.453
Length
685 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: METESDDATI TVVKDMRVRL ENRIRTQHDA HLDLLSSLQS IVPDIVPSLD LSLKLISSFT NRPFVATPPL PEPKVEKKHH PIVKLGTQLQ QLHGHDSKSM
101: LVDSNQRDAE ADGSSGSPMA LVRAMVAECL LQRVPFSPTD SSTVLRKLEN DQNARPAEKA ALRDLGGECG PILAVETALK SMAEENGSVE LEEFEVSGKP
201: RIMVLAIDRT RLLKELPESF QGNNESNRVV ETPNSIENAT VSGGGFGVSG SGNFPRPEMW GGDPNMGFRP MMNAPRGMQM MGMHHPMGIM GRPPPFPLPL
301: PLPVPSNQKL RSEEEDLKDV EALLSKKSFK EKQQSRTGEE LLDLIHRPTA KEAATAAKFK SKGGSQVKYY CRYLTKEDCR LQSGSHIACN KRHFRRLIAS
401: HTDVSLGDCS FLDTCRHMKT CKYVHYELDM ADAMMAGPDK ALKPLRADYC SEAELGEAQW INCDIRSFRM DILGTFGVVM ADPPWDIHME LPYGTMADDE
501: MRTLNVPSLQ TDGLIFLWVT GRAMELGREC LELWGYKRVE EIIWVKTNQL QRIIRTGRTG HWLNHSKEHC LVGIKGNPEV NRNIDTDVIV AEVRETSRKP
601: DEMYAMLERI MPRARKLELF ARMHNAHAGW LSLGNQLNGV RLINEGLRAR FKASYPEIDV QPPSPPRASA METDNEPMAI DSITA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.