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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 8
  • cytosol 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY35656 Canola plastid 88.66 89.32
CDY14380 Canola plastid 88.06 88.59
Bra003055.1-P Field mustard plastid 87.46 87.99
VIT_16s0098g00330.t01 Wine grape plastid 65.37 65.37
KRH64464 Soybean plastid 65.07 64.78
KRH53484 Soybean plastid 64.93 64.64
Solyc03g083420.2.1 Tomato cytosol, plastid 60.9 60.9
PGSC0003DMT400023542 Potato cytosol 60.3 60.3
GSMUA_Achr3P25130_001 Banana plastid 54.03 54.27
TraesCS3A01G237400.1 Wheat plastid 52.54 54.24
EES01191 Sorghum plastid 52.24 54.1
Os01t0655500-01 Rice plastid 52.24 53.85
TraesCS3D01G237800.1 Wheat plastid 52.09 53.77
HORVU3Hr1G059130.8 Barley plastid 52.24 53.76
Zm00001d044018_P001 Maize plastid 20.15 51.72
TraesCS3B01G266000.1 Wheat plastid 38.21 49.42
Zm00001d044017_P001 Maize cytosol 33.28 38.45
Protein Annotations
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EnsemblPlants:AT5G53450.1TAIR:AT5G53450.1EMBL:AY065207Unigene:At.28565ProteinID:BAA97322.1EMBL:BT002001
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PFscan:PS50011PANTHER:PTHR24056PANTHER:PTHR24056:SF335InterPro:Prot_kinase_domUniProt:Q9LV04SMART:SM00220
SUPFAM:SSF56112UniParc:UPI00000AC18F::::
Description
PAP14Probable plastid-lipid-associated protein 14, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9LV04]
Coordinates
chr5:+:21688773..21692480
Molecular Weight (calculated)
75770.7 Da
IEP (calculated)
9.814
GRAVY (calculated)
-0.242
Length
670 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MALCGVCSTP NLPNLQVFRS VRNSSIGYKR NHSLWQLRSS SFRAKSVIFH CSSSLRQSPS NVEEIDDNPS VSLEDESAHV MQFKWSDFRI LDRVSIGHGG
101: RADELVFEAI VQVPDSPLFN QGVVLRKLNT TRAQRRGRRA IEVFKKLVRR RLLYHSYSMQ VHGYITNNLS DDQYSFTLVH GCHGSFSIRH WLQQSDWIPT
201: LEATLALDEE SFRRVGDDTT GGPAVSRQLR LIRTLMRDIL IGVNYLHSHG LAHTELRLEN VHISPVDRHI KVGILGNAAD FNGDVPSTSN AYSTMDRRQM
301: MIAFDMRCVG FMMAKMVLQE LMDPLIFAKL KSFLAKGNDP SSLREFFVTT LNTNSESGNT GVQILDRNWG AGWHLLSLLI ATRPSERISC LDALKHPFLC
401: GPRWRVAPSM DIIRWGLGST AVKISEEYIY RMPQRQRLAH FIGLMEMLNP YPKPNCWLEL LPGRWRLLYS TGKHIGLTLR QPSTRALIGN VHLTITRASE
501: SINNTSLSFT SDIRFTAITS KDWPHNKIGA AGKLQTLSQF RLIAGKRLYL KEEKKNIGKF SMGEPDAEEG LAEKLETEKW KKVVPFKEFP SSLPVAKLVS
601: GEIEVTMNMN DHIDSPGSVI GEVRKQIPPE MFDLSKLVCG TYIDSRLLVL RCVNGSALLF TRSSLDHKSM
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.