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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 9
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:plastid
Any Predictor:plastid
BaCelLo:plastid
ChloroP:plastid
iPSORT:plastid
MultiLoc:plastid
Predotar:plastid
PProwler:plastid
TargetP:plastid
WoLF PSORT:plastid
YLoc:plastid
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX97969 Canola plastid 94.44 94.35
CDX93088 Canola plastid 94.44 94.06
Bra019845.1-P Field mustard plastid 94.04 93.95
CDY50945 Canola plastid 94.34 93.87
CDY18054 Canola plastid 92.93 93.31
CDY56501 Canola plastid 86.57 88.08
AT4G35830.1 Thale cress cytosol 77.98 85.97
PGSC0003DMT400022547 Potato mitochondrion, plastid 84.04 84.81
KRH56130 Soybean mitochondrion 83.64 84.58
KRH22567 Soybean mitochondrion 83.94 84.45
Solyc12g005860.1.1 Tomato extracellular, plastid 83.64 84.4
KRH25376 Soybean mitochondrion 83.84 84.35
KRH26786 Soybean mitochondrion 83.84 84.35
KRH15702 Soybean mitochondrion 16.97 84.0
VIT_12s0059g02150.t01 Wine grape plastid 83.74 83.99
Solyc07g052350.2.1 Tomato plastid 83.54 83.12
PGSC0003DMT400074489 Potato cytosol, extracellular 83.43 82.85
AT4G26970.1 Thale cress mitochondrion 77.88 77.49
Bra015165.1-P Field mustard plastid 75.15 73.23
AT5G54950.1 Thale cress cytosol 4.34 58.11
AT4G13430.1 Thale cress plastid 11.72 22.79
Protein Annotations
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PRINTS:PR00415ScanProsite:PS00450ScanProsite:PS01244PANTHER:PTHR11670PANTHER:PTHR11670:SF50UniProt:Q9SIB9
SUPFAM:SSF52016SUPFAM:SSF53732TIGRFAMs:TIGR01341UniParc:UPI00000A3DB7SEG:seg:
Description
ACO3Aconitate hydratase 3, mitochondrial [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9SIB9]
Coordinates
chr2:+:2141329..2146678
Molecular Weight (calculated)
108207.0 Da
IEP (calculated)
7.173
GRAVY (calculated)
-0.179
Length
990 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MYLTASSSAS SSIIRAASSR SSSLFSFRSV LSPSVSSTSP SSLLARRSFG TISPAFRRWS HSFHSKPSPF RFTSQIRAVS PVLDRLQRTF SSMASEHPFK
101: GIFTTLPKPG GGEFGKFYSL PALNDPRVDK LPYSIRILLE SAIRNCDNFQ VTKEDVEKII DWEKTSPKQV EIPFKPARVL LQDFTGVPAV VDLACMRDAM
201: NKLGSDSNKI NPLVPVDLVI DHSVQVDVAR SENAVQANME LEFQRNKERF AFLKWGSTAF QNMLVVPPGS GIVHQVNLEY LGRVVFNTKG LLYPDSVVGT
301: DSHTTMIDGL GVAGWGVGGI EAEATMLGQP MSMVLPGVVG FKLAGKMRNG VTATDLVLTV TQMLRKHGVV GKFVEFYGNG MSGLSLADRA TIANMSPEYG
401: ATMGFFPVDH VTLQYLKLTG RSDETVAMIE AYLRANNMFV DYNEPQQDRV YSSYLELNLD DVEPCISGPK RPHDRVTLKE MKADWHSCLD SKVGFKGFAI
501: PKEAQEKVVN FSFDGQPAEL KHGSVVIAAI TSCTNTSNPS VMLGAGLVAK KACDLGLQVK PWIKTSLAPG SGVVTKYLLK SGLQEYLNEQ GFNIVGYGCT
601: TCIGNSGEIN ESVGAAITEN DIVAAAVLSG NRNFEGRVHP LTRANYLASP PLVVAYALAG TVNIDFETEP IGKGKNGKDV FLRDIWPTTE EIAEVVQSSV
701: LPDMFRATYE SITKGNPMWN KLSVPENTLY SWDPNSTYIH EPPYFKDMTM DPPGPHNVKD AYCLLNFGDS ITTDHISPAG NIQKDSPAAK FLMERGVDRK
801: DFNSYGSRRG NDEIMARGTF ANIRIVNKLM NGEVGPKTVH IPSGEKLSVF DAAMRYKSSG EDTIILAGAE YGSGSSRDWA AKGPMLQGVK AVIAKSFERI
901: HRSNLVGMGI IPLCFKSGED ADTLGLTGHE RYTIHLPTDI SEIRPGQDVT VTTDNGKSFT CTVRFDTEVE LAYFNHGGIL PYVIRNLSKQ
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.