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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • plastid 2
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra040682.1-P Field mustard cytosol 94.67 94.67
CDY35873 Canola cytosol 94.43 94.43
CDY67021 Canola cytosol 82.08 94.43
CDY66989 Canola cytosol 81.84 93.89
VIT_11s0016g02290.t01 Wine grape cytosol 80.39 80.39
CDY13554 Canola cytosol 33.41 79.77
KRH02720 Soybean cytosol, nucleus 79.42 79.42
KRH19149 Soybean cytosol, nucleus 78.45 79.02
PGSC0003DMT400034206 Potato cytosol 75.79 75.42
Solyc07g039210.2.1 Tomato nucleus 75.3 74.94
PGSC0003DMT400056705 Potato cytosol 30.99 71.91
GSMUA_Achr7P18480_001 Banana cytosol 71.43 71.43
EER98853 Sorghum cytosol 64.16 64.79
Os09t0386400-01 Rice cytosol 63.68 64.3
TraesCS5D01G207800.1 Wheat cytosol 63.68 64.3
TraesCS5A01G201500.1 Wheat cytosol 63.44 64.06
TraesCS5B01G200200.1 Wheat cytosol 63.44 64.06
HORVU5Hr1G059930.4 Barley cytosol 63.2 63.81
Zm00001d020359_P003 Maize cytosol 63.44 61.22
CDY13555 Canola cytosol, nucleus, vacuole 20.58 44.27
Protein Annotations
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UniProt:Q8GWE6UniParc:UPI00000ADFCCInterPro:WH-like_DNA-bd_sfSEG:seg::
Description
EER5Enhanced ethylene response protein 5 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8GWE6]
Coordinates
chr2:-:8465690..8469145
Molecular Weight (calculated)
47617.0 Da
IEP (calculated)
9.626
GRAVY (calculated)
-0.185
Length
413 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MAYVSMGEAH RRITEYLNRF CDAVSYQDSS TLCRLLSFSS NSPPLLSLAD ALNVFQDSSS LIRQSDRFSE YGEILAHVFR SLQSYRVGNL VEAYLAFDKF
101: ANAFVQEFRN WESAWALEAL YVVCYEIRVL AEKADKDLTS NGKSPEKLKA AGSLLMKVFG VLAGKGPKRV GALYVTCQLF KTYFKLGTVN LCRSVIRSIE
201: TARIFDFEEF PRRDKVTYMY YTGRLEVFNE NFPAADTKLS YALQNCNPKR ERNIRMILKY LVPVKLSLGI IPKDELLRNY NLHEYTKIVQ ALRKGDLRLL
301: RHALQEHEDR FLRSGVYLVL EKLELQVYQR LMKKIYINQK LSDPARAHQL KLEGIAKALR WLDMDMDLDE VECIMTILIY KNLVKGYLAH KSKVVVLSKQ
401: DPFPKLNGKP VSS
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.