Factsheet for AT5G50320.1

Subcellular Localization

min:

: max

Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:

nucleus 1
cytosol 3
mitochondrion 1

Predictors

GFP

MS/MS

Papers

Winner Takes All:	cytosol
Any Predictor:	cytosol, nucleus
BaCelLo:	nucleus
MultiLoc:	cytosol
PProwler:	mitochondrion
WoLF PSORT:	cytosol
YLoc:	cytosol

PPI

No PPI Data

Homology

Paralog

locus	Identity	Homology Identity

Ortholog

locus	Homology Species	Location	Identity	Homology Identity
Bra000619.1-P	Field mustard	cytosol	98.76	98.76
CDY34039	Canola	cytosol	98.58	98.58
CDX83163	Canola	cytosol	98.23	98.23
Solyc03g110910.2.1	Tomato	cytosol, nucleus	92.21	92.21
KRH63718	Soybean	cytosol, nucleus	91.86	92.02
PGSC0003DMT400039303	Potato	cytosol	91.86	92.02
VIT_17s0000g10190.t01	Wine grape	cytosol	90.97	91.3
KRH54237	Soybean	cytosol, nucleus	90.97	91.13
GSMUA_Achr3P02630_001	Banana	cytosol	79.65	90.36
HORVU4Hr1G039630.1	Barley	cytosol	10.44	89.39
Zm00001d003258_P001	Maize	plastid	88.85	88.07
Zm00001d025713_P001	Maize	plastid	88.5	87.57
TraesCS2B01G361800.1	Wheat	cytosol	88.14	87.52
TraesCS2D01G341600.1	Wheat	cytosol	88.14	87.52
EES12405	Sorghum	cytosol	88.32	87.39
TraesCS2A01G320900.1	Wheat	cytosol	87.96	87.35
Os04t0484900-01	Rice	cytosol	88.5	87.26
HORVU2Hr1G083870.1	Barley	plasma membrane	88.14	81.24

Protein Annotations

MapMan:15.3.6.2.3	Gene3D:3.40.630.30	Gene3D:3.80.30.20	EntrezGene:835098	UniProt:A0A178UGS1	ProteinID:AED95925.1
EMBL:AJ964958	ArrayExpress:AT5G50320	EnsemblPlantsGene:AT5G50320	RefSeq:AT5G50320	TAIR:AT5G50320	RefSeq:AT5G50320-TAIR-G
EnsemblPlants:AT5G50320.1	TAIR:AT5G50320.1	EMBL:AY054293	EMBL:AY056323	EMBL:AY133528	InterPro:Acyl_CoA_acyltransferase
Unigene:At.20657	ProteinID:BAB09451.1	Symbol:ELO3	InterPro:ELP3-like	InterPro:Elp3/MiaB/NifB	InterPro:GNAT_dom
GO:GO:0002098	GO:GO:0003674	GO:GO:0003824	GO:GO:0004402	GO:GO:0005488	GO:GO:0005575
GO:GO:0005622	GO:GO:0005623	GO:GO:0005634	GO:GO:0005719	GO:GO:0005737	GO:GO:0005829
GO:GO:0006139	GO:GO:0006351	GO:GO:0006355	GO:GO:0006357	GO:GO:0006464	GO:GO:0007154
GO:GO:0007165	GO:GO:0007275	GO:GO:0008033	GO:GO:0008080	GO:GO:0008150	GO:GO:0008152
GO:GO:0008283	GO:GO:0009058	GO:GO:0009294	GO:GO:0009653	GO:GO:0009719	GO:GO:0009734
GO:GO:0009987	GO:GO:0010928	GO:GO:0016043	GO:GO:0016573	GO:GO:0016740	GO:GO:0016746
GO:GO:0019538	GO:GO:0033588	GO:GO:0035265	GO:GO:0040007	GO:GO:0046872	GO:GO:0051536
GO:GO:0090708	GO:GO:2000025	InterPro:IPR000182	InterPro:IPR023404	RefSeq:NP_568725.1	ProteinID:OAO92414.1
PFAM:PF00583	PFAM:PF04055	PFAM:PF16199	PIRSF:PIRSF005669	PO:PO:0000013	PO:PO:0000037
PO:PO:0000230	PO:PO:0000293	PO:PO:0001054	PO:PO:0001078	PO:PO:0001081	PO:PO:0001185
PO:PO:0004507	PO:PO:0007064	PO:PO:0007095	PO:PO:0007098	PO:PO:0007103	PO:PO:0007115
PO:PO:0007123	PO:PO:0007611	PO:PO:0007616	PO:PO:0008019	PO:PO:0009005	PO:PO:0009006
PO:PO:0009009	PO:PO:0009010	PO:PO:0009025	PO:PO:0009029	PO:PO:0009030	PO:PO:0009031
PO:PO:0009032	PO:PO:0009046	PO:PO:0009047	PO:PO:0009052	PO:PO:0020030	PO:PO:0020038
PO:PO:0020100	PO:PO:0020137	PO:PO:0025022	PO:PO:0025281	PFscan:PS51186	PANTHER:PTHR11135
PANTHER:PTHR11135:SF0	UniProt:Q93ZR1	InterPro:Radical_SAM_C	SMART:SM00729	SUPFAM:SSF102114	SUPFAM:SSF55729
TIGRFAMs:TIGR01211	UniParc:UPI00000A4CDE	InterPro:rSAM	InterPro:rSAM_horseshoe	SEG:seg	:

Description

HAG3Elongator complex protein 3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UGS1]

Coordinates

chr5:-:20480626..20484945

Molecular Weight (calculated)

63698.0 Da

IEP (calculated)

8.827

GRAVY (calculated)

-0.378

Length

565 amino acids

Sequence
(BLAST)

001: MATAVVMNGE LKKQPRPGKG GYQGRGLTEE EARVRAISEI VSTMIERSHR NENVDLNAIK TAACRKYGLA RAPKLVEMIA ALPDSERETL LPKLRAKPVR
101: TASGIAVVAV MSKPHRCPHI ATTGNICVYC PGGPDSDFEY STQSYTGYEP TSMRAIRARY NPYVQARSRI DQLKRLGHSV DKVEFILMGG TFMSLPAEYR
201: DFFIRNLHDA LSGHTSANVE EAVAYSEHSA TKCIGMTIET RPDYCLGPHL RQMLIYGCTR LEIGVQSTYE DVARDTNRGH TVAAVADCFC LAKDAGFKVV
301: AHMMPDLPNV GVERDMESFK EFFESPSFRA DGLKIYPTLV IRGTGLYELW KTGRYRNYPP EQLVDIVARI LSMVPPWTRV YRVQRDIPMP LVTSGVEKGN
401: LRELALARMD DLGLKCRDVR TREAGIQDIH HKIKPEQVEL VRRDYTANEG WETFLSYEDT RQDILVGLLR LRKCGKNVTC PELMGKCSVV RELHVYGTAV
501: PVHGRDADKL QHQGYGTLLM EEAERIARRE HRSNKIGVIS GVGTRHYYRK LGYELEGPYM VKHLL

Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.