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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plasma membrane, plastid

Predictor Summary:
  • plastid 4
  • cytosol 1
  • mitochondrion 1
  • plasma membrane 2
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX67921 Canola plasma membrane, plastid 88.63 93.67
Bra003527.1-P Field mustard plasma membrane, plastid 91.29 93.12
CDY69529 Canola plasma membrane 44.86 92.3
TraesCS7B01G271500.1 Wheat cytosol 30.5 72.96
AT3G16340.1 Thale cress plasma membrane 68.96 71.54
PGSC0003DMT400006729 Potato plastid 72.84 71.33
Solyc03g120980.2.1 Tomato plastid 72.77 71.27
OQU76555 Sorghum mitochondrion, plasma membrane 61.27 69.61
GSMUA_Achr9P16240_001 Banana cytosol, mitochondrion, peroxisome, plasma membrane 70.66 69.2
HORVU7Hr1G088630.1 Barley vacuole 60.79 68.69
Os06t0554800-01 Rice plasma membrane 54.32 68.38
TraesCS7A01G356200.1 Wheat plasma membrane 54.19 66.72
GSMUA_Achr11P... Banana plasma membrane 64.47 65.76
Zm00001d036986_P002 Maize plasma membrane 67.12 65.38
Zm00001d046277_P002 Maize cytosol, nucleus, plasma membrane 67.73 64.61
EES01392 Sorghum cytosol, peroxisome, plasma membrane 62.29 61.78
Zm00001d043598_P003 Maize cytosol, nucleus, plasma membrane 62.36 61.56
AT1G15520.1 Thale cress plastid 56.16 57.98
AT2G36380.1 Thale cress cytosol, mitochondrion, peroxisome, plasma membrane 56.16 56.78
AT1G66950.1 Thale cress plastid 55.82 56.4
AT2G26910.1 Thale cress cytosol, peroxisome, plasma membrane 53.03 54.86
AT2G29940.1 Thale cress cytosol, peroxisome, plasma membrane 53.23 54.84
AT3G53480.1 Thale cress cytosol, peroxisome, plasma membrane 51.19 51.86
AT3G30842.1 Thale cress cytosol 47.79 49.51
AT4G15233.1 Thale cress cytosol, peroxisome, plasma membrane 46.83 49.43
Protein Annotations
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PANTHER:PTHR19241:SF224UniProt:Q9XIE2SMART:SM00382SUPFAM:SSF52540TMHMM:TMhelixUniParc:UPI00000A3911
SEG:seg:::::
Description
ABCG36ABC transporter G family member 36 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9XIE2]
Coordinates
chr1:+:22034423..22040126
Molecular Weight (calculated)
165091.0 Da
IEP (calculated)
8.002
GRAVY (calculated)
0.047
Length
1469 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MDYNPNLPPL GGGGVSMRRS ISRSVSRASR NIEDIFSSGS RRTQSVNDDE EALKWAAIEK LPTYSRLRTT LMNAVVEDDV YGNQLMSKEV DVTKLDGEDR
0101: QKFIDMVFKV AEQDNERILT KLRNRIDRVG IKLPTVEVRY EHLTIKADCY TGNRSLPTLL NVVRNMGESA LGMIGIQFAK KAQLTILKDI SGVIKPGRMT
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0701: GGFLLPKGKI PDWWGWAYWV SPLTYAFNGL VVNEMFAPRW MNKMASSNST IKLGTMVLNT WDVYHQKNWY WISVGALLCF TALFNILFTL ALTYLNPLGK
0801: KAGLLPEEEN EDADQGKDPM RRSLSTADGN RRGEVAMGRM SRDSAAEASG GAGNKKGMVL PFTPLAMSFD DVKYFVDMPG EMRDQGVTET RLQLLKGVTG
0901: AFRPGVLTAL MGVSGAGKTT LMDVLAGRKT GGYIEGDVRI SGFPKVQETF ARISGYCEQT DIHSPQVTVR ESLIFSAFLR LPKEVGKDEK MMFVDQVMEL
1001: VELDSLRDSI VGLPGVTGLS TEQRKRLTIA VELVANPSII FMDEPTSGLD ARAAAIVMRA VRNTVDTGRT VVCTIHQPSI DIFEAFDELM LMKRGGQVIY
1101: AGPLGQNSHK VVEYFESFPG VSKIPEKYNP ATWMLEASSL AAELKLSVDF AELYNQSALH QRNKALVKEL SVPPAGASDL YFATQFSQNT WGQFKSCLWK
1201: QWWTYWRSPD YNLVRFIFTL ATSLLIGTVF WQIGGNRSNA GDLTMVIGAL YAAIIFVGIN NCSTVQPMVA VERTVFYRER AAGMYSAMPY AISQVTCELP
1301: YVLIQTVYYS LIVYAMVGFE WKAEKFFWFV FVSYFSFLYW TYYGMMTVSL TPNQQVASIF ASAFYGIFNL FSGFFIPRPK IPKWWIWYYW ICPVAWTVYG
1401: LIVSQYGDVE TRIQVLGGAP DLTVKQYIED HYGFQSDFMG PVAAVLIAFT VFFAFIFAFC IRTLNFQTR
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.