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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:cytosol
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra027152.1-P Field mustard cytosol 80.96 92.56
CDY53049 Canola cytosol 92.14 92.25
CDY47220 Canola cytosol 91.15 91.27
KXG24803 Sorghum cytosol 15.36 83.89
VIT_01s0127g00430.t01 Wine grape cytosol 83.05 82.94
KRH62223 Soybean cytosol 82.19 82.19
Solyc04g015350.2.1 Tomato cytosol 81.08 80.98
KRH52943 Soybean cytosol 80.47 80.67
GSMUA_Achr1P21120_001 Banana cytosol 77.52 71.38
TraesCS5A01G054400.1 Wheat cytosol, plastid 70.64 69.87
TraesCS5D01G065700.1 Wheat cytosol, plastid 70.27 69.5
Os05t0180600-02 Rice cytosol 69.29 69.29
Zm00001d050219_P004 Maize cytosol, plasma membrane 69.29 68.03
TraesCS5B01G062000.3 Wheat cytosol, plastid 70.52 67.13
HORVU5Hr1G013230.1 Barley cytosol, plastid 70.52 64.13
Os08t0307400-02 Rice cytosol 57.74 56.83
AT1G51040.1 Thale cress cytosol 14.37 22.29
AT5G09350.1 Thale cress cytosol 12.53 9.14
AT5G64070.1 Thale cress cytosol 12.41 9.01
AT1G49340.2 Thale cress cytosol 19.41 7.79
Protein Annotations
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PFscan:PS51545PFscan:PS51547PANTHER:PTHR10048PANTHER:PTHR10048:SF62SMART:SM00142SMART:SM00145
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SEG:seg:::::
Description
ATVPS34Phosphatidylinositol 3-kinase VPS34 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P42339]
Coordinates
chr1:-:22285572..22290389
Molecular Weight (calculated)
93332.7 Da
IEP (calculated)
6.748
GRAVY (calculated)
-0.264
Length
814 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MGANEFRFFL SCDINSPVTF RIEKLDGNLP VKKSSDSGVV SIAEEKKPEL YIECALYIDG APFGLPMRTR LKTTGPPYCW NELITLSSKY RDLTAHSQLA
101: ITVWDVSCGK TEGLIGGATV LLFNSKMQMK SGKQKLRLWQ GKEADGSFPT STPGKVPRHE RGELERLEKL MNKYERGQIQ SIDWLDRLML KSLDTIKEQE
201: STKHGSSHLF VVIDFCSFEH RVVFQESGAN LFITAPIGST NEFVTVWDTE LGKTNPSENK QLKLARSLDR GIIDRDLKPS NIERKSIQRV LKYPPTRTLS
301: GDERQLLWKF RFSLMSEKRA LTKFLRCVEW SDVQEAKQAI QLMYKWEMID VCDALELLSP LFESEEVRAY AVSVLERADD EELQCYLLQL VQALRFERSD
401: RSCLSQFLVQ RALQNIELAS FLRWYVAVEL HDHVYAKRFY STYELLEENI IKLPPGVNGE DGYQLWQSLV RQTELTAQLC SITREVRNVR GNTQKKIEKL
501: RQLLGGLLSE LTYFEEPIRS PLTPNVLIKG IVAGESSLFK SALHPLRLTF RTPEEGGSCK LIFKKGDDLR QDQLVVQMVW LMDRLLKLEN LDLCLTPYKV
601: LATGHDEGML EFIPSRSLAQ ILSEHRSITS YLQKFHPDEH APFGITATCL DTFIKSCAGY SVITYILGIG DRHLDNLLLT DDGRLFHVDF AFILGRDPKP
701: FPPPMKLCKE MVEAMGGAES QYYTRFKSYC CEAYNILRKS SNLILNLFHL MAGSTIPDIA SDPEKGILKL QEKFRLDMDD EACIHFFQDL INESVSALFP
801: QMVETIHRWA QYWR
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.