Skip to main content
crop-pal logo
Barley
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol, mitochondrion

Predictor Summary:
  • mitochondrion 2
  • cytosol 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
HORVU4Hr1G000630.1 Barley mitochondrion 43.59 55.56
HORVU2Hr1G123290.3 Barley extracellular 66.15 54.2
HORVU5Hr1G017320.1 Barley plastid 45.64 49.44
HORVU5Hr1G072670.2 Barley cytosol 41.03 41.03
HORVU3Hr1G113050.1 Barley cytosol, mitochondrion, nucleus 45.13 24.11
Zm00001d036468_P001 Maize nucleus 21.54 19.63
Zm00001d036465_P001 Maize nucleus 21.54 19.63
EER90325 Sorghum cytosol, mitochondrion 23.08 18.67
VIT_14s0219g00110.t01 Wine grape nucleus 16.92 15.14
Solyc02g067940.1.1 Tomato cytosol, plastid 7.18 14.58
PGSC0003DMT400032865 Potato cytosol 12.82 13.02
Solyc02g093710.1.1 Tomato mitochondrion 12.31 12.57
GSMUA_Achr3P17090_001 Banana cytosol 12.82 12.25
PGSC0003DMT400017820 Potato cytosol 7.69 12.1
CDY36373 Canola cytosol, mitochondrion, nucleus, plastid 11.79 10.8
GSMUA_Achr6P28320_001 Banana cytosol, mitochondrion, nucleus, plastid 10.77 10.24
Bra025553.1-P Field mustard cytosol, mitochondrion, nucleus, plastid 11.79 10.18
KRH72087 Soybean plastid 8.21 9.47
CDY42559 Canola cytosol 9.74 8.92
AT5G40690.1 Thale cress plastid 9.23 8.57
KRG88946 Soybean cytosol, mitochondrion, peroxisome, plastid 3.08 6.19
Protein Annotations
EnsemblPlants:HORVU0Hr1G018980.1EnsemblPlantsGene:HORVU0Hr1G018980ncoils:CoilSEG:segUniParc:UPI000B4764D6UniProt:A0A287E580
MapMan:35.2:::::
Description
No Description!
Coordinates
chrchrUn:+:102196397..102197049
Molecular Weight (calculated)
17264.5 Da
IEP (calculated)
4.061
GRAVY (calculated)
-0.545
Length
195 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: LEYSIRDHSL KIRFRCRGRC GAVRRVPPAS FRRRXXXXXX XXXXXXXXXX XXXXXXXXXX XXXXXXXXXX XXXRPGRHGG YNYRGTSTSA VLAHLADGNN
101: WHAEDKEDDD ADLVAAALRG ISDLYDLIVS LQAAPGGQED DADGTADTDE IEEQDAEITD DVDEDEEEED DGLCVVRGIT IALEFSDGEE DWIVV
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT1G67120.1 )
(BLAST)
0001: MAIDGSFNLK LALETFSVRC PKVAAFPCFT SILSKGGEVV DNEEVIHALG DAFLHPEFTV PLVHCFLPII RNVVDRVVGL LRLVDDLKSS IDYSDDVSSV
