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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 3
  • extracellular 1
  • endoplasmic reticulum 1
  • vacuole 1
  • plasma membrane 1
  • golgi 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY40468 Canola cytosol 89.52 89.52
Bra039034.1-P Field mustard cytosol 89.25 89.37
CDY35917 Canola cytosol 89.25 89.37
KRH41728 Soybean extracellular, vacuole 4.84 76.6
PGSC0003DMT400083452 Potato cytosol 10.48 70.27
VIT_11s0016g03260.t01 Wine grape cytosol 70.56 68.99
PGSC0003DMT400006585 Potato cytosol 68.68 66.71
Solyc03g061590.2.1 Tomato cytosol 15.99 65.75
Os06t0622500-00 Rice cytosol 31.45 61.58
GSMUA_Achr1P19740_001 Banana cytosol 59.54 58.91
Zm00001d042523_P001 Maize cytosol 55.91 55.39
KXG33895 Sorghum cytosol 55.65 54.91
TraesCS7A01G398600.1 Wheat cytosol 55.78 54.75
TraesCS7D01G392900.2 Wheat cytosol 55.65 54.62
TraesCS7B01G299300.1 Wheat cytosol, mitochondrion 52.96 54.57
HORVU7Hr1G093620.9 Barley cytosol 53.09 52.46
AT3G16320.1 Thale cress cytosol 45.56 46.57
AT3G48150.1 Thale cress cytosol 15.19 19.52
Protein Annotations
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UniParc:UPI000004C47CSEG:seg::::
Description
CDC27BCell division cycle protein 27 homolog B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8LGU6]
Coordinates
chr2:-:8631959..8637300
Molecular Weight (calculated)
83072.7 Da
IEP (calculated)
6.549
GRAVY (calculated)
-0.356
Length
744 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MEAMLVDCVN NSLRHFVYKN AIFMCERLCA EFPSEVNLQL LATSYLQNNQ AYSAYHLLKG TQMAQSRYLF ALSCFQMDLL NEAESALCPV NEPGAEIPNG
101: AAGHYLLGLI YKYTDRRKNA AQQFKQSLTI DPLLWAAYEE LCILGAAEEA TAVFGETAAL SIQKQYMQQL STSLGLNTYN EERNSTSTKN TSSEDYSPRQ
201: SKHTQSHGLK DISGNFHSHG VNGGVSNMSF YNTPSPVAAQ LSGIAPPPLF RNFQPAVANP NSLITDSSPK STVNSTLQAP RRKFVDEGKL RKISGRLFSD
301: SGPRRSSRLS ADSGANINSS VATVSGNVNN ASKYLGGSKL SSLALRSVTL RKGHSWANEN MDEGVRGEPF DDSRPNTAST TGSMASNDQE DETMSIGGIA
401: MSSQTITIGV SEILNLLRTL GEGCRLSYMY RCQEALDTYM KLPHKHYNTG WVLSQVGKAY FELIDYLEAE KAFRLARLAS PYCLEGMDIY STVLYHLKED
501: MKLSYLAQEL ISTDRLAPQS WCAMGNCYSL QKDHETALKN FLRAVQLNPR FAYAHTLCGH EYTTLEDFEN GMKSYQNALR VDTRHYNAWY GLGMIYLRQE
601: KLEFSEHHFR MAFLINPSSS VIMSYLGTSL HALKRSEEAL EIMEQAIVAD RKNPLPMYQK ANILVCLERL DEALEVLEEL KEYAPSESSV YALMGRIYKR
701: RNMHDKAMLH FGLALDMKPP ATDVAAIKAA MEKLHVPDEI DESP
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.