Subcellular Localization
min:
: max
Winner_takes_all: cytosol
Predictor Summary:
Predictor Summary:
- endoplasmic reticulum 1
- golgi 1
- extracellular 1
- cytosol 3
- mitochondrion 1
| Predictors | GFP | MS/MS | Papers |
|---|---|---|---|
PPI
No PPI Data
Homology
Paralog
| locus | Identity | Homology Identity |
|---|
Ortholog
| locus | Homology Species | Location | Identity | Homology Identity |
|---|---|---|---|---|
| Bra022172.1-P | Field mustard | cytosol | 95.24 | 95.24 |
| CDX92089 | Canola | cytosol | 95.24 | 95.24 |
| CDY43119 | Canola | cytosol | 95.24 | 95.24 |
| Bra001637.1-P | Field mustard | cytosol | 89.88 | 89.88 |
| CDX75889 | Canola | cytosol | 89.88 | 89.88 |
| CDX82396 | Canola | cytosol | 89.88 | 89.88 |
| Bra021187.1-P | Field mustard | cytosol | 89.29 | 89.29 |
| CDY28353 | Canola | cytosol | 89.29 | 89.29 |
| CDY34963 | Canola | cytosol | 89.29 | 89.29 |
| OQU84170 | Sorghum | cytosol | 77.98 | 78.44 |
| Zm00001d014957_P001 | Maize | plastid | 76.19 | 76.65 |
| Os11t0660500-01 | Rice | extracellular | 76.19 | 76.19 |
| HORVU4Hr1G033200.1 | Barley | cytosol | 75.0 | 75.0 |
| TraesCS4B01G144200.1 | Wheat | cytosol, golgi, plastid, unclear | 73.81 | 73.81 |
| TraesCS4A01G169100.1 | Wheat | cytosol | 72.62 | 72.62 |
| AT3G05540.1 | Thale cress | cytosol | 72.02 | 72.02 |
| Zm00001d014954_P002 | Maize | cytosol | 75.6 | 70.56 |
| TraesCS4D01G145400.1 | Wheat | cytosol | 54.17 | 70.0 |
| KXG28492 | Sorghum | cytosol | 52.98 | 65.93 |
| TraesCS6B01G002800.1 | Wheat | cytosol | 65.48 | 63.95 |
Protein Annotations
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| InterPro:TCTP | Symbol:TCTP | InterPro:Translation_control_tumour_CS | InterPro:Translational_control_tumour_p | UniParc:UPI0000000E2B | EMBL:Z18387 |
| SEG:seg | : | : | : | : | : |
Description
TCTP1Translationally-controlled tumor protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P31265]
Coordinates
chr3:-:5669317..5670842
Molecular Weight (calculated)
18911.3 Da
IEP (calculated)
4.258
GRAVY (calculated)
-0.286
Length
168 amino acids
Sequence
(BLAST)
(BLAST)
001: MLVYQDLLTG DELLSDSFPY KEIENGILWE VEGKWVTVGA VDVNIGANPS AEEGGEDEGV DDSTQKVVDI VDTFRLQEQP TYDKKGFIAY IKKYIKLLTP
101: KLSEEDQAVF KKGIEGATKF LLPRLSDFQF FVGEGMHDDS TLVFAYYKEG STNPTFLYFA HGLKEVKC
101: KLSEEDQAVF KKGIEGATKF LLPRLSDFQF FVGEGMHDDS TLVFAYYKEG STNPTFLYFA HGLKEVKC
Hydropathy Plot
About CropPAL
The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.