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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plasma membrane

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • plastid 1
  • plasma membrane 4
  • extracellular 1
  • endoplasmic reticulum 1
  • vacuole 1
  • golgi 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra009539.1-P Field mustard plasma membrane 89.03 87.87
CDX70318 Canola plasma membrane 81.3 87.81
CDY10393 Canola plasma membrane 80.37 86.96
VIT_08s0040g01730.t01 Wine grape plasma membrane 57.34 56.3
KRH19943 Soybean plasma membrane 54.02 53.24
KRH32544 Soybean plasma membrane 53.32 53.16
Solyc09g005490.1.1 Tomato extracellular 5.1 51.97
KRH67695 Soybean endoplasmic reticulum, plasma membrane, plastid 50.7 50.97
PGSC0003DMT400055484 Potato plasma membrane 49.61 49.35
Solyc09g007870.2.1 Tomato plastid 49.69 48.86
TraesCSU01G131800.1 Wheat plasma membrane 15.46 41.93
Os07t0156732-01 Rice nucleus 19.32 41.46
Os07t0157401-01 Rice nucleus 19.32 41.46
TraesCS4B01G381200.1 Wheat plasma membrane 15.46 41.07
TraesCSU01G131600.1 Wheat plasma membrane 15.46 41.07
Solyc09g005540.1.1 Tomato cytosol, nucleus, vacuole 19.47 40.91
HORVU5Hr1G050310.2 Barley plasma membrane 7.81 40.73
GSMUA_Achr9P10350_001 Banana plasma membrane 37.64 40.35
TraesCS5A01G547500.1 Wheat plasma membrane 15.15 40.25
EES02232 Sorghum plasma membrane 39.34 40.02
Os07t0155600-01 Rice cytosol, peroxisome, plasma membrane 39.03 39.42
KXG37779 Sorghum plasma membrane 14.06 39.06
Zm00001d039341_P126 Maize plasma membrane 39.18 39.03
Zm00001d033625_P015 Maize plasma membrane 14.3 38.87
GSMUA_Achr6P31160_001 Banana plasma membrane 38.02 38.71
TraesCS5D01G166000.1 Wheat plasma membrane 36.55 38.15
TraesCS5B01G158500.1 Wheat plasma membrane 36.4 38.01
TraesCS5A01G161200.4 Wheat plasma membrane 36.32 37.93
TraesCS4A01G275600.1 Wheat plasma membrane 34.85 37.55
KXG37781 Sorghum plasma membrane 35.7 37.38
TraesCS2B01G133000.1 Wheat plasma membrane 34.62 37.33
TraesCS4D01G036000.3 Wheat plasma membrane 34.85 37.18
HORVU5Hr1G050330.5 Barley plasma membrane 28.98 37.13
HORVU4Hr1G090460.5 Barley plasma membrane 11.67 36.83
Os03t0700800-01 Rice plasma membrane 36.94 36.8
TraesCS4B01G038100.1 Wheat plasma membrane 33.93 36.31
OQU91151 Sorghum plasma membrane 13.29 35.39
Zm00001d013492_P001 Maize plasma membrane 14.37 33.45
GSMUA_Achr7P01280_001 Banana plasma membrane 38.1 33.31
AT1G15960.1 Thale cress plasma membrane 8.89 21.82
AT1G80830.1 Thale cress plastid 8.89 21.62
AT2G23150.1 Thale cress plasma membrane 8.04 20.43
AT1G47240.1 Thale cress plasma membrane 8.27 20.19
AT5G67330.1 Thale cress plasma membrane 7.96 20.12
AT4G18790.1 Thale cress plasma membrane 8.19 20.0
Protein Annotations
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PANTHER:PTHR11706PANTHER:PTHR11706:SF44UniProt:Q9S814TMHMM:TMhelixUniParc:UPI000009F04BSEG:seg
Description
EIN2Ethylene-insensitive protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9S814]
Coordinates
chr5:+:787428..793404
Molecular Weight (calculated)
140964.0 Da
IEP (calculated)
5.867
GRAVY (calculated)
-0.051
Length
1294 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MEAEIVNVRP QLGFIQRMVP ALLPVLLVSV GYIDPGKWVA NIEGGARFGY DLVAITLLFN FAAILCQYVA ARISVVTGKH LAQICNEEYD KWTCMFLGIQ
0101: AEFSAILLDL TMVVGVAHAL NLLFGVELST GVFLAAMDAF LFPVFASFLE NGMANTVSIY SAGLVLLLYV SGVLLSQSEI PLSMNGVLTR LNGESAFALM
0201: GLLGASIVPH NFYIHSYFAG ESTSSSDVDK SSLCQDHLFA IFGVFSGLSL VNYVLMNAAA NVFHSTGLVV LTFHDALSLM EQVFMSPLIP VVFLMLLFFS
0301: SQITALAWAF GGEVVLHDFL KIEIPAWLHR ATIRILAVAP ALYCVWTSGA DGIYQLLIFT QVLVAMMLPC SVIPLFRIAS SRQIMGVHKI PQVGEFLALT
0401: TFLGFLGLNV VFVVEMVFGS SDWAGGLRWN TVMGTSIQYT TLLVSSCASL CLILWLAATP LKSASNRAEA QIWNMDAQNA LSYPSVQEEE IERTETRRNE
0501: DESIVRLESR VKDQLDTTSV TSSVYDLPEN ILMTDQEIRS SPPEERELDV KYSTSQVSSL KEDSDVKEQS VLQSTVVNEV SDKDLIVETK MAKIEPMSPV
0601: EKIVSMENNS KFIEKDVEGV SWETEEATKA APTSNFTVGS DGPPSFRSLS GEGGSGTGSL SRLQGLGRAA RRHLSAILDE FWGHLYDFHG QLVAEARAKK
0701: LDQLFGTDQK SASSMKADSF GKDISSGYCM SPTAKGMDSQ MTSSLYDSLK QQRTPGSIDS LYGLQRGSSP SPLVNRMQML GAYGNTTNNN NAYELSERRY
0801: SSLRAPSSSE GWEHQQPATV HGYQMKSYVD NLAKERLEAL QSRGEIPTSR SMALGTLSYT QQLALALKQK SQNGLTPGPA PGFENFAGSR SISRQSERSY
0901: YGVPSSGNTD TVGAAVANEK KYSSMPDISG LSMSARNMHL PNNKSGYWDP SSGGGGYGAS YGRLSNESSL YSNLGSRVGV PSTYDDISQS RGGYRDAYSL
1001: PQSATTGTGS LWSRQPFEQF GVAERNGAVG EELRNRSNPI NIDNNASSNV DAEAKLLQSF RHCILKLIKL EGSEWLFGQS DGVDEELIDR VAAREKFIYE
1101: AEAREINQVG HMGEPLISSV PNCGDGCVWR ADLIVSFGVW CIHRVLDLSL MESRPELWGK YTYVLNRLQG VIDPAFSKLR TPMTPCFCLQ IPASHQRASP
1201: TSANGMLPPA AKPAKGKCTT AVTLLDLIKD VEMAISCRKG RTGTAAGDVA FPKGKENLAS VLKRYKRRLS NKPVGMNQDG PGSRKNVTAY GSLG
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.