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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 2
  • plastid 3
  • cytosol 2
  • plasma membrane 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus, plasma membrane, plastid
BaCelLo:nucleus
EpiLoc:plastid
MultiLoc:cytosol
Plant-mPloc:plasma membrane
PProwler:plastid
TargetP:plastid
WoLF PSORT:nucleus
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra002669.1-P Field mustard cytosol 87.76 91.04
CDY62690 Canola cytosol 90.49 90.59
Bra020388.1-P Field mustard cytosol 87.21 90.58
CDY43878 Canola cytosol 90.27 90.47
CDY58574 Canola cytosol 89.95 89.46
CDY32722 Canola cytosol 89.73 89.34
CDX88659 Canola cytosol 90.05 89.18
CDY02797 Canola cytosol 89.29 89.0
Bra006782.1-P Field mustard cytosol 86.99 88.25
KRH45318 Soybean cytosol 15.85 80.56
Solyc01g097770.2.1 Tomato plastid 71.8 68.8
Os04t0304200-01 Rice plasma membrane 57.7 68.48
KRH07591 Soybean cytosol 73.77 68.18
VIT_03s0038g04210.t01 Wine grape cytosol 72.79 66.53
GSMUA_Achr8P25430_001 Banana cytosol 66.12 64.91
KRH45326 Soybean cytosol 57.81 64.83
TraesCS2B01G290500.1 Wheat cytosol 63.28 64.77
TraesCS2A01G272400.1 Wheat cytosol 62.95 64.65
TraesCS2D01G271600.1 Wheat cytosol 62.84 64.32
EES14872 Sorghum cytosol 61.75 63.48
Zm00001d032353_P001 Maize cytosol 61.42 60.3
AT3G45780.2 Thale cress cytosol 58.69 53.92
AT4G13000.1 Thale cress cytosol 13.88 34.14
AT3G20830.1 Thale cress cytosol, plastid 15.19 34.07
AT1G51170.1 Thale cress plastid 14.86 33.66
AT3G25250.1 Thale cress cytosol 14.86 32.3
Protein Annotations
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EMBL:U79744UniParc:UPI00000A015ESEG:seg:::
Description
PHOT2Phototropin-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P93025]
Coordinates
chr5:+:23523825..23533111
Molecular Weight (calculated)
102478.0 Da
IEP (calculated)
7.451
GRAVY (calculated)
-0.560
Length
915 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MERPRAPPSP LNDAESLSER RSLEIFNPSS GKETHGSTSS SSKPPLDGNN KGSSSKWMEF QDSAKITERT AEWGLSAVKP DSGDDGISFK LSSEVERSKN
101: MSRRSSEEST SSESGAFPRV SQELKTALST LQQTFVVSDA TQPHCPIVYA SSGFFTMTGY SSKEIVGRNC RFLQGPDTDK NEVAKIRDCV KNGKSYCGRL
201: LNYKKDGTPF WNLLTVTPIK DDQGNTIKFI GMQVEVSKYT EGVNDKALRP NGLSKSLIRY DARQKEKALD SITEVVQTIR HRKSQVQESV SNDTMVKPDS
301: STTPTPGRQT RQSDEASKSF RTPGRVSTPT GSKLKSSNNR HEDLLRMEPE ELMLSTEVIG QRDSWDLSDR ERDIRQGIDL ATTLERIEKN FVISDPRLPD
401: NPIIFASDSF LELTEYSREE ILGRNCRFLQ GPETDQATVQ KIRDAIRDQR EITVQLINYT KSGKKFWNLF HLQPMRDQKG ELQYFIGVQL DGSDHVEPLQ
501: NRLSERTEMQ SSKLVKATAT NVDEAVRELP DANTRPEDLW AAHSKPVYPL PHNKESTSWK AIKKIQASGE TVGLHHFKPI KPLGSGDTGS VHLVELKGTG
601: ELYAMKAMEK TMMLNRNKAH RACIEREIIS LLDHPFLPTL YASFQTSTHV CLITDFCPGG ELFALLDRQP MKILTEDSAR FYAAEVVIGL EYLHCLGIVY
701: RDLKPENILL KKDGHIVLAD FDLSFMTTCT PQLIIPAAPS KRRRSKSQPL PTFVAEPSTQ SNSFVGTEEY IAPEIITGAG HTSAIDWWAL GILLYEMLYG
801: RTPFRGKNRQ KTFANILHKD LTFPSSIPVS LVGRQLINTL LNRDPSSRLG SKGGANEIKQ HAFFRGINWP LIRGMSPPPL DAPLSIIEKD PNAKDIKWED
901: DGVLVNSTDL DIDLF
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.