Factsheet for AT4G03280.1

Subcellular Localization

min:

: max

Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:

plastid 9

Predictors

GFP

MS/MS

Papers

Winner Takes All:	plastid
Any Predictor:	plastid
BaCelLo:	plastid
ChloroP:	plastid
iPSORT:	plastid
MultiLoc:	plastid
Predotar:	plastid
PProwler:	plastid
TargetP:	plastid
WoLF PSORT:	plastid
YLoc:	plastid

PPI

No PPI Data

Homology

Paralog

locus	Identity	Homology Identity

Ortholog

locus	Homology Species	Location	Identity	Homology Identity
Bra034200.1-P	Field mustard	plastid	89.96	89.18
CDY22118	Canola	plastid	89.96	89.18
CDY21952	Canola	plastid	89.08	88.31
CDY17951	Canola	plastid	88.21	87.45
CDX90891	Canola	plastid	87.77	87.01
Bra000837.1-P	Field mustard	plastid	87.77	87.01
Solyc12g005630.1.1	Tomato	plastid	76.42	75.76
PGSC0003DMT400035747	Potato	plastid	75.55	75.22
KRH22477	Soybean	nucleus, plastid	74.24	74.89
KRH26877	Soybean	plastid	73.8	74.45
GSMUA_Achr9P24590_001	Banana	plastid	72.05	72.37
Os07t0556200-01	Rice	plastid	69.0	70.22
Zm00001d053432_P001	Maize	plastid	69.43	70.04
EES19551	Sorghum	plastid	69.0	69.91
VIT_12s0134g00510.t01	Wine grape	plastid	69.0	69.91
Zm00001d016134_P002	Maize	plastid	67.69	68.58
TraesCS2D01G214700.1	Wheat	plastid	65.94	68.02
TraesCS2A01G207900.1	Wheat	plastid	65.5	67.57
TraesCS2B01G234500.1	Wheat	plastid	65.5	67.57
HORVU2Hr1G041610.3	Barley	plastid	64.63	64.07
GSMUA_Achr10P...	Banana	plastid	58.95	62.79

Protein Annotations

KEGG:00195+1.10.9.1	MapMan:1.1.2.3	Gene3D:1.20.5.700	Gene3D:2.102.10.10	EntrezGene:827996	ProteinID:AAD14456.1
ProteinID:AEE82301.1	ProteinID:AEE82302.1	EMBL:AF370566	EMBL:AF410296	EMBL:AJ243702	ArrayExpress:AT4G03280
EnsemblPlantsGene:AT4G03280	RefSeq:AT4G03280	TAIR:AT4G03280	RefSeq:AT4G03280-TAIR-G	EnsemblPlants:AT4G03280.1	TAIR:AT4G03280.1
EMBL:AY093726	ProteinID:CAB77813.1	ProteinID:CAC03598.1	InterPro:Cyt_b6-f_cplx_Fe-S_su	InterPro:Cyt_b6_f_Rieske	GO:GO:0003674
GO:GO:0003824	GO:GO:0005488	GO:GO:0005515	GO:GO:0005575	GO:GO:0005622	GO:GO:0005623
GO:GO:0005737	GO:GO:0005886	GO:GO:0006091	GO:GO:0006950	GO:GO:0008150	GO:GO:0008152
GO:GO:0009496	GO:GO:0009507	GO:GO:0009512	GO:GO:0009534	GO:GO:0009535	GO:GO:0009536
GO:GO:0009579	GO:GO:0009605	GO:GO:0009607	GO:GO:0009628	GO:GO:0009767	GO:GO:0009941
GO:GO:0009987	GO:GO:0010196	GO:GO:0015979	GO:GO:0016020	GO:GO:0016021	GO:GO:0016491
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InterPro:IPR036922	HAMAP:MF_01335	RefSeq:NP_192237.1	RefSeq:NP_849295.1	Symbol:PETC	PFAM:PF00355
PFAM:PF08802	PO:PO:0000013	PO:PO:0000037	PO:PO:0000084	PO:PO:0000230	PO:PO:0000293
PO:PO:0001054	PO:PO:0001078	PO:PO:0001081	PO:PO:0001185	PO:PO:0004507	PO:PO:0006339
PO:PO:0007064	PO:PO:0007095	PO:PO:0007098	PO:PO:0007103	PO:PO:0007115	PO:PO:0007123
PO:PO:0007131	PO:PO:0007611	PO:PO:0007616	PO:PO:0008019	PO:PO:0009001	PO:PO:0009005
PO:PO:0009006	PO:PO:0009009	PO:PO:0009010	PO:PO:0009025	PO:PO:0009029	PO:PO:0009030
PO:PO:0009031	PO:PO:0009032	PO:PO:0009046	PO:PO:0009047	PO:PO:0009052	PO:PO:0020030
PO:PO:0020038	PO:PO:0020100	PO:PO:0020137	PO:PO:0025022	PO:PO:0025281	PRINTS:PR00162
PFscan:PS51296	PANTHER:PTHR10134	PANTHER:PTHR10134:SF5	UniProt:Q9ZR03	InterPro:Rieske_2Fe-2S	InterPro:Rieske_2Fe-2S_sf
InterPro:Rieske_Fe-S_prot	InterPro:Rieske_Fe-S_prot_C	SUPFAM:SSF50022	TMHMM:TMhelix	UniParc:UPI000009C583	SEG:seg

Description

PETCCytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9ZR03]

Coordinates

chr4:+:1440146..1441863

Molecular Weight (calculated)

24367.4 Da

IEP (calculated)

8.728

GRAVY (calculated)

-0.087

Length

229 amino acids

Sequence
(BLAST)

001: MASSSLSPAT QLGSSRSALM AMSSGLFVKP TKMNHQMVRK EKIGLRISCQ ASSIPADRVP DMEKRKTLNL LLLGALSLPT GYMLVPYATF FVPPGTGGGG
101: GGTPAKDALG NDVVAAEWLK THGPGDRTLT QGLKGDPTYL VVENDKTLAT YGINAVCTHL GCVVPWNKAE NKFLCPCHGS QYNAQGRVVR GPAPLSLALA
201: HADIDEAGKV LFVPWVETDF RTGDAPWWS

Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.