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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:cytosol
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY22060 Canola cytosol 95.8 95.8
CDY21896 Canola cytosol 95.66 95.66
CDX90932 Canola cytosol 95.26 95.26
Bra000874.1-P Field mustard cytosol 95.12 95.12
CDY18013 Canola cytosol 95.12 95.12
KRG96405 Soybean cytosol 81.03 81.03
KRH68142 Soybean cytosol 80.22 79.89
AT1G43140.1 Thale cress cytosol 70.05 71.71
Bra036257.1-P Field mustard cytosol, nucleus, peroxisome 95.53 71.5
AT1G02980.1 Thale cress cytosol 69.65 69.27
GSMUA_Achr9P17620_001 Banana cytosol 63.28 63.37
AT1G59790.1 Thale cress cytosol 31.98 63.1
AT1G59800.1 Thale cress cytosol 19.78 57.25
Solyc01g099290.2.1 Tomato cytosol 14.09 39.1
PGSC0003DMT400063662 Potato cytosol 14.63 37.24
AT1G26830.1 Thale cress cytosol 34.15 34.43
AT1G69670.1 Thale cress cytosol 32.52 32.79
Os05t0193900-00 Rice cytosol 17.62 32.26
EES04173 Sorghum cytosol 12.33 31.82
HORVU3Hr1G098530.4 Barley cytosol 12.74 31.23
TraesCS3B01G497300.1 Wheat cytosol 12.47 30.67
Zm00001d042193_P001 Maize cytosol 12.06 30.48
AT5G46210.1 Thale cress cytosol 32.38 30.18
Os01t0935300-02 Rice cytosol 12.2 30.0
TraesCS3A01G457400.1 Wheat cytosol 12.2 30.0
TraesCS3D01G450200.1 Wheat cytosol 12.2 30.0
Protein Annotations
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PO:PO:0025195PO:PO:0025281ScanProsite:PS01256PFscan:PS50069PANTHER:PTHR11932PANTHER:PTHR11932:SF97
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UniParc:UPI00000A41D2InterPro:WH-like_DNA-bd_sfInterPro:WH_DNA-bd_sfSEG:seg::
Description
CUL1AT4G02570 protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B9DGE3]
Coordinates
chr4:+:1128558..1133697
Molecular Weight (calculated)
86306.7 Da
IEP (calculated)
7.140
GRAVY (calculated)
-0.469
Length
738 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MERKTIDLEQ GWDYMQTGIT KLKRILEGLN EPAFDSEQYM MLYTTIYNMC TQKPPHDYSQ QLYDKYREAF EEYINSTVLP ALREKHDEFM LRELFKRWSN
101: HKVMVRWLSR FFYYLDRYFI ARRSLPPLNE VGLTCFRDLV YNELHSKVKQ AVIALVDKER EGEQIDRALL KNVLDIYVEI GMGQMERYEE DFESFMLQDT
201: SSYYSRKASS WIQEDSCPDY MLKSEECLKK ERERVAHYLH SSSEPKLVEK VQHELLVVFA SQLLEKEHSG CRALLRDDKV DDLSRMYRLY HKILRGLEPV
301: ANIFKQHVTA EGNALVQQAE DTATNQVANT ASVQEQVLIR KVIELHDKYM VYVTECFQNH TLFHKALKEA FEIFCNKTVA GSSSAELLAT FCDNILKKGG
401: SEKLSDEAIE DTLEKVVKLL AYISDKDLFA EFYRKKLARR LLFDRSANDD HERSILTKLK QQCGGQFTSK MEGMVTDLTL ARENQNSFED YLGSNPAANP
501: GIDLTVTVLT TGFWPSYKSF DINLPSEMIK CVEVFKGFYE TKTKHRKLTW IYSLGTCHIN GKFDQKAIEL IVSTYQAAVL LLFNTTDKLS YTEILAQLNL
601: SHEDLVRLLH SLSCAKYKIL LKEPNTKTVS QNDAFEFNSK FTDRMRRIKI PLPPVDERKK VVEDVDKDRR YAIDAAIVRI MKSRKVLGHQ QLVSECVEQL
701: SRMFKPDIKA IKKRMEDLIT RDYLERDKEN PNMFRYLA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.