0101: LDNAMTEGIS VIDFYVRRGQ RLELHECACL AFSRALHFNT SLLGSILNYF EKAPPPYERI LVKDIVSESR MEATDAYLLC LRVSYRFLVI RPEVFSKLWD
0201: WSCYLDSMKR LSECPRQQRH FLEKYRDAVW CGIQILSVVL RCSDRLAGCF GFEEEEALSC LLRWEEFCQD IEIEKAGLYI QLPTYTALKS LQQFNTLVPG
0301: INKRQSAGLE ADEPQMKIRR LDTWDVNSFS EPFEIHSRVK KSFEMVSLAV SQKRPVLLYG PSGSGKSALI RKLADESGNH VVFIHMDDQL DGKTLVGTYV
0401: CTDQPGEFRW QPGSLTQAIM NGFWVVLEDI DKAPSDVPLV LSSLLGGSCS FLTSQGEEIR IAETFQLFST ISTPECSVSH IRDAGNSLSP LWRRIVVYPP
0501: DRESLQSILG ARYPNLGPVA EKLIETFETI NSALRPQFSS STTENSATFS SPSRFSLRDL LKWCERVHGL PSYDGHAVYQ EAADIFSASN MSVKNRVAVS
0601: EIVASIWNVA VPESQDKPPI QEFSGILKIG RVSLPLGETA SHDRSRFVET RTSTRLLEKI ARSVEYNEPV LLVGETGTGK TTLVQNLAHW IGQKLTVLNL
0701: SQQSDIVDLL GGFKPIDPKL MCTMVYNEFN ELARDLKIKD DSKIMKWLQD NFRAKKWHTF LTGLLDIIKG IEGRITERME GKIGEARSRS GRKRKKPEEE
0801: LKNCACLRTK VNKIRQQIHS GGMVFTFVEG AFVTALREGH WVLLDEVNLA PPEILGRLIG VLEGVRGSLC LAERGDVMGI PRHLNFRLFA CMNPATDAGK
0901: RDLPFSFRSR FTEYAVDDDI CDDDLEIFVR RFLGGRGSDS KLVANIVWFY KEAKRLSEES LQDGANQKPQ YSLRSLYRAL EYAIKAEAIG GFQKALYDGF
1001: SMFFLSLLDA SSAKIVEPII KRISGENIRS QPLQRYLGEL KGSSDKFVGS YVKTKSVIDH LNHLAHAIFI KRYPVLLQGP TSSGKTSLVK YLAAISGNKF
1101: VRINNHEQTD IQEYLGSYMT DSSGKLVFHE GALVKAVRGG HWIVLDELNL APSDVLEALN RLLDDNRELF VPELSETISA HPNFMLFATQ NPPTLYGGRK
1201: ILSRAFRNRF VEIHVDEIPE DELSEILTTK CSIANSHASK MVEVMKDLQR NRQSSKAFAG KHGYITPRDL FRWAYRFRTY DGTSHEELAR EGYYILAERL
1301: RDDTEKVVVQ EVLERHFRVS LAKDDLYNME LPRLDSIQNR KFTWTQSMRR LFFLIDRSYK LREPVLLVGD TGGGKTTICQ ILSDVKKKRL HILNCHQYTE
1401: TSDFLGGFFP VRDRSKLITE YENQVKQLEL SQALTPFGQD IVICGDISRA EVSIKSVEVA LEKYKNGSVI GVAATPQDVD FLEKIRNNMV MLYQKWRAIF
1501: VWQDGPLVEA MRAGNIVLVD EISLADDSVL ERMNSVLETD RKLSLAEKGG PVLEEVVAHE DFFVLATMNP GGDYGKKELS PALRNRFTEI WVPPITDTEE
1601: LRSIAFSGLS SLKESNVVDP IINFWEWFNR LHTGRTLTVR DLLSWVAFVN MATESLGPAY AILHGAFLVL LDGLSLGTGF SGRDGQDLRE KCFAFLLQQL
1701: ELFASDTLPL ELSRMELYGW GDSKAICEKS KSVRHEGMFG IDPFFISKGD ENPEIGGFEF LAPTTHRNVL RVLRAMQLSK PILLEGSPGV GKTSLILALG
1801: KYSGHKVVRI NLSEQTDMMD LLGSDLPVES DEDMKFAWSD GILLQALKEG SWVLLDELNL APQSVLEGLN AILDHRAQVF IPELGCTFEC PPTFRVFACQ
