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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 9
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra033861.1-P Field mustard plastid 94.94 94.94
Bra023235.1-P Field mustard plastid 94.68 94.21
CDY22582 Canola plastid 94.68 94.21
CDY59208 Canola plastid 94.68 94.21
PGSC0003DMT400024090 Potato cytosol, extracellular, plastid 84.3 82.22
KRH74288 Soybean nucleus, plastid 84.56 82.06
KRH39632 Soybean nucleus, plastid 84.56 82.06
Solyc08g076220.2.1 Tomato plastid 83.04 82.0
VIT_02s0109g00080.t01 Wine grape plastid 83.8 81.13
Os04t0596900-00 Rice extracellular, plasma membrane 75.7 74.38
EES12777 Sorghum plastid 72.15 73.64
GSMUA_Achr2P09720_001 Banana cytosol 17.97 70.3
GSMUA_Achr1P23890_001 Banana plastid 72.41 70.27
Zm00001d002454_P002 Maize plastid 68.1 64.51
AT4G26510.2 Thale cress cytosol 18.23 15.35
AT1G55810.5 Thale cress cytosol 18.73 15.16
AT3G27190.1 Thale cress cytosol 18.23 14.91
AT3G27440.1 Thale cress cytosol 17.22 14.62
AT5G40870.1 Thale cress cytosol, plastid 17.47 14.2
AT3G53900.2 Thale cress plastid 7.85 10.47
Protein Annotations
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PO:PO:0025022PO:PO:0025281PRINTS:PR00478InterPro:PRKSymbol:PRKInterPro:PRK/URK
ScanProsite:PS00567PANTHER:PTHR10285PANTHER:PTHR10285:SF120SUPFAM:SSF52540UniParc:UPI0000000BA5EMBL:X58149
SEG:seg:::::
Description
PRKPhosphoribulokinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WLP9]
Coordinates
chr1:+:11532199..11534639
Molecular Weight (calculated)
44466.0 Da
IEP (calculated)
5.906
GRAVY (calculated)
-0.313
Length
395 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MAVSTIYSTQ ALNSTHFLTS SSSSKQVFLY RRQPQTNRRF NTLITCAQET IVIGLAADSG CGKSTFMRRL TSVFGGAAKP PKGGNPDSNT LISDTTTVIC
101: LDDYHSLDRY GRKEQKVTAL DPRANDFDLM YEQVKALKNG IAVEKPIYNH VTGLLDPPEL IQPPKILVIE GLHPMFDERV RDLLDFSIYL DISNEVKFAW
201: KIQRDMAERG HSLESIKASI EARKPDFDAF IDPQKQYADA VIEVLPTTLI PDDNEGKVLR VRLIMKEGVK YFSPVYLFDE GSTISWIPCG RKLTCSYPGI
301: KFNYEPDSYF DHEVSVLEMD GQFDRLDELI YVESHLSNLS TKFYGEVTQQ MLKHADFPGS NNGTGLFQTI VGLKIRDLYE QLIANKATAR AEAKA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.