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Sorghum
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Sorghum
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 3
  • plastid 1
  • plasma membrane 1
  • mitochondrion 1
  • cytosol 2
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, mitochondrion, nucleus, plasma membrane, plastid
BaCelLo:nucleus
ChloroP:plastid
EpiLoc:nucleus
MultiLoc:nucleus
Plant-mPloc:plasma membrane
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Zm00001d044599_P001 Maize cytosol, nucleus, plastid 94.19 94.4
Os12t0101800-02 Rice mitochondrion 62.87 85.93
HORVU5Hr1G049160.8 Barley cytosol 83.9 83.35
TraesCS5D01G162400.1 Wheat cytosol 83.68 82.59
TraesCS5A01G157000.1 Wheat cytosol 82.26 81.63
Os11t0102200-00 Rice cytosol, plasma membrane, plastid 82.04 81.32
TraesCS5B01G155200.4 Wheat cytosol 83.24 79.5
GSMUA_Achr4P30620_001 Banana cytosol 74.26 73.22
GSMUA_Achr7P10360_001 Banana cytosol 73.06 69.41
CDX77857 Canola cytosol 53.23 66.67
CDY30927 Canola cytosol 67.8 66.13
VIT_06s0004g03700.t01 Wine grape cytosol, plastid 71.19 64.74
KRH22966 Soybean nucleus, plastid 68.46 63.65
KRH24973 Soybean cytosol 67.8 63.36
AT3G45780.2 Thale cress cytosol 69.0 63.25
Bra019474.1-P Field mustard nucleus, plastid 66.27 62.82
KRH10351 Soybean nucleus, plastid 65.83 62.47
Solyc11g072710.1.1 Tomato plastid 68.46 61.46
PGSC0003DMT400065251 Potato cytosol 68.46 61.21
EES14872 Sorghum cytosol 54.33 55.73
EER99080 Sorghum cytosol, nucleus, peroxisome 15.33 31.96
EES11030 Sorghum cytosol 15.12 29.93
EES15407 Sorghum cytosol 14.24 29.35
EES07111 Sorghum plastid 14.68 26.91
Protein Annotations
Gene3D:1.10.510.10MapMan:18.4.6.5MapMan:20.5.1MapMan:26.1.2.2.1Gene3D:3.30.200.20Gene3D:3.30.450.20
EntrezGene:8072895UniProt:C5YPQ1EnsemblPlants:EES15492ProteinID:EES15492ProteinID:EES15492.1GO:GO:0000155
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InterPro:IPR000014InterPro:IPR000700InterPro:IPR000719InterPro:Kinase-like_dom_sfInterPro:PACInterPro:PAS
InterPro:PAS-assoc_CInterPro:PAS-like_dom_sfPFAM:PF00069PFAM:PF13426ScanProsite:PS00107ScanProsite:PS00108
PFscan:PS50011PFscan:PS50112PFscan:PS50113PANTHER:PTHR24351PANTHER:PTHR24351:SF173InterPro:Prot_kinase_dom
InterPro:Protein_kinase_ATP_BSSMART:SM00086SMART:SM00091SMART:SM00220EnsemblPlantsGene:SORBI_3008G001000SUPFAM:SSF55785
SUPFAM:SSF56112unigene:Sbi.3910InterPro:Ser/Thr_kinase_ASTIGRFAMs:TIGR00229UniParc:UPI0001A879C4RefSeq:XP_002441654.1
SEG:seg:::::
Description
hypothetical protein
Coordinates
chr8:+:61503..70960
Molecular Weight (calculated)