1901: NPSTQGGGRK GLPKSFLNRF TKVYVDELVE DDYLFICRSL YPSVPSPLLS KLIALNRQLH DGTMLYRKFG HDGSPWEFNL RDVIRSCQFM QEAIHDLEVE
2001: SFLNVLYIQR MRTATDRKEV LRIYKAIFDK TPSINPYPRV QLNPAYLVVG TAAIKRNLNQ SNIASEQLKL LPEIRQNLEA VAHCVQNKWL CILVGPSSSG
2101: KTSVIRILAQ LTGYPLNELN LSSATDSSDL LGCFEQYNAF RNFRLVMTRV EHLVDEYNSL LLQSSQEALF SNRSGLVSRW LSYLNKIDSS LVENPLFFLN
2201: DSETLSTLEE VVEDLEQVLK EGVLPVSWSK KYLEQISKTI LQLQTHEKKQ STKFEWVTGM LIKAIEKGEW VVLKNANLCN PTVLDRINSL VEPCGSITIN
2301: ECGIVNGEPV TVVPHPNFRL FLSVNPKFGE VSRAMRNRGV EVFMMGPHWQ LNEDGSNCEE LVLRGVERFL ALSGIPGYKL VTSMAKAHVH AWLNGQSFGV
2401: RITYLELEQW VHLFQLLLMN GNQLLWSLQL SWEHIYLSSL GVTDGKEVVD FVRETYLSDV ELSELDSFMG GDLYLPGGWP KPFNLRDLTW YSRETTVRQN
2501: CMYLEFLGAQ YASHQPKISD NVKSRDRELA AGEPRIIYSI DSWTLKKVLF PKALIGSSCA PDAANFENDL ASKMLLFAAN WTIEQATEED IQLYLAWFSW
2601: FGSRLQQHCP FLLCFLNTLK VEFEHPIWNH ISRCRKNLKF LCRLDPDAVP IPMLSSKLID VAASNDQSKP YSKSLFESLN SVGVLRRSYQ QWLVESNDNH
2701: TDVSTFTRFL DSLRVLEKKI LCEIVGAPSF SVLIQLYTEV IDNHSFFWSG LVSSSDEYLL FSFWSLIKSI KKMHSFFPGE VQVVLEESKN INNIVLHGHP
2801: EKSMLWAYGG HPSLPVSAEL FHKQQEFLQL CSTVWPLKSE SDEHGNDHLT KAIPFSGPEL CLLALEGLCI SSYIADEDDV DYVAAVQLDE IYQTFLERLK
2901: LEKKRLEDKM GFSEIDNTEN ITASCCVFCP EIVTTGSGFS SWVKTCFIAS SESCSLDVEL LAALQHLLVA RPTEHQDLVD IRKLLKPALE YSLSSTRPPQ
3001: TLVAHQKLLW AIDAHASELG VDTKIAGFAL EIWYWWHSVL WKNSQIGLMN ISDTGNCQIL SPSMLIQPVK TATVAQILEN VFSVKDYSVQ SMKLLSASRY
3101: LWKSSQPYQE MPGSLLSIAR SLFQQIIYTH QKSFESETFV AIKSVFHAIE KKQNKMDGIQ NLISLIGSSS HNKLKSVTHS FVGPLAKRLY SDSSSNEFYC
3201: NLGLAWLYLG GLRFHLLNSL DVIDPAMKIT CKLLKLEEKI SSLELNIKVR GECGYLSGLL YSGNNDESSE HTLSKLKTEH KRLQRKVIFR SDPKKYQDLR
3301: RALDEFAGFL TRPISLVNDI EVLDWNQVVE QVFNWQETAI SFIDRMSSDY SEYVDITQPI QVSVYEMKLG LSLFVSGALL GKLLNRFDID MVDSVMETIY
3401: ALMRFPRDSS IASTTYTECL PPLHLSHGAN SRAKSLGLDV GLLHKLISVS SAEDSRKASE LQLKVALYKN LHARVLQFVA NTGLLDEASF ELLDKIYVEL
3501: ARIWMEMKFQ AKTKADNLPG LYKFRSRDFK IDSVMEVDIS ALGKYFPNES FSEWQEYLAD DDTKNVKDMT HIDQDEENLE DDWDLIQEHL DSIYSTHNEL
3601: FGFCDLSEKS GRFCITDSRR LDSFTDSYEL GVSMIKGLRG LFTSSLDAKL VPEHLLRLCL ENKKNFTSNY QSASKYNFYK DLDGPELGKM VKFLTPLQQR
3701: INSLLQERED HPGLQKLSGV LQMLLAIPSS TPLAKALSGL QFLLCKVHKL QEEGCKLPIS DLLEPIISLA SSWQKVEFER WPTLLDEVQD QYELNARKLW
