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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
  • plastid 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus, plastid
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:cytosol
Predotar:plastid
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
AT3G08850.1 Thale cress cytosol 81.14 80.65
KRH00387 Soybean nucleus 71.26 69.74
VIT_08s0058g00890.t01 Wine grape cytosol 71.11 69.7
KRH40797 Soybean nucleus 71.41 69.48
PGSC0003DMT400043895 Potato cytosol 69.84 69.27
Solyc09g014780.2.1 Tomato nucleus 70.13 69.25
GSMUA_AchrUn_... Banana cytosol 63.17 68.79
Os11t0109933-01 Rice cytosol 58.91 64.61
GSMUA_Achr5P14390_001 Banana cytosol 66.47 63.75
TraesCS5D01G143600.3 Wheat plastid 63.92 62.61
Os12t0110000-01 Rice cytosol, plastid 63.55 62.47
TraesCS5B01G147900.4 Wheat plastid 63.7 62.39
TraesCS5A01G149200.2 Wheat plastid 63.7 62.34
OQU82706 Sorghum cytosol, plastid 62.8 62.19
EES16504 Sorghum plastid 62.72 61.26
KRH40804 Soybean cytosol 5.99 58.39
Zm00001d005064_P002 Maize plastid 9.73 52.21
GSMUA_AchrUn_... Banana cytosol 6.44 40.76
Protein Annotations
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PRINTS:PR01547PFscan:PS50294PANTHER:PTHR12848PANTHER:PTHR12848:SF16UniProt:Q9LZW9Symbol:RAPTOR1A
InterPro:RaptorInterPro:Raptor_NSMART:SM00320SMART:SM01302SUPFAM:SSF48371SUPFAM:SSF50978
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Description
RAPTOR2Regulatory-associated protein of TOR 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9LZW9]
Coordinates
chr5:-:294313..301984
Molecular Weight (calculated)
147648.0 Da
IEP (calculated)
6.464
GRAVY (calculated)
-0.062
Length
1336 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MALGDLMVSR LSQSSVTVVT NHLYDDDDNC ASSAHDDSRV SIIASPRVAS SSYENLSAAT SMAYLPQTLV LCDLRHDDAS DIVQPPRWRL KERMKTGCVA
0101: LVMCLHITVD PPDVIKISPC ARLECWIDPF SMFPPRRALE AIGQNLSIQY ERWLARARYK VELDPTKDDV RKLCLSCRKY AKTERVLFHY NGHGVPKPTP
0201: NGEIWVYNKN FTQYIPLPVS ELDSWLKTPT IYVFDCSAAR VILNAFAEGE SSGPPKDCIL LAACDVHETL PQSVEFPADV FTSCLTTPIN IALKWFCRRS
0301: LLKEFIDESL IDRIPGRQND RKTLLGELNW IFTAVTDTIA WNVLPRELFQ RLFRQDLLVA SLFRNFLLAE RIMRSGNCTP ISHPMLPPTH QHHMWDAWDM
0401: AAEICLSQLP QFFLDPNTEF QPSSFFTEQL TAFEVWLDHG SEHKKPPEQL PIVLQVLLSQ CHRYRALVLL GRFLDMGPWA VDLALSVGIY PCVVKLLQTT
0501: TIELRQILVF IWTKILALDK SCQVDLVKDR GHIYFIRFLD SSDAFPEQRA MAAFILAVIV DGYKRGQESC LEANLIAVCL GHLEATQLCD PPPEPLFLQW
0601: LCLCLGKLWE DYLEAQIMGR EANASENLIA GHTNLLQVRA AAVFALGTLL DVGFDSGKGV CDEEFDDDEN IVEDIIIKSL LDVVSDGSPL VRTEVAVALA
0701: RFAFGHKQHL KSVADSYWKP QNSLRTSLPS MAKFHDSGTS IVASSDMGSL TRASPDSQPV AREGRISSSL QEPFSGLMQG SPLADDSSLH SDVGIIHDGV
0801: SNGVVHQPRP LDNAIYSQSV LAMFTLAKDP SPRIASLGRR VLSVIGIEQI VAKPSKSNGR PGEAASASHT PLAGLVRSSS WFDMHTGHLP LTFRTPPVSP
0901: PQTSYLTGLR RVCSLELRPH LLGSPDSGLA DPILGVSGSE RSLLPQSTIY NWSCGHFSKP LLGGADANEE IAAQREEKKK FSLEHIAKCQ HSSISGLSNI
1001: PIANWDTKFE TGTKTALLHP FSPIVVAADE NERIRVWNYE EATLLNGFDN NDFPDKGISN LCLVNELDDS LLLVASCNVP TLSRASFAIR IWKDYATKGR
1101: QKLVTGFSSI QGQKPGASGL NAVVDWQQQS GYLYVSGESL SIMVWDLDKE QLVKSMPFES GCSVTALSAS QVHGSQLAAG FADGSVRLYD VRTPDFLVCA
1201: TRPHQRVEKV VGLSFQPGLD PAKIVSASQA GDIQFLDLRR PKETYLTIDA HRGSLTALGV HRHAPIIASG SAKQLIKVFS LKGEQLGIIK YHTSFMGQQI
1301: GPVSCLAFHP YQMLLAAGAA GSFVSLYTHH NTQLPR
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.