101797.0 Da
IEP (calculated)
8.349
GRAVY (calculated)
-0.506
Length
913 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MAFKGGGLAR DSRGSLEVFN PDAAAVSSSA AASTTNNRAF LLPPAAGAGD ADVGRATQRA AEWGLVLQTD EHTGRPQGVV ARPSGSNRTS ESGNSIDDDS
101: SRAAAAGTRA LPRVSEELRA ALSAFQQTFV VSDATRPDYP ILYASAGFFN MTGYSSNEVV GRNCRFLQGS GTDPVEISKI RQALAAGSNY CGRILNYKKD
201: GTPFWNLLTV APIKDEDGRV LKFIGMQVEV SKYTEGSKDT ALRPNGLPES LIKYDARQKD HARSSVSELL LALKDPRSLS ESRNNTLKRK SQESGDVLLG
301: EVPGKRSSES GSRRNSRSGM RNSLQKISEV PEGGNKTRKS GLRSFMGLIG MGHGNVEKNI LKPREDPLLD SDDERPESFD DDFRRKEMRR GIDLATTLER
401: IEKNFVITDP RLPDNPIIFA SDSFLRLTEY CREEILGRNC RFLQGPETDR GTVKKIRDAI DNQTEVTVQL INYTKSGKKF WNLFHLQPMR DQKGEVQYFI
501: GVQLDGTERV RDTAAKDGAM MVKKTADNID EAAKELPDAN LRPEDLWANH SKPVLPKPHM KDTASWRAIQ KVLENGENID LKHFRPVRPL GSGDTGSVHL
601: VELLGTGEYF AMKAMDKSVM LNRNKVHRAT AERQILDMLD HPFLPTLYAS FQTKTHVCLI TDYYAGGELF MLLDRQPMKV LKEDAVRFYA AEVVTALEYL
701: HCQGIIYRDL KPENILLQRD GHISLTDFDL SCLTSCQPQV FLPEDDKKKR RRKSRSNPIF FAEPMRASNS FVGTEEYIAP EIITGAGHTS AVDWWALGIL
801: LYEMLYGYTP FRGKTRQRTF ANILHKDIRF PASIQVSLAA RQLIYRLLHR DPANRLGSYE GAIEIKQHPF FRGINWALVR AATPPELEAP LQDTLEATGE
901: TLPPPDSAHT DMF
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT3G45780.1 )
(BLAST)
001: MEPTEKPSTK PSSRTLPRDT RGSLEVFNPS TQLTRPDNPV FRPEPPAWQN LSDPRGTSPQ PRPQQEPAPS NPVRSDQEIA VTTSWMALKD PSPETISKKT
101: ITAEKPQKSA VAAEQRAAEW GLVLKTDTKT GKPQGVGVRN SGGTENDPNG KKTTSQRNSQ NSCRSSGEMS DGDVPGGRSG IPRVSEDLKD ALSTFQQTFV
201: VSDATKPDYP IMYASAGFFN MTGYTSKEVV GRNCRFLQGS GTDADELAKI RETLAAGNNY CGRILNYKKD GTSFWNLLTI APIKDESGKV LKFIGMQVEV
301: SKHTEGAKEK ALRPNGLPES LIRYDARQKD MATNSVTELV EAVKRPRALS ESTNLHPFMT KSESDELPKK PARRMSENVV PSGRRNSGGG RRNSMQRINE
401: IPEKKSRKSS LSFMGIKKKS ESLDESIDDG FIEYGEEDDE ISDRDERPES VDDKVRQKEM RKGIDLATTL ERIEKNFVIT DPRLPDNPII FASDSFLELT
501: EYSREEILGR NCRFLQGPET DLTTVKKIRN AIDNQTEVTV QLINYTKSGK KFWNIFHLQP MRDQKGEVQY FIGVQLDGSK HVEPVRNVIE ETAVKEGEDL
601: VKKTAVNIDE AVRELPDANM TPEDLWANHS KVVHCKPHRK DSPPWIAIQK VLESGEPIGL KHFKPVKPLG SGDTGSVHLV ELVGTDQLFA MKAMDKAVML
701: NRNKVHRARA EREILDLLDH PFLPALYASF QTKTHICLIT DYYPGGELFM LLDRQPRKVL KEDAVRFYAA QVVVALEYLH CQGIIYRDLK PENVLIQGNG
801: DISLSDFDLS CLTSCKPQLL IPSIDEKKKK KQQKSQQTPI FMAEPMRASN SFVGTEEYIA PEIISGAGHT SAVDWWALGI LMYEMLYGYT PFRGKTRQKT
901: FTNVLQKDLK FPASIPASLQ VKQLIFRLLQ RDPKKRLGCF EGANEVKQHS FFKGINWALI RCTNPPELET PIFSGEAENG EKVVDPELED LQTNVF
Arabidopsis Description
PHOT1RPT1 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178VFT4]
SUBAcon: [cytosol]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.