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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion, plastid

Predictor Summary:
  • plastid 5
  • mitochondrion 4
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY26899 Canola plastid 89.68 90.06
Bra010169.1-P Field mustard plastid 89.89 89.52
CDY32277 Canola plastid 89.47 88.54
KRH28278 Soybean plastid 54.53 56.8
Solyc08g007010.2.1 Tomato plastid 57.47 56.29
PGSC0003DMT400052824 Potato plastid 57.68 56.15
KRH77216 Soybean plasma membrane 35.37 56.0
VIT_02s0012g01050.t01 Wine grape plastid 43.79 55.47
VIT_03s0017g01730.t01 Wine grape mitochondrion 32.42 55.2
GSMUA_Achr10P... Banana plastid 54.74 53.06
TraesCS3D01G032700.1 Wheat plastid 44.0 44.09
TraesCS3A01G047200.1 Wheat plastid 43.79 43.88
KRH63379 Soybean cytosol 19.37 43.81
TraesCS3B01G035600.1 Wheat plastid 43.58 43.49
EES02550 Sorghum plastid 43.37 43.01
Zm00001d008549_P002 Maize plastid 43.37 42.83
Os01t0127300-01 Rice plasma membrane 41.68 41.08
HORVU3Hr1G004330.1 Barley plastid 43.37 40.63
AT4G04770.1 Thale cress plastid 20.21 17.24
AT5G44316.1 Thale cress plastid 16.0 16.17
Protein Annotations
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Description
ABCI7At1g32500 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q058Q9]
Coordinates
chr1:-:11749798..11752190
Molecular Weight (calculated)
52827.5 Da
IEP (calculated)
5.828
GRAVY (calculated)
-0.322
Length
475 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MAAATVLGRL SLIPNLSSKP KLKSNRRTTS TSVSVRAQAS FSDPFVLQLA ESLEDSLSAS PSSSLPLQRI RDSSAETLLS TPWPSRKDEP FRFTDTSLIR
101: SSQIEPISTQ QRNSEILDNL TETQFTNAVI IDGFVSNLTI GPSDLPDGVY FGKYSGLPDE LTNRISEFIG NFDSGDLFWS INGMGAPDLM VIYVPEGCKV
201: ENPIYLRYFS GETGDRESKR LPVSNPRVFV LVEEGGEIGI VEEFVGKDEE GFYWTNPVLE VVVQKNAKLK HSYLQKESMA SAHIKWTFVR QEAESEYELV
301: EVSTGGKLGR HNVHVQQLGP DTLTELTTFH MCVNEQTLDL HSKIILDHPR GASRQLHKCI VAHSSGQAVF DGNVRVNRFA QQTNAGQLTR SLLLKPRATV
401: NIKPNLQIIA DDVKCSHGAA ISDLEEDQLF YFQARGIDLE TARRALISSF GSEVIEKFPN REIRDQARNH VKGLL
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.