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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 2
  • cytosol 2
  • plastid 2
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX89082 Canola cytosol 90.52 91.75
Bra014466.1-P Field mustard cytosol 90.46 91.69
CDY51011 Canola cytosol 90.24 91.46
KRH00582 Soybean extracellular, golgi 10.71 80.33
VIT_15s0048g00800.t01 Wine grape cytosol 77.58 78.19
KRH00580 Soybean cytosol 76.35 76.78
KRH65253 Soybean cytosol 75.63 76.09
Solyc01g091460.2.1 Tomato extracellular 74.96 75.59
KRH76287 Soybean cytosol 76.19 75.55
KRH40586 Soybean cytosol 75.13 75.5
PGSC0003DMT400033251 Potato cytosol 74.62 75.25
AT1G01960.1 Thale cress cytosol 70.89 72.63
GSMUA_Achr5P18830_001 Banana cytosol 68.1 71.32
GSMUA_Achr8P19420_001 Banana cytosol 68.71 70.72
EER92558 Sorghum cytosol 68.71 68.67
Zm00001d028438_P002 Maize plastid 68.54 68.47
HORVU4Hr1G063180.1 Barley plastid 68.27 68.46
TraesCS4D01G225300.1 Wheat golgi, unclear 68.27 68.46
TraesCS4A01G067400.1 Wheat plastid 68.15 68.34
TraesCS4B01G224700.1 Wheat plastid 67.32 67.51
Os03t0246800-02 Rice plasma membrane 25.77 64.89
KRH00583 Soybean endoplasmic reticulum, vacuole 5.19 63.27
AT4G38200.1 Thale cress cytosol, mitochondrion, plastid 45.34 48.19
AT4G35380.1 Thale cress cytosol, plasma membrane, plastid 44.84 47.13
AT3G43300.1 Thale cress cytosol 34.08 34.76
AT1G13980.1 Thale cress cytosol 17.79 21.98
AT5G39500.1 Thale cress cytosol 17.51 21.76
AT5G19610.1 Thale cress cytosol 15.39 20.07
Protein Annotations
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Description
BIG2Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9LZX8]
Coordinates
chr3:+:22484397..22491935
Molecular Weight (calculated)
199643.0 Da
IEP (calculated)
5.200
GRAVY (calculated)
-0.143
Length
1793 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MASSEADSRL SRVVTPALEK IVKNASWRKH SKLANECKAV IERLNSLQKS PPPSSSAATD SESESSVPGP LNDGGSIEYS LADSELIFSP LINACGTGLA
0101: KIIEPAIDCI QKLIAHGYIR GESDPSGGAE SLLLFKLIDS VCKCHDLGDE SIELPVLKTL LSAINSISLR IHGKCLLLVV RTCYDIYLGS KNVVNQTTAK
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0901: INICLEGFHH AIHATSLMSM KTHRDAFVTS LAKFTSLHSP ADIKQRNIEA IKAILRLADE EGNYLQDAWE HILTCVSRFE QLHLLGEGAP PDATFFASKQ
1001: NESEKSKQPK QYILPVLKRK GPGKSQYAAT GVLRGSYDSM SLGGKGSKNV RQEQMSSIVS NLNLLEQVGE MNQVFSQSQK LNSEAIIDFV KALCKVSMDE
1101: LRSPSNPRVF SLTKIVEIAH YNMNRIRLVW SSIWQVLSGF FVTIGCSENL SIAIFAMDSL RQLSMKFLER EELANYNFQN EFMTPFVIVM RRSNDVEIRE
1201: LIIRCVSQMV LSRVNNVKSG WKSMFMVFTT AAYDDHKNIV FLSFEIIEKI IREYFPYITE TETTTFTDCV NCLVAFTNNR FSKDISLSSI AFLRYCATKL
1301: AEGDLNSPST NKYKGTSGKI PQSSLHSGKS GKQENGEIVN NNHLYFWFPL LSGLSELSFD PRPEIRKSAL QIMFDTLRNH GHLFSLPLWE KVFESVLFPI
1401: FDYVRHSIDP SGEDESADQG SSGGEVDELD HDAWLYETCT LALQLVVDLF VKFYTTVNPL LEKVLMLLVS FIKRPHQSLA GIGIAAFVRL MSDADGLFSE
1501: EKWLEVVSAL KEAAKTTCPD FSYFLSEEYV ARSQRSALNI QNSNAESAAP TATDGNEESQ RTATHLYAAI SDAKCRAAVQ LLLIQAVMEI YNMYRPQLSA
1601: KNTLVLVDAL HGVALHAHGI NSNTILRSRL QELGPMTQMQ DPPLLRLENE SYQICLTFLQ NLVADKTKKE EEEEEEEIES LLVNICQEVL NFYIETSSSA
1701: KKLQSESSRA SEYRWRIPLG SGKRRELSAR APLIVATLQA MCTLDEASFE KNLKCLFPLL ANLISCEHGS NEVQTALADM LGLSVGPVLL QWC
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.