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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • cytosol 4
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol
BaCelLo:cytosol
MultiLoc:cytosol
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra011642.1-P Field mustard cytosol 97.55 97.55
Bra010508.1-P Field mustard cytosol 97.33 97.33
CDX69174 Canola cytosol 97.55 97.23
CDY41626 Canola cytosol 97.33 96.57
CDX75532 Canola cytosol 97.55 94.7
CDY24823 Canola cytosol 97.22 94.69
CDX91508 Canola cytosol 8.35 91.46
VIT_00s0264g00030.t01 Wine grape mitochondrion 90.53 88.56
KRH76600 Soybean endoplasmic reticulum 87.97 87.68
KRH28848 Soybean cytosol, nucleus 87.75 87.46
CDY44621 Canola cytosol 9.35 84.85
TraesCS4B01G335100.1 Wheat endoplasmic reticulum 73.61 82.73
HORVU4Hr1G080640.1 Barley mitochondrion 83.41 80.89
GSMUA_Achr11P... Banana plastid 86.3 78.6
AT2G05710.1 Thale cress plastid 85.97 77.98
Os03t0136900-01 Rice mitochondrion 84.97 77.38
Zm00001d048358_P002 Maize plastid 83.07 75.43
EER92899 Sorghum plastid 83.18 75.38
TraesCS5A01G505000.2 Wheat golgi 83.18 75.08
Zm00001d027558_P003 Maize plastid 83.3 73.05
GSMUA_Achr11P... Banana plastid 81.29 72.93
AT4G26970.1 Thale cress mitochondrion 79.62 71.86
AT5G54950.1 Thale cress cytosol 4.57 55.41
AT4G13430.1 Thale cress plastid 12.36 21.81
Protein Annotations
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ScanProsite:PS01244PANTHER:PTHR11670PANTHER:PTHR11670:SF52UniProt:Q42560SUPFAM:SSF52016SUPFAM:SSF53732
TIGRFAMs:TIGR01341UniParc:UPI00001252CCEMBL:X82839SEG:seg::
Description
ACO1Aconitate hydratase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178V2T4]
Coordinates
chr4:-:16972569..16978161
Molecular Weight (calculated)
98157.6 Da
IEP (calculated)
6.357
GRAVY (calculated)
-0.161
Length
898 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MASENPFRSI LKALEKPDGG EFGNYYSLPA LNDPRIDKLP YSIRILLESA IRNCDEFQVK SKDVEKILDW ENTSPKQVEI PFKPARVLLQ DFTGVPAVVD
101: LACMRDAMNN LGGDSNKINP LVPVDLVIDH SVQVDVARSE NAVQANMELE FQRNKERFAF LKWGSNAFHN MLVVPPGSGI VHQVNLEYLA RVVFNTNGLL
201: YPDSVVGTDS HTTMIDGLGV AGWGVGGIEA EATMLGQPMS MVLPGVVGFK LTGKLRDGMT ATDLVLTVTQ MLRKHGVVGK FVEFHGEGMR ELSLADRATI
301: ANMSPEYGAT MGFFPVDHVT LQYLRLTGRS DDTVSMIEAY LRANKMFVDY SEPESKTVYS SCLELNLEDV EPCVSGPKRP HDRVPLKEMK ADWHSCLDNR
401: VGFKGFAVPK EAQSKAVEFN FNGTTAQLRH GDVVIAAITS CTNTSNPSVM LGAALVAKKA CDLGLEVKPW IKTSLAPGSG VVTKYLAKSG LQKYLNQLGF
501: SIVGYGCTTC IGNSGDIHEA VASAIVDNDL VASAVLSGNR NFEGRVHPLT RANYLASPPL VVAYALAGTV DIDFETQPIG TGKDGKQIFF RDIWPSNKEV
601: AEVVQSSVLP DMFKATYEAI TKGNSMWNQL SVASGTLYEW DPKSTYIHEP PYFKGMTMSP PGPHGVKDAY CLLNFGDSIT TDHISPAGSI HKDSPAAKYL
701: MERGVDRRDF NSYGSRRGND EIMARGTFAN IRIVNKHLKG EVGPKTVHIP TGEKLSVFDA AMKYRNEGRD TIILAGAEYG SGSSRDWAAK GPMLLGVKAV
801: ISKSFERIHR SNLVGMGIIP LCFKAGEDAE TLGLTGQELY TIELPNNVSE IKPGQDVTVV TNNGKSFTCT LRFDTEVELA YFDHGGILQY VIRNLIKQ
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.