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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 9
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra038863.1-P Field mustard plastid 93.96 93.39
AT5G66570.1 Thale cress plastid 90.94 90.66
CDY26519 Canola plastid 92.14 81.77
CDY33308 Canola plastid 92.45 80.31
VIT_00s0207g00210.t01 Wine grape plastid 79.76 79.52
KRH69993 Soybean mitochondrion, nucleus 77.95 79.14
KRH76911 Soybean nucleus, plastid 77.64 78.12
HORVU2Hr1G057700.2 Barley plastid 77.34 78.05
VIT_18s0001g11710.t01 Wine grape plastid 77.95 77.95
KRH28553 Soybean nucleus, plastid 77.34 77.81
Zm00001d036535_P001 Maize plastid 77.34 77.81
TraesCS2B01G270300.2 Wheat plastid 77.04 77.74
TraesCS2D01G248400.2 Wheat plastid 77.04 77.74
KRH08348 Soybean nucleus, plastid 77.64 77.64
KXG20702 Sorghum plastid 77.34 77.11
TraesCS2A01G247300.3 Wheat plastid 77.04 76.81
Os01t0501800-01 Rice extracellular, plastid 77.04 76.58
Zm00001d014564_P001 Maize plastid 76.44 67.83
GSMUA_AchrUn_... Banana plastid 22.36 63.25
AT4G37230.1 Thale cress cytosol, nucleus, plastid 25.68 59.44
Protein Annotations
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PANTHER:PTHR34058PANTHER:PTHR34058:SF6UniProt:Q9S841SUPFAM:SSF56925UniParc:UPI0000000BBA:
Description
PSBO2Oxygen-evolving enhancer protein 1-2, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9S841]
Coordinates
chr3:-:18890874..18892508
Molecular Weight (calculated)
35021.1 Da
IEP (calculated)
5.958
GRAVY (calculated)
-0.348
Length
331 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MATSLQAAAT FLQPAKIAAS PSRNVHLRSN QTVGKSFGLD SSQARLTCSL HSDLKDFAGK CSDAAKIAGF ALATSALVVS GAGAEGAPKR LTYDEIQSKT
101: YMEVKGTGTA NQCPTIDGGS ETFSFKAGKY TGKKFCFEPT SFTVKADSVS KNAPPDFQNT KLMTRLTYTL DEIEGPFEVG SDGSVKFKEE DGIDYAAVTV
201: QLPGGERVPF LFTVKQLEAS GKPESFSGKF LVPSYRGSSF LDPKGRGGST GYDNAVALPA GGRGDEEELS KENVKNTAAS VGEITLKITK SKPETGEVIG
301: VFESLQPSDT DLGAKVPKDV KIQGVWYGQI E
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.