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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 8
  • nucleus 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:plastid
Any Predictor:nucleus, plastid
BaCelLo:plastid
ChloroP:plastid
iPSORT:plastid
MultiLoc:plastid
Predotar:plastid
PProwler:plastid
TargetP:plastid
WoLF PSORT:plastid
YLoc:nucleus
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra036577.1-P Field mustard plastid 85.12 85.98
CDY19771 Canola plastid 84.62 85.84
CDX87051 Canola plastid 84.62 85.62
Bra020538.1-P Field mustard plastid 80.18 83.32
CDY65142 Canola plastid 81.02 73.69
CDY05529 Canola plastid 80.69 73.55
KRG93123 Soybean cytosol 18.31 72.28
VIT_05s0062g00890.t01 Wine grape cytosol 55.43 69.94
GSMUA_Achr9P07400_001 Banana endoplasmic reticulum, plasma membrane 46.74 64.48
KRH36357 Soybean plastid 61.12 63.18
HORVU7Hr1G008070.7 Barley mitochondrion 56.35 59.02
Solyc09g098040.2.1 Tomato plastid 58.86 58.76
PGSC0003DMT400042818 Potato cytosol 59.03 58.74
TraesCS4A01G444300.1 Wheat plastid 56.94 57.91
TraesCS7D01G039500.4 Wheat plastid 57.02 57.89
TraesCS7A01G043700.1 Wheat plastid 56.94 57.71
Zm00001d023792_P005 Maize cytosol 53.09 56.55
Os12t0297500-01 Rice plastid 56.19 55.72
KXG29990 Sorghum plastid 56.35 55.38
VIT_05s0062g00900.t01 Wine grape plastid 9.2 40.0
AT4G24440.1 Thale cress cytosol 1.42 16.04
AT1G10760.1 Thale cress cytosol, plastid 18.06 15.44
AT4G24450.3 Thale cress cytosol 16.39 15.34
Protein Annotations
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UniProt:Q6ZY51SMART:SM01065SUPFAM:SSF49452SUPFAM:SSF56059UniParc:UPI0000353BB5SEG:seg
Description
GWD3Phosphoglucan, water dikinase, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q6ZY51]
Coordinates
chr5:+:9261479..9267732
Molecular Weight (calculated)
131330.0 Da
IEP (calculated)
6.159
GRAVY (calculated)
-0.336
Length
1196 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MESIGSHCCS SPFTFITRNS SSSLPRLVNI THRVNLSHQS HRLRNSNSRL TCTATSSSTI EEQRKKKDGS GTKVRLNVRL DHQVNFGDHV AMFGSAKEIG
0101: SWKKKSPLNW SENGWVCELE LDGGQVLEYK FVIVKNDGSL SWESGDNRVL KVPNSGNFSV VCHWDATRET LDLPQEVGND DDVGDGGHER DNHDVGDDRV
0201: VGSENGAQLQ KSTLGGQWQG KDASFMRSND HGNREVGRNW DTSGLEGTAL KMVEGDRNSK NWWRKLEMVR EVIVGSVERE ERLKALIYSA IYLKWINTGQ
0301: IPCFEDGGHH RPNRHAEISR LIFRELEHIC SKKDATPEEV LVARKIHPCL PSFKAEFTAA VPLTRIRDIA HRNDIPHDLK QEIKHTIQNK LHRNAGPEDL
0401: IATEAMLQRI TETPGKYSGD FVEQFKIFHN ELKDFFNAGS LTEQLDSMKI SMDDRGLSAL NLFFECKKRL DTSGESSNVL ELIKTMHSLA SLRETIIKEL
0501: NSGLRNDAPD TAIAMRQKWR LCEIGLEDYF FVLLSRFLNA LETMGGADQL AKDVGSRNVA SWNDPLDALV LGVHQVGLSG WKQEECLAIG NELLAWRERD
0601: LLEKEGEEDG KTIWAMRLKA TLDRARRLTA EYSDLLLQIF PPNVEILGKA LGIPENSVKT YTEAEIRAGI IFQISKLCTV LLKAVRNSLG SEGWDVVVPG
0701: STSGTLVQVE SIVPGSLPAT SGGPIILLVN KADGDEEVSA ANGNIAGVML LQELPHLSHL GVRARQEKIV FVTCDDDDKV ADIRRLVGKF VRLEASPSHV
0801: NLILSTEGRS RTSKSSATKK TDKNSLSKKK TDKKSLSIDD EESKPGSSSS NSLLYSSKDI PSGGIIALAD ADVPTSGSKS AACGLLASLA EASSKVHSEH
0901: GVPASFKVPT GVVIPFGSME LALKQNNSEE KFASLLEKLE TARPEGGELD DICDQIHEVM KTLQVPKETI NSISKAFLKD ARLIVRSSAN VEDLAGMSAA
1001: GLYESIPNVS PSDPLVFSDS VCQVWASLYT RRAVLSRRAA GVSQREASMA VLVQEMLSPD LSFVLHTVSP ADPDSNLVEA EIAPGLGETL ASGTRGTPWR
1101: LASGKLDGIV QTLAFANFSE ELLVSGTGPA DGKYVRLTVD YSKKRLTVDS VFRQQLGQRL GSVGFFLERN FGCAQDVEGC LVGEDVYIVQ SRPQPL
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.