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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 2
  • mitochondrion 1
  • plastid 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus, plastid
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:cytosol
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:plastid
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra031406.1-P Field mustard nucleus 54.65 70.1
CDY52319 Canola plastid 59.52 69.22
CDY25311 Canola cytosol, plastid 59.52 67.47
PGSC0003DMT400055915 Potato cytosol 40.99 45.93
Solyc02g079850.2.1 Tomato cytosol 37.15 44.43
GSMUA_Achr5P22350_001 Banana cytosol 39.8 43.39
KRH49913 Soybean cytosol 45.35 42.38
KRH41976 Soybean cytosol 45.26 42.23
Zm00001d017029_P001 Maize cytosol 37.66 41.29
TraesCS5B01G485600.1 Wheat cytosol, plastid 38.17 41.08
TraesCS5D01G485400.1 Wheat cytosol, plastid 38.17 40.97
TraesCS5A01G472700.3 Wheat cytosol 38.43 40.58
EES05335 Sorghum plastid 38.17 40.53
Os03t0669800-01 Rice plasma membrane 32.11 40.34
GSMUA_Achr7P20370_001 Banana nucleus 33.56 37.61
VIT_00s0361g00100.t01 Wine grape cytosol 34.59 36.16
OQU88236 Sorghum nucleus 32.37 35.86
AT1G20110.1 Thale cress cytosol 4.7 9.15
Protein Annotations
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EnsemblPlantsGene:AT1G61690RefSeq:AT1G61690TAIR:AT1G61690RefSeq:AT1G61690-TAIR-GEnsemblPlants:AT1G61690.1TAIR:AT1G61690.1
Unigene:At.43853EMBL:BT010746ncoils:CoilGO:GO:0003674GO:GO:0005488GO:GO:0005515
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PO:PO:0025281PFscan:PS50178PANTHER:PTHR22835PANTHER:PTHR22835:SF469UniProt:Q6NPS1SMART:SM00028
SMART:SM00064SUPFAM:SSF48452SUPFAM:SSF57903InterPro:TPR-like_helical_dom_sfInterPro:TPR_repeatUniParc:UPI0000224689
InterPro:Znf_FYVEInterPro:Znf_FYVE-relInterPro:Znf_FYVE_PHDInterPro:Znf_RING/FYVE/PHDSEG:seg:
Description
At1g61690 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6NPS1]
Coordinates
chr1:-:22782427..22786942
Molecular Weight (calculated)
128951.0 Da
IEP (calculated)
5.521
GRAVY (calculated)
-0.920
Length
1171 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MLEKIGLPPK PSLRGNSWVV DASHCQGCSS QFTFINRKHH CRRCGGLFCG TCTQQRLSLR GQGDSPVRIC EPCKKIEEAA RFELRHGYKN RAAKGGSSKR
0101: TVKNEDDVLS EILGSDVDVS SSSESVSSTD RNASKEMASS SSNKGMELDA SPEELRKQAV EAKNKYRILK GEGKSDEALK AFKRGRELER EADALEISLR
0201: RNRKRELSMR NVAETQNKAA TKESSKSQKP LRQGGKGNDD LAADLRELGW SDDEDKKPAT ISLEGEFSSL LREIPRSANP QKTGGIDKSQ VIALKRKALT
0301: LKREGKLAEA KDELKKAKIL ERELEEQELL GGADGSDDEL SALINSMDDD KEDDLLAQYE GSHDFDISNL VGNLDDIGVH GEYDVTDEDM EDPAIAAALK
0401: SLGWSEDPGH HENVHSRPSP KNRDESLAEI QTLKREALNL KRAGNVVEAM ATLKKAKLLE KELEAADTSS ETVDTTRAER DTSLKPPPRS RLAIQKELLA
0501: VKKKALTLRR EGKFNEAEEE LKKGAVLQNQ LDELDNSSKL AATGKATREK GNDLPDISSL DDDGEVDVKD EELNDPNYLS MLKSLGWNDE DNNPAGPSSE
0601: KSDPLNSRPG KTAEAQGAYE VRVTKPRRTK AEIQRELLGL KRKALTLRRQ GNVDEAEEVL NQTQILEAQI MEIDSGKNLY ADSDQPKKRS NDLATDSRLN
0701: GGDDSVTEND MKDPALLSTL KNLGWEDEEP KKEEASFGSV QSSGPRIAAK SKGQIQRELL DLKRKALAFK RQGKTGDADE LYSKASVLEA QLAELETPKM
0801: EMKGSASAIK PENYMDVDLL VGSQMEDKAI KSASVSHAPQ DSYDLLGDFI SPAKSGSSGV VSQPGQQQPS MMDLLTGEHS ERSQIHAEKG NAETMSGFRS
0901: GNNHGAEQRV AREESEPSHI QSASIQNTSP QNTLKQEILA HKKKALALKR EGNISEAKKA LQEAKLLERR LQEGENPSPE KLGRDDMVST TEDPPAREKE
1001: NSPSSSAPKA MSGRDRFKLQ QESLSHKRQA MKLRREGKMQ EAEAEFEIAK TLEAQLEDST SSKPEPVDDV AVEDFLDPQL LSALKAIGLD NPVNPPPVSK
1101: TDTTQAAAKP NPVKESNRNT NNQERSQLEE RIKAEKVKAV TFKRAGKQAE ALDALRRAKL YEKKLNALAS S
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.