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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
  • cytoskeleton 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY63017 Canola cytosol 97.96 97.96
Bra021241.1-P Field mustard cytosol 97.96 97.96
CDX82370 Canola cytosol 97.2 97.2
CDY48693 Canola cytosol 96.69 96.69
Bra001661.1-P Field mustard cytosol 96.18 96.18
Bra041036.1-P Field mustard cytosol 90.84 91.3
CDX80079 Canola cytosol 90.84 91.3
CDY37784 Canola cytosol 90.33 90.79
AT1G02500.1 Thale cress cytosol 90.59 90.59
AT2G36880.1 Thale cress cytosol 89.57 90.26
GSMUA_Achr3P12780_001 Banana cytosol 90.33 90.1
EES17665 Sorghum cytosol 90.59 89.9
Os05t0135700-01 Rice cytosol 90.59 89.9
HORVU6Hr1G034650.1 Barley plasma membrane 90.08 89.39
GSMUA_Achr1P15960_001 Banana cytosol 89.31 89.09
AT4G01850.1 Thale cress cytosol 89.06 89.06
GSMUA_Achr8P06200_001 Banana cytosol 89.06 89.06
TraesCS6D01G159100.1 Wheat plastid 89.57 88.89
TraesCS6B01G197300.1 Wheat cytosol 89.57 88.89
TraesCS6A01G169300.1 Wheat cytosol 89.57 88.89
EES02825 Sorghum cytosol 89.31 88.64
Os01t0293000-01 Rice cytosol 88.8 88.13
GSMUA_Achr1P18400_001 Banana cytosol 32.57 87.07
CDX75914 Canola cytosol, mitochondrion 97.2 81.62
Protein Annotations
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ScanProsite:PS00376ScanProsite:PS00377PANTHER:PTHR11964PANTHER:PTHR11964:SF35UniProt:Q9LUT2InterPro:S-AdoMet_synt_C
InterPro:S-AdoMet_synt_NInterPro:S-AdoMet_synt_centralInterPro:S-AdoMet_synthetaseInterPro:S-AdoMet_synthetase_sfamSUPFAM:SSF55973TIGRFAMs:TIGR01034
UniParc:UPI00000AC28CSEG:seg::::
Description
METK4S-adenosylmethionine synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178VIP8]
Coordinates
chr3:-:5952187..5954091
Molecular Weight (calculated)
42798.0 Da
IEP (calculated)
5.606
GRAVY (calculated)
-0.255
Length
393 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MESFLFTSES VNEGHPDKLC DQISDAILDA CLEQDPESKV ACETCTKTNM VMVFGEITTK ANVDYEQIVR KTCREIGFVS ADVGLDADNC KVLVNIEQQS
101: PDIAQGVHGH LTKKPEEVGA GDQGHMFGYA TDETPELMPL THVLATKLGA KLTEVRKNGT CPWLRPDGKT QVTIEYINES GAMVPVRVHT VLISTQHDET
201: VTNDEIAADL KEHVIKPVIP EKYLDEKTIF HLNPSGRFVI GGPHGDAGLT GRKIIIDTYG GWGAHGGGAF SGKDPTKVDR SGAYIVRQAA KSIVASGLAR
301: RVIVQVSYAI GVPEPLSVFV DSYGTGKIPD KEILEIVKES FDFRPGMISI NLDLKRGGNG RFLKTAAYGH FGRDDADFTW EVVKPLKSNK VQA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.