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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • plastid 2
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus, plastid
BaCelLo:nucleus
ChloroP:plastid
MultiLoc:cytosol
PProwler:mitochondrion
TargetP:plastid
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra019474.1-P Field mustard nucleus, plastid 89.56 92.63
CDY30927 Canola cytosol 86.55 92.09
CDX77857 Canola cytosol 65.46 89.44
VIT_06s0004g03700.t01 Wine grape cytosol, plastid 73.19 72.61
KRH22966 Soybean nucleus, plastid 69.98 70.98
Solyc11g072710.1.1 Tomato plastid 72.39 70.89
GSMUA_Achr4P30620_001 Banana cytosol 65.66 70.63
KRH10351 Soybean nucleus, plastid 67.77 70.17
PGSC0003DMT400065251 Potato cytosol 71.89 70.13
Os12t0101800-02 Rice mitochondrion 46.69 69.61
KRH24973 Soybean cytosol 68.17 69.5
EES15492 Sorghum cytosol 63.25 69.0
Zm00001d044599_P001 Maize cytosol, nucleus, plastid 63.05 68.94
HORVU5Hr1G049160.8 Barley cytosol 62.95 68.23
TraesCS5D01G162400.1 Wheat cytosol 62.85 67.68
TraesCS5A01G157000.1 Wheat cytosol 61.95 67.07
Os11t0102200-00 Rice cytosol, plasma membrane, plastid 61.85 66.88
GSMUA_Achr7P10360_001 Banana cytosol 63.96 66.29
TraesCS5B01G155200.4 Wheat cytosol 62.75 65.38
AT5G58140.2 Thale cress cytosol 53.92 58.69
AT3G20830.1 Thale cress cytosol, plastid 14.26 34.8
AT1G51170.1 Thale cress plastid 13.86 34.16
AT4G13000.1 Thale cress cytosol 12.55 33.6
AT3G25250.1 Thale cress cytosol 13.35 31.59
Protein Annotations
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PO:PO:0025022PO:PO:0025281ScanProsite:PS00107ScanProsite:PS00108PFscan:PS50011PFscan:PS50112
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UniParc:UPI00001303E1SEG:seg::::
Description
PHOT1RPT1 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178VFT4]
Coordinates
chr3:+:16818347..16824210
Molecular Weight (calculated)
111695.0 Da
IEP (calculated)
7.729
GRAVY (calculated)
-0.636
Length
996 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MEPTEKPSTK PSSRTLPRDT RGSLEVFNPS TQLTRPDNPV FRPEPPAWQN LSDPRGTSPQ PRPQQEPAPS NPVRSDQEIA VTTSWMALKD PSPETISKKT
101: ITAEKPQKSA VAAEQRAAEW GLVLKTDTKT GKPQGVGVRN SGGTENDPNG KKTTSQRNSQ NSCRSSGEMS DGDVPGGRSG IPRVSEDLKD ALSTFQQTFV
201: VSDATKPDYP IMYASAGFFN MTGYTSKEVV GRNCRFLQGS GTDADELAKI RETLAAGNNY CGRILNYKKD GTSFWNLLTI APIKDESGKV LKFIGMQVEV
301: SKHTEGAKEK ALRPNGLPES LIRYDARQKD MATNSVTELV EAVKRPRALS ESTNLHPFMT KSESDELPKK PARRMSENVV PSGRRNSGGG RRNSMQRINE
401: IPEKKSRKSS LSFMGIKKKS ESLDESIDDG FIEYGEEDDE ISDRDERPES VDDKVRQKEM RKGIDLATTL ERIEKNFVIT DPRLPDNPII FASDSFLELT
501: EYSREEILGR NCRFLQGPET DLTTVKKIRN AIDNQTEVTV QLINYTKSGK KFWNIFHLQP MRDQKGEVQY FIGVQLDGSK HVEPVRNVIE ETAVKEGEDL
601: VKKTAVNIDE AVRELPDANM TPEDLWANHS KVVHCKPHRK DSPPWIAIQK VLESGEPIGL KHFKPVKPLG SGDTGSVHLV ELVGTDQLFA MKAMDKAVML
701: NRNKVHRARA EREILDLLDH PFLPALYASF QTKTHICLIT DYYPGGELFM LLDRQPRKVL KEDAVRFYAA QVVVALEYLH CQGIIYRDLK PENVLIQGNG
801: DISLSDFDLS CLTSCKPQLL IPSIDEKKKK KQQKSQQTPI FMAEPMRASN SFVGTEEYIA PEIISGAGHT SAVDWWALGI LMYEMLYGYT PFRGKTRQKT
901: FTNVLQKDLK FPASIPASLQ VKQLIFRLLQ RDPKKRLGCF EGANEVKQHS FFKGINWALI RCTNPPELET PIFSGEAENG EKVVDPELED LQTNVF
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.