3801: LPLFSVLFQK DAVEISEHEN ESISQSLVEF IETSNVGEFR RRLQLLFCFL LQLSMGSSLG IYSSDSHKRR VEMCYNIFGF YIQFLPVVME QLDLNRKNVE
3901: TELKEVLKLC RWERPDNYLY NETTKRTRQK VKKLIQKFTD MLRLPVMLVK PDLTKERAQF LPLLDPDLMD GASDMRIEVL VSALDAEQLR DRSSWYVVWW
4001: NKLKESVGRF HQEMHYKTLL MGAEHQYSSP VYQGDWKNLW STVARIGETI AGCSDLWRNS DRDVAKKRAL FELLKLLESS GLQKHKFENI EMSNHFKGLL
4101: YQPAYDPKHL LLLTHTKSNI HPSMGVEDQN KENSLVEWRV ANEFYFKSLA SVQLMLNIDR KHSDVTAEQV KRAISFLNHL VEIQRQQRKS AYAFAELFNR
4201: FRQCVLSLAR LLGDSVGADR KDDSVFSFPQ NQHAVFNCLW LQKQLFDNIT AMLLEESALL RTVGSTHLDS CQAVKTSSRS LLSFIEILIP IAQNSKASLD
4301: RLLLDCNGFI ITPSSSLKQF VTQHMVQVLR QNFDQLTDLE NQISSFCENN EKSYCRDVLL SQFSPVFKEG KLLAENLNCL LNVRDQSTGM EPKERLFLEE
4401: NLASIFANVK DVIGKLCSYK DGSLSQEEEM NITTWDGLFK KAENDLNLDN LCKLLSESFG SIEQLLNSSG VLSAGVGDQL KQLQAFLDLL LSFGDCYLKE
4501: FLAISKTVSL ITHVLASVLA DLFTKGFGIS KNEEDDDSKV DKSEAAEGTG MGDGVGAKDV SDQIEDEDQL HGTDKKEEEE KEQDDVLGKN KGIEMSDEFD
4601: GKEYSVSEDE EEDKEDEGSE DEPLDNGIGD VGSDAEKADE KPWNKDEEDE EENMNEKNES GPSIVDKDTR SRELRAKDDG VETADEPEES NTSDKPEEGN
4701: DENVEQDDFD DTDNLEEKIQ TKEEALGGLT PDVDNEQIDD DMEMDKTEEV EKEDANQQEE PCSEDQKHPE EGENDQEETQ EPSEENMEAE AEDRCGSPQK
4801: EEPGNDLEQE PETEPIEGKE VMSEDMMKPN FRNDNISGVE SGSQNPHGSN VLGAGSTAPQ ENLSATDVTD ELTDSMDLPS SSNTEMNLMM TNMANGETLT
4901: DNLPKMEFPQ NQSSTAQQTK VNPYRNVGDA LKEWKERVRI SSDLGEKQEA ENEMEDPDAS EYGFASQFDA GTSQALGPAL PEQVNTDMRE GESEEEKLAG
5001: NQDDVSPMDI DDLNPENKPA VQSKPSISNS IAEQVQEPDT DRTHQENSPI HNFGDGNSRM DSMVSVDNTF LGEEACNLDR MQVTDNDSES NQDNQEDPDA
5101: RSNAVVLWRR CELLTAKPSQ ELAEQLRLIL EPTLASKLSG DYRTGKRINM KKVIPYIASH YRKDKIWLRR TKPNKRDYQV VIAVDDSRSM SESGCGDFAI
5201: RALATVCRAM SQLELGSLAV ASFGKQGSIK MLHDFGQSFT TESGIKMISN LTFKQENLIE DQPVVNLLRN MNEMLENLAS TRRQSYGSNP LQQLVLIIGD
5301: GKFHEREKLK RTVRSFLQQK RMVVYLLLDD AEQSVFDLAD YVYDGERRPY KKMNYLDSFP FPYYIVLRDI EALPRTLGDV LRQWFELMQS SRD
Arabidopsis Description
MDN1ATPases;nucleotide binding;ATP binding;nucleoside-triphosphatases;transcription factor binding [Source:TAIR;Acc:AT1G67120]
SUBAcon: [cytosol]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.