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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion

Predictor Summary:
  • plastid 3
  • mitochondrion 6
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX84484 Canola plastid 91.93 92.58
CDY43784 Canola plastid 91.93 92.58
Bra024262.1-P Field mustard plastid 90.18 88.01
VIT_03s0038g04080.t01 Wine grape plastid 77.02 77.56
KRH66310 Soybean nucleus 74.74 76.21
KRH48974 Soybean plastid 74.21 75.27
Zm00001d026115_P001 Maize cytosol 24.39 75.14
GSMUA_Achr8P25460_001 Banana mitochondrion 74.91 74.78
Os02t0121000-01 Rice plastid 74.39 74.78
Zm00001d015037_P002 Maize mitochondrion, plastid 73.33 74.25
TraesCS6D01G068300.1 Wheat mitochondrion, plastid 72.46 73.88
TraesCS6B01G094500.1 Wheat mitochondrion, plastid 72.46 73.75
Solyc01g112290.2.1 Tomato plastid 73.68 73.68
TraesCS6A01G070500.1 Wheat plastid 72.11 73.52
Zm00001d053389_P001 Maize cytosol 15.44 72.73
EES06189 Sorghum mitochondrion, plastid 72.63 72.5
HORVU6Hr1G012710.2 Barley cytosol, plastid 71.93 71.55
Zm00001d053901_P001 Maize mitochondrion, plastid 72.63 70.89
GSMUA_Achr11P... Banana cytosol 6.67 64.41
Zm00001d003735_P001 Maize cytosol 4.04 52.27
Zm00001d012985_P001 Maize cytosol, extracellular 4.39 44.64
Protein Annotations
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GO:GO:0043039GO:GO:0048481InterPro:Glu-tRNA-ligase_bac/mitoInterPro:Glu/Gln-tRNA-synthInterPro:Glu/Gln-tRNA-synth_Ib_cat-domInterPro:GluRS_core
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InterPro:aa-tRNA-synth_I_codon-bd_sub2:::::
Description
OVA3Glutamate--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9FEA2]
Coordinates
chr5:-:25629832..25633209
Molecular Weight (calculated)
63469.2 Da
IEP (calculated)
7.865
GRAVY (calculated)
-0.238
Length
570 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MASLVYGTPW LRVRSLPELA PAFLRRRQSS LFYCSRRSFA VVACSTPVNN GGSVRVRFAP SPTGNLHVGG ARTALFNYLF ARSKGGKFVL RIEDTDLERS
101: TRESEAAVLQ DLSWLGLDWD EGPGVSGDFG PYRQSERNAL YKQYAEKLLE SGHVYRCFCS SEELVKMKEN AKLKQLPPVY TGKWATASDA EIEQELEKGT
201: PFTYRFRVPK EGSLKINDLI RGEVCWNLDT LGDFVVMRSN GQPVYNFCVT VDDATMAISH VIRAEEHLPN TLRQALIYKA LKFPMPQFAH VSLILAPDRS
301: KLSKRHGATS VGQYREMGYL PQGMVNYLAL LGWGDGTENE FFTLEDLVEK FSIERVNKSG AIFDSTKLRW MNGQHLRALP NEKLTKLVGE RWKSAGILTE
401: SEGSFVNEAV ELLKDGIELV TDSDKVLLNL LSYPLHATLA SPEAKPAVED KLHEVAASLI AAYDSGEIPS ALEEGQGAWQ KWVKAFGKSL KRKGKSLFMP
501: LRVLLTGKLH GPEMGTSIVL IYKAGSPGIV VPQAGFVSME ERFKILREID WEALNKDESV PLESTATVST
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.